Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000476017
Subject:
NM_010662.2
Aligned Length:
1382
Identities:
1143
Gaps:
79

Alignment

Query    1  ATGAGCCTCCGCCTGCAGAGCTCCTC--TGCCAGCTATGGAGGTGGTTTCGGGGGTGGCTCTTGCCAGCTGGGA  72
            ||||||..||||.|.|||||.|||||  ||  ||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||.|||
Sbjct    1  ATGAGCTGCCGCTTCCAGAGTTCCTCCATG--AGCTATGGAGGTGGTTTCGGAGCTGGTTCTTGCCAGCTTGGA  72

Query   73  GGAGGCCGTGGTGTCTCTACCTGTTCAACTCGGTTTGTGTCTGGGGGATCAGCTGGGGGCTATGGAGGCGGCGT  146
            |||||||||..|.||||..||||.|||.||||||||||..||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct   73  GGAGGCCGTAATATCTCCTCCTGCTCATCTCGGTTTGTCACTGGAGGGTCAGCTGGAGGCTATGGAGGGGGCAT  146

Query  147  GAGCTGTGGTTTTGGTGGAGGGGCTGGTAGTGGCTTTGGAGGTGGCTATGGAGGTGGCCTTGGAGGTGGCTATG  220
            |||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||  
Sbjct  147  GAGCTGTGGCTTTGGTGGAGGAGCTGGTGGTGGCTTTGGAGGTGGCTTTGGAGGTGGCTTTGGAGGTAGCTA--  218

Query  221  GAGGTGGCCTTGGAGGTGGCTTTGGTGGGGGTTTTGCTGGTGGCTTTGTTGACTTTGGTGCTTGT-GATGGCGG  293
                                  |||.||.|||||||..||||||||||.||||||.||.| .||| |||||.||
Sbjct  219  ----------------------TGGCGGAGGTTTTGGCGGTGGCTTTGGTGACTTCGGAG-GTGTCGATGGTGG  269

Query  294  CCTCCTCACTGGCAATGAGAAGATCACCATGCAGAACCTCAACGACCGCCTGGCTTCCTACCTGGAGAAGGTGC  367
            |||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||...|||||||||.|||||||
Sbjct  270  CCTCCTCTCTGGCAACGAGAAGATCACCATGCAGAACCTCAATGACCGCCTGGCCAGCTACCTGGATAAGGTGC  343

Query  368  GCGCCCTGGAGGAGGCCAACGCTGACCTGGAGGTGAAGATCCGTGACTGGCACCTGAAGCAGAGCCCAGCTAGC  441
            |||||.||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  344  GCGCCTTGGAGGCAGCCAATGCCGACCTGGAGGTGAAGATTCGTGACTGGCATCTGAAACAGAGCCCAGCTAGT  417

Query  442  CCTGAGCGGGACTACAGCCCCTACTACAAGACCATTGAAGAGCTCCGGGACAAGATCCTGACCGCCACCATTGA  515
            ||.||||||||||||||..|.||.||.||||||||.||.|||||||||..||||||.|||...|||||||..||
Sbjct  418  CCAGAGCGGGACTACAGTGCTTATTATAAGACCATCGAGGAGCTCCGGATCAAGATTCTGGAAGCCACCACGGA  491

Query  516  AAACAACCGGGTCATCCTGGAGATTGACAATGCCAGGCTGGCTGTGGACGACTTCAGGCTCAAGTATGAGAATG  589
            .|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  492  CAACAACCGGATCATCCTGGAGATTGACAATGCCAGGCTGGCTGCAGATGACTTCAGGCTCAAGTACGAAAATG  565

Query  590  AGCTGGCCCTGCGCCAGAGCGTGGAGGCCGACATCAACGGCCTGCGCCGGGTGCTGGATGAGCTCACTCTGTCT  663
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct  566  AGCTGACCTTGCGCCAGAGCGTGGAGGCCGACATCAACGGCCTGCGCAGGGTGCTGGATGAGCTGACTCTGGCT  639

Query  664  AAGACTGACCTGGAGATGCAGATCGAGAGCCTGAATGAAGAGCTAGCCTACATGAAGAAGAACCATGAAGAGGA  737
            ||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct  640  AAGACTGACCTGGAAATGCAGATTGAGAGCCTGAATGAAGAACTGGCTTACCTGAAGAAGAACCACGAAGAGGA  713

Query  738  GATGAAGGAATTTAGCAACCAGGTGGTCGGCCAGGTCAACGTGGAGATGGATGCCACCCCAGGCATTGACCTGA  811
            ||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  714  GATGAAGGAATTCAGCAACCAGGTAGTAGGCCAGGTCAATGTGGAGATGGACGCCACCCCTGGCATTGATCTGA  787

Query  812  CCCGCGTGCTGGCAGAGATGAGGGAGCAGTACGAGGCCATGGCAGAGAGGAACCGCCGGGATGCTGAGGAATGG  885
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||.|||.||..|||||||||||||||||
Sbjct  788  CCCGTGTGCTGGCTGAGATGAGGGAGCAGTATGAAGCCCTGGCAGAGAAGAATCGGAGGGATGCTGAGGAATGG  861

Query  886  TTCCACGCCAAGAGTGCAGAGCTGAACAAGGAGGTGTCTACCAACACTGCCATGATTCAGACCAGCAAGACAGA  959
            |||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||.|||..|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  862  TTCCAGACCAAGAGTGCAGAGCTGAACAAGGAAGTATCCTCCAACGCTGAAATGATCCAGACCAGCAAGACAGA  935

Query  960  GATCACGGAGCTCAGGCGCACGCTCCAAGGCCTGGAGATTGAGCTGCAGTCCCAGCTGAGCATGAAAGCGGGGC  1033
            ||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  936  GATCACAGAACTCAGGCGCACACTCCAGGGCCTGGAGATTGAGCTGCAGTCCCAGCTGAGCATGAAAGCCGGCC  1009

Query 1034  TGGAGAACACGGTGGCAGAGACGGAGTGCCGCTATGCCCTGCAGCTGCAGCAGATCCAGGGACTCATCAGCAGC  1107
            ||||.|..|||.||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1010  TGGAAAGTACGTTGGCAGAGACAGAGTGCCGCTACGCCCTGCAGCTGCAACAGATCCAGGGGCTCATCAGCAGC  1083

Query 1108  ATCGAGGCCCAGCTGAGCGAGCTCCGCAGTGAGATGGAGTGCCAGAACCAAGAGTACAAGATGCTGCTGGACAT  1181
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 1084  ATCGAGGCTCAGCTGAGCGAGCTCCGAAGTGAGATGGAGTGCCAGAACCAGGAATACAAGATGCTGTTGGACAT  1157

Query 1182  CAAGACACGTCTGGAGCAGGAGATCGCCACCTACCGCAGCCTGCTCGAGGGCCAGGACGCCAAGATGATTGGTT  1255
            |||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||..||  
Sbjct 1158  CAAAACAAGGCTGGAACAGGAGATCGCCACCTACCGCAGCCTGCTAGAGGGCCAGGATGCTAAGATGACCGG--  1229

Query 1256  TCCCTTC--CTCAGCAGGAAGCGTCAGCCCCCGTAGCACCTCTGTTACCACGACTTCTA---GTGCCTCTGTTA  1324
               ||||  |||.|.|||||            .||.|||      |||.||  ||.|.|   ||          
Sbjct 1230  ---CTTCAACTCCGGAGGAA------------ATAACAC------TACTAC--CTCCAACGGGT----------  1270

Query 1325  CCACCACCTCTAATGCCTCTGGTCGCCGCACTTCTGATGTCCGTAGGCCT  1374
            ||.||.||||.|||   ||.|||||||      |.|||.||||.|.|..|
Sbjct 1271  CCCCCTCCTCCAAT---TCCGGTCGCC------CAGATTTCCGAAAGTAT  1311