Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476145
- Subject:
- XM_017010829.1
- Aligned Length:
- 2838
- Identities:
- 2619
- Gaps:
- 219
Alignment
Query 1 ATGGAGAGCTTCCACACCAGATTTAGTGCCTGGACACCTTTTAGCAACAAGTCATTAAATAGACAGCTCTTTCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAGCTTCCACACCAGATTTAGTGCCTGGACACCTTTTAGCAACAAGTCATTAAATAGACAGCTCTTTCA 74
Query 75 GGAAAGAGTGGCTCTTATAAGTCATTGGTTTGACCTCTGGACTAACAAGCAACGTCAAGAATTCTTATTCGCAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAAAGAGTGGCTCTTATAAGTCATTGGTTTGACCTCTGGACTAACAAGCAACGTCAAGAATTCTTATTCGCAA 148
Query 149 TTTTTTTAAGATGCACTAAATCACAATTAAGGTTTGTCCAAGACTGGTTTTCAGAAAGGATGCAAGTGGCCAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTTTTTTAAGATGCACTAAATCACAATTAAGGTTTGTCCAAGACTGGTTTTCAGAAAGGATGCAAGTGGCCAAA 222
Query 223 GTGGACTTCTCTACAGTGTTACCACGCTTCATTTCTCTATATATCTTTTCCTTTTTGAGTCCGAAAGATTTGTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGGACTTCTCTACAGTGTTACCACGCTTCATTTCTCTATATATCTTTTCCTTTTTGAGTCCGAAAGATTTGTG 296
Query 297 TGCCGCTGCCCAAGTCAGCTGGCCCTGGAAGTTTTTAACTGAACAGGATTGCTTATGGATGCCCAAATGCGTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCCGCTGCCCAAGTCAGCTGGCCCTGGAAGTTTTTAACTGAACAGGATTGCTTATGGATGCCCAAATGCGTTA 370
Query 371 AGTTCGGATGGTTTCTGCCCTATACTCCAACAGATAATGAGTATGGTGCTTGGAAGCGCCATTACATTGCTTGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTTCGGATGGTTTCTGCCCTATACTCCAACAGATAATGAGTATGGTGCTTGGAAGCGCCATTACATTGCTTGT 444
Query 445 GTGTCCCACTTAGACTGGCTGACACCTAGGGAGGCTGCTGCTACTTATGGGACGCTGAATGAACCCAAAACAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGTCCCACTTAGACTGGCTGACACCTAGGGAGGCTGCTGCTACTTATGGGACGCTGAATGAACCCAAAACAGA 518
Query 519 AGATGAGGAACTACTGGAGAGACAAAGAGAAAAGTGCCTGAGGAAAAGAATTTGGGAGAAAATTGCACTACGTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGATGAGGAACTACTGGAGAGACAAAGAGAAAAGTGCCTGAGGAAAAGAATTTGGGAGAAAATTGCACTACGTA 592
Query 593 AGAAGGAGTTATTCAAAGTTCGACCCCCTTGGGTGAGTGGAACTTGCTGCTCTAGCGTGCTAAAGCCCAGATGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAAGGAGTTATTCAAAGTTCGACCCCCTTGGGTGAGTGGAACTTGCTGCTCTAGCGTGCTAAAGCCCAGATGC 666
Query 667 CAACCACGCCTCTCCCAGACTGTAAGGGAGCGAGTGGGATTACATGAAGCTTTGGAGAAACAGCTTGTTTTGAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAACCACGCCTCTCCCAGACTGTAAGGGAGCGAGTGGGATTACATGAAGCTTTGGAGAAACAGCTTGTTTTGAC 740
Query 741 ATCGTTAGAAACCTTGCCCAAGCGAAGCAATATTTCTGGAAGCCATTCCTACCCTTTATTATCAAAGAAAAATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATCGTTAGAAACCTTGCCCAAGCGAAGCAATATTTCTGGAAGCCATTCCTACCCTTTATTATCAAAGAAAAATT 814
Query 815 GGCATGGAGTTCATAAAAATGATGACAGATCTTCATATGCTCTCCGGCCACACTTCATGTTAATATCATCCCGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCATGGAGTTCATAAAAATGATGACAGATCTTCATATGCTCTCCGGCCACACTTCATGTTAATATCATCCCGG 888
Query 889 ATTCCTGCGTATGAGATGGTGATGGAGAGTGTGAAGGCTGGTGTTGTTTCTGTGGTATATGAACACAGCGTAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTCCTGCGTATGAGATGGTGATGGAGAGTGTGAAGGCTGGTGTTGTTTCTGTGGTATATGAACACAGCGTAAC 962
Query 963 CTTGGAAAGCCTTCTGTATCTTATAGAAAAAGCTCTGGATGGGCAGAAGGCACAGAGCATCGGAATATTTAGCG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTTGGAAAGCCTTCTGTATCTTATAGAAAAAGCTCTGGATGGGCAGAAGGCACAGAGCATCGGAATATTTAGCG 1036
Query 1037 ATGGAGACAGCAGAGAAATCAATTTACTCCAAGGCTATAAAATTGGTGTTAAAAATTTACTGAGGCCTGAAGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGGAGACAGCAGAGAAATCAATTTACTCCAAGGCTATAAAATTGGTGTTAAAAATTTACTGAGGCCTGAAGTG 1110
Query 1111 AGAGATTTCTGGGAGAAATTAGGAAGCTATGTGGCCACTGAAGAAGAAGGGGGTCACGTGGACTTCTTCGTGCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGAGATTTCTGGGAGAAATTAGGAAGCTATGTGGCCACTGAAGAAGAAGGGGGTCACGTGGACTTCTTCGTGCC 1184
Query 1185 CCTTGGAGCATCAGAGGCAGGAATTGAAGTTCTTTCCCAGCTGTCTCAACTAACTGGCACGTTCTTTACGGCCC 1258
||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTTGGAGCATCAG------------------------------------------------------------ 1198
Query 1259 CCACTGGGATTGCAACTGGCTCTTACCAGCACATTCTTAGTGATTGGCTGGGATCCCAATGGGGAAAGGCCCCC 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 ---------------------------------TTCTTAGTGATTGGCTGGGATCCCAATGGGGAAAGGCCCCC 1239
Query 1333 TCTTCCATCTACTTCTGCGAATCGAAGCTACAGACGTGGTCCAGCTTCACAGACTTCCTAGAAGAAACCTTGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 TCTTCCATCTACTTCTGCGAATCGAAGCTACAGACGTGGTCCAGCTTCACAGACTTCCTAGAAGAAACCTTGAA 1313
Query 1407 AACAGTAAGGAAGCAGCTGTATCCTTTCTTCAAGGAACTGCAGAAGAGCATCAGTGGCAGGATGATAGGGCAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 AACAGTAAGGAAGCAGCTGTATCCTTTCTTCAAGGAACTGCAGAAGAGCATCAGTGGCAGGATGATAGGGCAGT 1387
Query 1481 TTATGTTTGACACCATGGGTATGACCAACATTCTAAACAACCAAGATACTGCGCAAGCTCTGGCAGATGGATTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 TTATGTTTGACACCATGGGTATGACCAACATTCTAAACAACCAAGATACTGCGCAAGCTCTGGCAGATGGATTG 1461
Query 1555 ATGGAGTTGTCAAAAGAAGATTCT-------------------------------------------------- 1578
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462 ATGGAGTTGTCAAAAGAAGATTCTGACAAACCTCTGGAATTTTTGTCGTATTTTCTGCTGAAGAAATGTGGCAA 1535
Query 1579 -------------------------------------------------------------------------- 1578
Sbjct 1536 AAAGATCAAAGATGTTGAAGGAAATGTTATTCCAACAAAATGTGACCCAAAGACAACATTCAGTTTATTCATGA 1609
Query 1579 --GAAAGAAATGTTGTAGAAGACAATTCTTGGGACACAAAGTCCAGGCTCAGCAAAAATGATTTAAATTTTGAA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610 AGGAAAGAAATGTTGTAGAAGACAATTCTTGGGACACAAAGTCCAGGCTCAGCAAAAATGATTTAAATTTTGAA 1683
Query 1651 GCACTGATTAATCTGGAGAGAATACTCCAGAAGGACTCAGCAGAAAAGCGAGCTAGAGTTGTCAGAGAACTCTT 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684 GCACTGATTAATCTGGAGAGAATACTCCAGAAGGACTCAGCAGAAAAGCGAGCTAGAGTTGTCAGAGAACTCTT 1757
Query 1725 ACAGAGTGAGAGAAAATACGTGCAGATACTGGAAATTGTGAGAGATGTTTATGTCGCACCACTGAAAGCAGCAT 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 ACAGAGTGAGAGAAAATACGTGCAGATACTGGAAATTGTGAGAGATGTTTATGTCGCACCACTGAAAGCAGCAT 1831
Query 1799 TGTCATCAAACAGAGCGATTCTGAGTGCTGCCAATATCCAGATCATTTTCTGTGACATTCTACAGATTTTAAGT 1872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 TGTCATCAAACAGAGCGATTCTGAGTGCTGCCAATATCCAGATCATTTTCTGTGACATTCTACAGATTTTAAGT 1905
Query 1873 CTCAACAGGCAGTTTCTAGATAACCTGAGAGACAGACTGCAGGAATGGGGCCCAGCTCACTGTGTGGGAGAAAT 1946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906 CTCAACAGGCAGTTTCTAGATAACCTGAGAGACAGACTGCAGGAATGGGGCCCAGCTCACTGTGTGGGAGAAAT 1979
Query 1947 AGTCACGAAGTTTGGAAGCCAGTTAAACACATATACCAATTTCTTCAACAATTACCCTGTCATTCTGAAAACTA 2020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 AGTCACGAAGTTTGGAAGCCAGTTAAACACATATACCAATTTCTTCAACAATTACCCTGTCATTCTGAAAACTA 2053
Query 2021 TTGAGAAGTGCAGAGAAATGATACCAGCATTCCGAACTTTCCTGAAGAGGCATGATAAGACCATTGTTACCAAA 2094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054 TTGAGAAGTGCAGAGAAATGATACCAGCATTCCGAACTTTCCTGAAGAGGCATGATAAGACCATTGTTACCAAA 2127
Query 2095 ATGCTGAGCCTGCCAGAGCTGCTGCTGTACCCATCCCGAAGATTTGAAGAATACCTTAATCTTCTCTACGCTGT 2168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128 ATGCTGAGCCTGCCAGAGCTGCTGCTGTACCCATCCCGAAGATTTGAAGAATACCTTAATCTTCTCTACGCTGT 2201
Query 2169 CAGGCTTCATACCCCTGCAGAGCATGTTGACCGTGGGGACTTGACCACTGCAATTGACCAAATCAAAAAATATA 2242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 CAGGCTTCATACCCCTGCAGAGCATGTTGACCGTGGGGACTTGACCACTGCAATTGACCAAATCAAAAAATATA 2275
Query 2243 AAGGTTATATAGATCAGATGAAGCAAAACATCACTATGAAGGATCATCTGTCAGATATACAGAGAATCATCTGG 2316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 AAGGTTATATAGATCAGATGAAGCAAAACATCACTATGAAGGATCATCTGTCAGATATACAGAGAATCATCTGG 2349
Query 2317 GGATGCCCTACTCTATCAGAAGTAAACAGATATCTGATTAGGGTACAAGATGTAGCCCAACTTCATTGCTGTGA 2390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2350 GGATGCCCTACTCTATCAGAAGTAAACAGATATCTGATTAGGGTACAAGATGTAGCCCAACTTCATTGCTGTGA 2423
Query 2391 TGAAGAAATAAGTTTCTCTTTAAGGCTCTATGAACACATCCATGATCTCAGCCTTTTCCTCTTCAATGATGCCC 2464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2424 TGAAGAAATAAGTTTCTCTTTAAGGCTCTATGAACACATCCATGATCTCAGCCTTTTCCTCTTCAATGATGCCC 2497
Query 2465 TGCTCGTTTCTAGTCGGGGCACATCTCACACTCCATTTGAGAGGACTTCAAAAACAACCTACCAGTTCATTGCA 2538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498 TGCTCGTTTCTAGTCGGGGCACATCTCACACTCCATTTGAGAGGACTTCAAAAACAACCTACCAGTTCATTGCA 2571
Query 2539 TCAGTGGCCCTTCATCGGTTACTCATAGAAAATATTCCAGATTCCAAGTATGTCAAGAATGCATTTATTCTTCA 2612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 TCAGTGGCCCTTCATCGGTTACTCATAGAAAATATTCCAGATTCCAAGTATGTCAAGAATGCATTTATTCTTCA 2645
Query 2613 GGGTCCAAAATATAAATGGATTTGTGCTACAGAAATAGAGGATGATAAGTTCCTATGGCTGTCAGTACTTCGAA 2686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2646 GGGTCCAAAATATAAATGGATTTGTGCTACAGAAATAGAGGATGATAAGTTCCTATGGCTGTCAGTACTTCGAA 2719
Query 2687 ATGCAATCAAAAGCAGTATGGAGAAG 2712
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2720 ATGCAATCAAAAGCAGTATGGAGAAG 2745