Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476003
• Subject: XM_006538229.3
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1176
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGAAAGTAGTTAGCAGGAAGCGGAAAGCGCCCGCCTCGCCGGGAGCTGGGAGCGACGCTCAGGGCCC  74
                                                                               |.||   
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------------ATGG---  4

Query   75  GCAGTTTGGCTGGGATCACTCGCTTCACAAAAGGAAAAGACTTCCTCCTGTGAAGAGATCCTTAGTATACTACT  148
              ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||.||||.||||||.
Sbjct    5  --AGTTTGGCTGGGATCATTCGCTGCACAAAAGGAAAAGACTCCCCCCAGTGAAGAGATCCCTAGTGTACTACC  76

Query  149  TGAAGAACCGGGAAGTCAGGCTACAGAATGAAACCAGCTACTCTCGAGTGTTGCATGGTTATGCAGCACAGCAA  222
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct   77  TGAAGAACCGCGAAGTCAGGCTCCAGAATGAGACCAGCTACTCTCGCCTGTTACATGGTTATGCAGCACAACAG  150

Query  223  CTTCCCAGTCTCCTGAAGGAGAGAGAGTTTCACCTTGGGACCCTTAATAAAGTGTTTGCATCTCAGTGGTTGAA  296
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  151  CTTCCCAGTCTCCTCAAGGAGAGAGAATTTCACCTCGGGACCCTTAATAAAGTGTTTGCTTCTCAGTGGTTGAA  224

Query  297  TCATAGGCAAGTGGTGTGTGGCACAAAATGCAACACGCTATTTGTCGTAGATGTCCAGACAAGCCAGATCACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  225  TCATAGGCAAGTGGTGTGTGGCACGAAATGCAACACACTCTTTGTCGTGGATGTCCAGACAGGCCAGATCACCA  298

Query  371  AGATCCCCATTCTGAAAGACCAGGAGCCTGGAGGTGTGACCCAGCAGGGCTGTGGTATCCATGCCATCGAGCTG  444
            ||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  299  AGATTCCCATTCTGAAAGACCGGGAACCTGGAGGTGTGACTCAGCAGGGCTGTGGTATCCATGCAATTGAACTG  372

Query  445  AATCCTTCTAGAACACTGCTAGCCACTGGAGGAGACAACCCCAACAGTCTTGCCATCTATCGACTACCTACGCT  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||..|
Sbjct  373  AATCCTTCTAGAACACTCCTAGCCACTGGAGGAGACAACCCTAACAGTCTTGCCATCTACCGCCTGCCTACCTT  446

Query  519  GGATCCTGTGTGTGTAGGAGATGATGGACACAAGGACTGGATCTTTTCCATCGCATGGATCAGCGACACTATGG  592
            .||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||.|||.|||||||
Sbjct  447  AGATCCTGTGTGTGTGGGTGATGATGGACACAAGGATTGGATCTTTTCTATTGCGTGGATCAACGATACTATGG  520

Query  593  CAGTGTCTGGCTCACGTGATGGTTCTATGGGACTCTGGGAGGTGACAGATGATGTTTTGACCAAAAGTGATGCG  666
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  521  CAGTGTCTGGCTCACGGGATGGGTCTATGGGACTCTGGGAGGTGACAGATGATGTGTTGACCAAAAGTGATGCA  594

Query  667  AGACACAATGTGTCACGGGTCCCTGTGTATGCACACATCACTCACAAGGCCTTAAAGGACATCCCCAAAGAAGA  740
            |||||.||.|||||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  595  AGACATAACGTGTCACCAGTCCCTGTGTATGCTCACATCACTCACAAGGCCTTAAAGGATATCCCCAAGGAGGA  668

Query  741  CACAAACCCTGACAACTGCAAGGTTCGGGCTCTGGCCTTCAACAACAAGAACAAGGAACTGGGAGCAGTGTCTC  814
            .||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.||.|
Sbjct  669  TACAAACCCGGACAACTGCAAGGTGCGGGCTTTAGCCTTCAACAACAAGAACAAGGAGTTGGGAGCGGTATCAC  742

Query  815  TGGATGGCTACTTTCATCTCTGGAAGGCTGAAAATACACTATCTAAGCTCCTCTCCACCAAACTGCCATATTGC  888
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.
Sbjct  743  TAGATGGCTACTTTCATCTCTGGAAGGCTGAAAATACCTTGTCTAAGCTCCTTTCCACCAAATTGCCATATTGT  816

Query  889  CGTGAGAATGTGTGTCTGGCTTATGGTAGTGAATGGTCAGTTTATGCAGTGGGCTCCCAAGCTCATGTCTCCTT  962
            ||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  817  CGAGAAAACGTGTGTCTGGCCTATGGTAGTGAGTGGTCAGTGTATGCAGTGGGCTCTCAAGCGCATGTCTCCTT  890

Query  963  CTTGGATCCACGGCAGCCATCATACAACGTCAAGTCTGTCTGTTCCAGGGAGCGAGGCAGTGGAATCCGGTCAG  1036
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct  891  CTTGGATCCACGGCAGCCATCGTACAACGTCAAGTCTGTCTGCTCCAGGGAACGAGGCAGTGGGATTCGATCAG  964

Query 1037  TGAGTTTCTACGAGCACATCATCACTGTGGGAACAGGGCAGGGCTCCCTGCTGTTCTATGACATCCGAGCTCAG  1110
            ||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  965  TGAGCTTCTATGAACACATTATCACTGTGGGCACAGGGCAGGGCTCCCTGCTGTTCTATGACATCCGAGCTCAA  1038

Query 1111  AGATTTCTGGAAGAGAGGCTCTCAGCTTGTTATGGGTCCAAGCCCAGACTAGCAGGGGAGAATCTGAAACTAAC  1184
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  AGATTTTTGGAAGAGAGGCTCTCAGCTTGTTATGGGTCCAAGCCCAGACTCGCAGGGGAGAATCTGAAACTAAC  1112

Query 1185  CACTGGCAAAGGCTGGCTGAATCATGATGAAACCTGGAGGAATTACTTTTCAGACATTGACTTCTTCCCCAATG  1258
            .|||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  TACTGGCAGGGGCTGGCTGAATCATGATGAAACCTGGAGGAATTACTTTTCGGACATTGACTTCTTCCCCAATG  1186

Query 1259  CTGTTTACACCCACTGCTACGACTCGTCTGGAACGAAACTCTTTGTGGCAGGAGGTCCCCTCCCTTCAGGGCTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1187  CTGTTTACACCCACTGCTACGACTCGTCCGGAACGAAACTCTTTGTGGCAGGGGGCCCCCTCCCTTCTGGGCTC  1260

Query 1333  CATGGAAACTATGCTGGGCTCTGGAGT  1359
            ||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1261  CACGGAAACTATGCTGGACTGTGGAGT  1287