Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476017
- Subject:
- NM_010662.2
- Aligned Length:
- 1382
- Identities:
- 1143
- Gaps:
- 79
Alignment
Query 1 ATGAGCCTCCGCCTGCAGAGCTCCTC--TGCCAGCTATGGAGGTGGTTTCGGGGGTGGCTCTTGCCAGCTGGGA 72
||||||..||||.|.|||||.||||| || ||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||.|||
Sbjct 1 ATGAGCTGCCGCTTCCAGAGTTCCTCCATG--AGCTATGGAGGTGGTTTCGGAGCTGGTTCTTGCCAGCTTGGA 72
Query 73 GGAGGCCGTGGTGTCTCTACCTGTTCAACTCGGTTTGTGTCTGGGGGATCAGCTGGGGGCTATGGAGGCGGCGT 146
|||||||||..|.||||..||||.|||.||||||||||..||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 73 GGAGGCCGTAATATCTCCTCCTGCTCATCTCGGTTTGTCACTGGAGGGTCAGCTGGAGGCTATGGAGGGGGCAT 146
Query 147 GAGCTGTGGTTTTGGTGGAGGGGCTGGTAGTGGCTTTGGAGGTGGCTATGGAGGTGGCCTTGGAGGTGGCTATG 220
|||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 147 GAGCTGTGGCTTTGGTGGAGGAGCTGGTGGTGGCTTTGGAGGTGGCTTTGGAGGTGGCTTTGGAGGTAGCTA-- 218
Query 221 GAGGTGGCCTTGGAGGTGGCTTTGGTGGGGGTTTTGCTGGTGGCTTTGTTGACTTTGGTGCTTGT-GATGGCGG 293
|||.||.|||||||..||||||||||.||||||.||.| .||| |||||.||
Sbjct 219 ----------------------TGGCGGAGGTTTTGGCGGTGGCTTTGGTGACTTCGGAG-GTGTCGATGGTGG 269
Query 294 CCTCCTCACTGGCAATGAGAAGATCACCATGCAGAACCTCAACGACCGCCTGGCTTCCTACCTGGAGAAGGTGC 367
|||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||...|||||||||.|||||||
Sbjct 270 CCTCCTCTCTGGCAACGAGAAGATCACCATGCAGAACCTCAATGACCGCCTGGCCAGCTACCTGGATAAGGTGC 343
Query 368 GCGCCCTGGAGGAGGCCAACGCTGACCTGGAGGTGAAGATCCGTGACTGGCACCTGAAGCAGAGCCCAGCTAGC 441
|||||.||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 344 GCGCCTTGGAGGCAGCCAATGCCGACCTGGAGGTGAAGATTCGTGACTGGCATCTGAAACAGAGCCCAGCTAGT 417
Query 442 CCTGAGCGGGACTACAGCCCCTACTACAAGACCATTGAAGAGCTCCGGGACAAGATCCTGACCGCCACCATTGA 515
||.||||||||||||||..|.||.||.||||||||.||.|||||||||..||||||.|||...|||||||..||
Sbjct 418 CCAGAGCGGGACTACAGTGCTTATTATAAGACCATCGAGGAGCTCCGGATCAAGATTCTGGAAGCCACCACGGA 491
Query 516 AAACAACCGGGTCATCCTGGAGATTGACAATGCCAGGCTGGCTGTGGACGACTTCAGGCTCAAGTATGAGAATG 589
.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 492 CAACAACCGGATCATCCTGGAGATTGACAATGCCAGGCTGGCTGCAGATGACTTCAGGCTCAAGTACGAAAATG 565
Query 590 AGCTGGCCCTGCGCCAGAGCGTGGAGGCCGACATCAACGGCCTGCGCCGGGTGCTGGATGAGCTCACTCTGTCT 663
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 566 AGCTGACCTTGCGCCAGAGCGTGGAGGCCGACATCAACGGCCTGCGCAGGGTGCTGGATGAGCTGACTCTGGCT 639
Query 664 AAGACTGACCTGGAGATGCAGATCGAGAGCCTGAATGAAGAGCTAGCCTACATGAAGAAGAACCATGAAGAGGA 737
||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct 640 AAGACTGACCTGGAAATGCAGATTGAGAGCCTGAATGAAGAACTGGCTTACCTGAAGAAGAACCACGAAGAGGA 713
Query 738 GATGAAGGAATTTAGCAACCAGGTGGTCGGCCAGGTCAACGTGGAGATGGATGCCACCCCAGGCATTGACCTGA 811
||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 714 GATGAAGGAATTCAGCAACCAGGTAGTAGGCCAGGTCAATGTGGAGATGGACGCCACCCCTGGCATTGATCTGA 787
Query 812 CCCGCGTGCTGGCAGAGATGAGGGAGCAGTACGAGGCCATGGCAGAGAGGAACCGCCGGGATGCTGAGGAATGG 885
||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||.|||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 788 CCCGTGTGCTGGCTGAGATGAGGGAGCAGTATGAAGCCCTGGCAGAGAAGAATCGGAGGGATGCTGAGGAATGG 861
Query 886 TTCCACGCCAAGAGTGCAGAGCTGAACAAGGAGGTGTCTACCAACACTGCCATGATTCAGACCAGCAAGACAGA 959
|||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||.|||..|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 862 TTCCAGACCAAGAGTGCAGAGCTGAACAAGGAAGTATCCTCCAACGCTGAAATGATCCAGACCAGCAAGACAGA 935
Query 960 GATCACGGAGCTCAGGCGCACGCTCCAAGGCCTGGAGATTGAGCTGCAGTCCCAGCTGAGCATGAAAGCGGGGC 1033
||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 936 GATCACAGAACTCAGGCGCACACTCCAGGGCCTGGAGATTGAGCTGCAGTCCCAGCTGAGCATGAAAGCCGGCC 1009
Query 1034 TGGAGAACACGGTGGCAGAGACGGAGTGCCGCTATGCCCTGCAGCTGCAGCAGATCCAGGGACTCATCAGCAGC 1107
||||.|..|||.||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1010 TGGAAAGTACGTTGGCAGAGACAGAGTGCCGCTACGCCCTGCAGCTGCAACAGATCCAGGGGCTCATCAGCAGC 1083
Query 1108 ATCGAGGCCCAGCTGAGCGAGCTCCGCAGTGAGATGGAGTGCCAGAACCAAGAGTACAAGATGCTGCTGGACAT 1181
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 1084 ATCGAGGCTCAGCTGAGCGAGCTCCGAAGTGAGATGGAGTGCCAGAACCAGGAATACAAGATGCTGTTGGACAT 1157
Query 1182 CAAGACACGTCTGGAGCAGGAGATCGCCACCTACCGCAGCCTGCTCGAGGGCCAGGACGCCAAGATGATTGGTT 1255
|||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||..||
Sbjct 1158 CAAAACAAGGCTGGAACAGGAGATCGCCACCTACCGCAGCCTGCTAGAGGGCCAGGATGCTAAGATGACCGG-- 1229
Query 1256 TCCCTTC--CTCAGCAGGAAGCGTCAGCCCCCGTAGCACCTCTGTTACCACGACTTCTA---GTGCCTCTGTTA 1324
|||| |||.|.||||| .||.||| |||.|| ||.|.| ||
Sbjct 1230 ---CTTCAACTCCGGAGGAA------------ATAACAC------TACTAC--CTCCAACGGGT---------- 1270
Query 1325 CCACCACCTCTAATGCCTCTGGTCGCCGCACTTCTGATGTCCGTAGGCCT 1374
||.||.||||.||| ||.||||||| |.|||.||||.|.|..|
Sbjct 1271 CCCCCTCCTCCAAT---TCCGGTCGCC------CAGATTTCCGAAAGTAT 1311