Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476109
• Subject: NM_029441.3
• Aligned Length: 1526
• Identities: 1303
• Gaps: 25

Alignment

Query    1  ATGGCTTCTGGGGACCTTTACGAGGTTGAAAGGATTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAGTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCTTCTGGGGACCTTTACGAGGTTGAAAGGATTGTGGACAAGAGGAAGAACAAGAAGGGGAAATGGGAATA  74

Query   75  TCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAGGACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct   75  TCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGCAGCACGGAGGACACGTGGGAACCGGAGCATCACCTCCTGCACTGTGAGG  148

Query  149  AGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTCCAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTACC  222
            |||||||.||.||.|||||.|||.|.|||.||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||.||.|..||
Sbjct  149  AGTTTATCGACGAGTTCAACGGGCTCCACTTGTCCAAGGATAAGAGGGTGAAGTCAGGGAAGCAGGCCGGAGCC  222

Query  223  TCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGGTTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAGAG  296
            ||||||||.||.||.|||...||.||||.|.|.||.||.|.|||.|||||..|.|||...||.||.||.|||||
Sbjct  223  TCCAAGCTCCTCCGCGACGCCCGCGGCCTGCCAGTGGAAAGACTCTCCCATCGGCCTCTGGAACCCGGGAAGAG  296

Query  297  CAAGGGGACC----TCCCATAAACGGAAGCGAATTAACCCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGC  366
            |||    |||    |||||.||.||||||||..|.|||.||||||||.|||.|||.||.||.||||.|||.||.
Sbjct  297  CAA----ACCATCTTCCCACAAGCGGAAGCGCGTCAACTCTCCCCTGTCCAGGCCCAAGAAGGGGTCTTCGGGT  366

Query  367  AAGCCCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGTGTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAAT  440
            |||   .||.||      |||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  367  AAG---GCTCCA------GACAGGGCCACCAAGACTGTGTCCTATAGGACTACCCCCAGTGGCTTACAGATCAT  431

Query  441  GCCCCTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGGACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAA  514
            |||||||||.|||.||||||||||..||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||...||||||||||
Sbjct  432  GCCCCTGAAGAAGGCTCAGAACGGCCTGGAGAACGGAGATGCCGGCTCTGAGAAGGACGAGTCACACTTTGGAA  505

Query  515  ATGGGTCCCATCAGCCTGGCT-TGGATTTGAATGATCATGTTGGAGAGCAAGATATGG---GTGAATGTGACGT  584
            |.|||||||||||||| ||.| ||||.|||||.||.||..||||||||||.||   ||   ||||.||.||||.
Sbjct  506  ACGGGTCCCATCAGCC-GGATCTGGAGTTGAACGACCAGCTTGGAGAGCAGGA---GGCCAGTGACTGCGACGG  575

Query  585  GAATCACGCTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCTGACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAG  658
            ||..|||.|..|.||||.||||||.||..|.|||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.|
Sbjct  576  GACCCACTCCGCGCTGGTGGAGAATGGAGTTGGCTCTGCTCTGACCAATGGAGGCCTGAACCTGCACAGCCCTG  649

Query  659  TGAAGAGGAAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACAAAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAA  732
            ||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  650  TGAAGAGGAAGCTGGAGACGGAGAAGGACTATGTCTTTGACAAAAGGCTCAGGTACAGCGTCCGCCAGAATGAA  723

Query  733  AGCAACTGTCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAAGGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGAC  806
            |||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  724  AGCAACTGTCGGTTTCGTGACATCGTGGTGAGGAAGGAAGAGGGCTTCACACACATTCTTCTGTCCAGCCAGAC  797

Query  807  CTCGGATAACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGTCCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACG  880
            .||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  798  TTCGGATAACAATGCACTGACTCCTGAGATCATGAAGGAAGTCCGGCGAGCCCTGTGCAACGCGGCCACAGATG  871

Query  881  ACAGCAAACTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCTGCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGC  954
            |||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  872  ACAGCAAGCTACTGCTGCTCAGTGCCGTGGGCAGTGTGTTCTGCAGCGGACTAGACTATTCCTACCTGATCGGC  945

Query  955  CGGTTGTCCAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCAGAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTAT  1028
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  946  CGGCTGTCCAGCGACCGGAGAAAGGAGAGCACTCGAATCGCAGAAGCTATCAGGGACTTCGTGAAGGCCTTTAT  1019

Query 1029  CCAGTTTAAGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGCCCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCT  1102
            ||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1020  CCAGTTTAAGAAACCCATCGTGGTAGCCATTAATGGGCCAGCATTGGGCCTGGGAGCCTCCATCCTGCCCCTCT  1093

Query 1103  GTGACATCGTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGCCCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGC  1176
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1094  GTGACATCGTATGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTTCAGACACCATACGCTACCATCCGACTCACGCCTGCTGGC  1167

Query 1177  TGCTCCTCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTGGCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCT  1250
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1168  TGTTCCTCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGTGTGGCGCTGGCCAATGAAATGCTGTTTTGTGGGCGGAAACT  1241

Query 1251  CACCGCCCAGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGTCTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCA  1324
            |||.|||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1242  CACTGCCCAAGAGGCATGCAGCCGGGGCCTTGTGTCACAGGTCTTCTGGCCCACGACTTTCAGCCAAGAGGTCA  1315

Query 1325  TGCTGCGGGTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGTTAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTC  1398
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1316  TGCTGCGGGTGAAGGAGATGGCATCTTGCAGTGCTGTGGTTTTGGAGGAGTCCAAATGCCTGGTCCGAAGCTTC  1389

Query 1399  CTGAAATCAGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTCATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGG  1472
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1390  CTGAAGTCAGTGCTGGAGGAGGTGAACGAGAAGGAGTGCGTCATGCTGAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAGGG  1463

Query 1473  CCTTGACTCCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGAAGTC  1518
            |||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1464  CCTGGACTCCCTGTTCAGCTATCTGCAGGACAAAATCTATGAAGTC  1509