Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476231
- Subject:
- NM_006393.2
- Aligned Length:
- 3064
- Identities:
- 2111
- Gaps:
- 938
Alignment
Query 1 ATGAGGGTCCCTGTATTTGAGGATATAAAAGATGAAACTGAAGAAGAAAAGATAGGGGAAGAAGAAAATGAAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGGTCCCTGTATTTGAGGATATAAAAGATGAAACTGAAGAAGAAAAGATAGGGGAAGAAGAAAATGAAGA 74
Query 75 AGACCAGGTCTTCTATAAGCCTGTTATTGAAGACTTAAGCATGGAATTGGCCAGAAAATGCACGGAACTCATTA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGACCAGGTCTTCTATAAGCCTGTTATTGAAGACTTAAGCATGGAATTGGCCAGAAAATGCACGGAACTCATTA 148
Query 149 GCGATATCCGTTATAAAGAAGAGTTTAAAAAGTCCAAGGATAAGTGTACATTTGTGACTGACAGTCCTATGCTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGATATCCGTTATAAAGAAGAGTTTAAAAAGTCCAAGGATAAGTGTACATTTGTGACTGACAGTCCTATGCTA 222
Query 223 AACCATGTAAAAAATATCGGTGCTTTTATTTCTGAGGCAAAATACAAAGGCACCATTAAAGCTGACCTTTCTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACCATGTAAAAAATATCGGTGCTTTTATTTCTGAGGCAAAATACAAAGGCACCATTAAAGCTGACCTTTCTAA 296
Query 297 TTCTCTTTATAAGCGGATGCCAGCCACAATTGACAGTGTTTTTGCAGGAGAAGTTACACAGCTCCAGAGTGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCTCTTTATAAGCGGATGCCAGCCACAATTGACAGTGTTTTTGCAGGAGAAGTTACACAGCTCCAGAGTGAGG 370
Query 371 TGGCCTACAAGCAGAAACATGATGCTGCCAAAGGATTCTCAGATTATGCCCACATGAAGGAGCCCCCTGAGGTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGCCTACAAGCAGAAACATGATGCTGCCAAAGGATTCTCAGATTATGCCCACATGAAGGAGCCCCCTGAGGTT 444
Query 445 AAACATGCCATGGAGGTCAATAAACACCAGAGTAATATTTCTTATAGGAAAGACGTGCAGGACACCCACACGTA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACATGCCATGGAGGTCAATAAACACCAGAGTAATATTTCTTATAGGAAAGACGTGCAGGACACCCACACGTA 518
Query 519 CAGTGCAGAACTTGACCTACCAGACATCAAGATGGCAACCCAGATCTCTAAGATCATAAGCAATGCAGAATACA 592
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTGCAGAACTTGACCGACCAGACATCAAGATGGCAACCCAGATCTCTAAGATCATAAGCAATGCAGAATACA 592
Query 593 AGAAAGGACAAGGAATAATGAATAAAGAGCCCGCTGTAATTGGAAGACCAGATTTTGAACATGCCGTGGAAGCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAAAGGACAAGGAATAATGAATAAAGAGCCCGCTGTAATTGGAAGACCAGATTTTGAACATGCCGTGGAAGCT 666
Query 667 TCTAAACTTTCTAGTCAAATTAAATACAAAGAAAAATTTGATAATGAAATGAAGGATAAGAAACATCATTACAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTAAACTTTCTAGTCAAATTAAATACAAAGAAAAATTTGATAATGAAATGAAGGATAAGAAACATCATTACAA 740
Query 741 TCCTCTTGAAAGTGCTTCTTTTAGGCAGAATCAGCTTGCTGCTACACTGGCGAGCAATGTGAAGTACAAGAAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCTCTTGAAAGTGCTTCTTTTAGGCAGAATCAGCTTGCTGCTACACTGGCGAGCAATGTGAAGTACAAGAAAG 814
Query 815 ACATTCAAAATATGCATGATCCAGTTTCAGATCTCCCAAATTTGTTGTTTTTAGACCATGTTTTGAAAGCCAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACATTCAAAATATGCATGATCCAGTTTCAGATCTCCCAAATTTGTTGTTTTTAGACCATGTTTTGAAAGCCAGC 888
Query 889 AAAATGCTCAGCGGCCGAGAATATAAAAAGCTCTTTGAGGAAAACAAAGGAATGTATCATTTTGATGCAGATGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAATGCTCAGCGGCCGAGAATATAAAAAGCTCTTTGAGGAAAACAAAGGAATGTATCATTTTGATGCAGATGC 962
Query 963 TGTGGAACATCTGCACCATAAAGGCAATGCCGTCCTCCAAAGTCAGGTGAAATATAAAGAAGAATATGAGAAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTGGAACATCTGCACCATAAAGGCAATGCCGTCCTCCAAAGTCAGGTGAAATATAAAGAAGAATATGAGAAAA 1036
Query 1037 ATAAGGGAAAGCCAATGCTTGAATTTGTTGAGACACCATCATATCAAGCTTCAAAGGAGGCTCAAAAGATGCAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATAAGGGAAAGCCAATGCTTGAATTTGTTGAGACACCATCATATCAAGCTTCAAAGGAGGCTCAAAAGATGCAA 1110
Query 1111 AGTGAAAAAGTTTACAAAGAGGATTTTGAGAAGGAGATTAAAGGAAGGTCATCACTGGATTTAGACAAGACTCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGTGAAAAAGTTTACAAAGAGGATTTTGAGAAGGAGATTAAAGGAAGGTCATCACTGGATTTAGACAAGACTCC 1184
Query 1185 AGAATTTTTACATGTAAAGTACATCACCAACCTTCTGAGGGAGAAAGAATATAAAAAAGATTTGGAAAATGAGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGAATTTTTACATGTAAAGTACATCACCAACCTTCTGAGGGAGAAAGAATATAAAAAAGATTTGGAAAATGAGA 1258
Query 1259 TAAAAGGGAAAGGAATGGAACTTAATTCAGAAGTTCTTGATATCCAAAGAGCAAAGCGAGCCTCTGAAATGGCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TAAAAGGGAAAGGAATGGAACTTAATTCAGAAGTTCTTGATATCCAAAGAGCAAAGCGAGCCTCTGAAATGGCA 1332
Query 1333 AGTGAGAAAGAATACAAGAAAGACCTGGAGTCAATAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGCTGGCACTGACACCCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTGAGAAAGAATACAAGAAAGACCTGGAGTCAATAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGCTGGCACTGACACCCT 1406
Query 1407 TGAAATGCAGCATGCCAAGAAGGCTGCAGAGATAGCGAGTGAGAAAGACTATAAAAGAGATCTGGAGACTGAAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAATGCAGCATGCCAAGAAGGCTGCAGAGATAGCGAGTGAGAAAGACTATAAAAGAGATCTGGAGACTGAAA 1480
Query 1481 TTAAAGGGAAAGGGATGCAGGTGAGCACAGACACTCTTGATGTCCAGAGAGCTAAGAAAGCATCCGAGATGGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTAAAGGGAAAGGGATGCAGGTGAGCACAGACACTCTTGATGTCCAGAGAGCTAAGAAAGCATCCGAGATGGCC 1554
Query 1555 AGCCAGAAACAATACAAGAAGGACTTAGAAAATGAAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGTGAGCATGGATATCCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCCAGAAACAATACAAGAAGGACTTAGAAAATGAAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGTGAGCATGGATATCCC 1628
Query 1629 AGATATCCTTCGAGCCAAGAGGACATCTGAAATCTATAGCCAGAGAAAGTATAAAGATGAAGCAGAGAAGATGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGATATCCTTCGAGCCAAGAGGACATCTGAAATCTATAGCCAGAGAAAGTATAAAGATGAAGCAGAGAAGATGC 1702
Query 1703 TTTCTAACTATTCTACCATAGCAGATACTCCTGAAATTCAGAGAATTAAGACAACTCAACAAAACATTAGTGCG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTTCTAACTATTCTACCATAGCAGATACTCCTGAAATTCAGAGAATTAAGACAACTCAACAAAACATTAGTGCG 1776
Query 1777 GTATTTTATAAGAAAGAAGTGGGAGCTGGCACTGCAGTGAAAGATAGCCCAGAGATCGAACGAGTGAAGAAAAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTATTTTATAAGAAAGAAGTGGGAGCTGGCACTGCAGTGAAAGATAGCCCAGAGATCGAACGAGTGAAGAAAAA 1850
Query 1851 TCAGCAGAATATTAGTTCAGTGAAATACAAAGAAGAGATTAAACATGCAACAGCCATTTCTGATCCTCCAGAAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCAGCAGAATATTAGTTCAGTGAAATACAAAGAAGAGATTAAACATGCAACAGCCATTTCTGATCCTCCAGAAC 1924
Query 1925 TAAAGAGAGTTAAAGAAAACCAGAAGAACATCAGCAATCTCCAGTATAAAGAGCAAAACTACAAGGCCACTCCG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TAAAGAGAGTTAAAGAAAACCAGAAGAACATCAGCAATCTCCAGTATAAAGAGCAAAACTACAAGGCCACTCCG 1998
Query 1999 GTAAGCATGACCCCGGAGATAGAGAGAGTGAGGCGAAACCAGGAGCAGCTGAGTGCGGCAAGTCGTTTCTGTTT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1999 GTAAGCATGACCCCGGAGATAGAGAGAGTGAGGCGAAACCAGGAGCAGCTGAGTGCGGTAA------------- 2059
Query 2073 CCTTTTATAT----------------------------TTTCT----------------------CAAA----- 2091
.|||| ||||| ||||
Sbjct 2060 -----AATATAAGGGAGAACTTCAACGGGGAACTGCAATTTCTGATCCACCAGAGCTGAAGAGGGCAAAAGAAA 2128
Query 2092 -----CATAACAT-----ATTTTTATTTAAAAA--TATGCCCTTTGGAAG-GC-----CATTA--------TCC 2139
.|.||||| ||.|||| |||.|.| |..|| |.||||| || |.||| |||
Sbjct 2129 ACCAGAAAAACATCAGCAATGTTTA-TTACAGAGGTCAGC---TGGGAAGAGCTACCACTTTAAGTGTAACTCC 2198
Query 2140 TTA---GCAAAC-------------------------------------------------------------- 2148
|.| |.|||.
Sbjct 2199 TGAAATGGAAAGAGTGAAGAAGAATCAAGAAAATATTAGCTCGGTAAAATATACCCAGGACCATAAACAGATGA 2272
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2273 AAGGTAGACCAAGTCTGATTTTAGATACACCTGCTATGAGACATGTTAAAGAAGCACAAAATCATATTTCAATG 2346
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2347 GTAAAATACCATGAAGATTTTGAAAAAACAAAGGGGAGAGGCTTTACTCCCGTCGTGGACGATCCTGTGACAGA 2420
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2421 GAGAGTGAGGAAGAACACCCAGGTGGTCAGCGATGCTGCCTATAAAGGGGTCCACCCTCACATCGTGGAGATGG 2494
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2495 ACAGGAGACCTGGAATCATTGTTGACCTCAAAGTTTGGCGCACAGATCCTGGCTCCATCTTCGACCTTGATCCC 2568
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2569 CTGGAAGACAATATTCAGTCTAGAAGTCTCCATATGCTCTCTGAAAAGGCGAGTCACTATAGGCGACACTGGTC 2642
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2643 TCGATCCCATTCCAGCAGTACTTTCGGTACAGGTCTCGGAGACGACAGGTCAGAAATCTCCGAGATTTACCCTA 2716
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2717 GCTTTTCATGCTGCAGTGAGGTAACAAGACCGTCTGATGAAGGAGCACCTGTTCTTCCCGGAGCCTATCAGCAA 2790
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2791 AGCCATTCCCAAGGCTATGGCTACATGCACCAGACCAGTGTGTCATCCATGAGATCAATGCAGCATTCACCAAA 2864
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2865 TCTAAGGACCTACCGAGCCATGTACGATTACAGTGCCCAGGATGAAGACGAGGTCTCCTTTAGAGACGGCGACT 2938
Query 2149 -------------------------------------------------------------------------- 2148
Sbjct 2939 ACATCGTCAACGTGCAGCCTATTGACGATGGCTGGATGTACGGCACAGTGCAGAGAACAGGGAGAACAGGAATG 3012
Query 2149 ------------------------------ 2148
Sbjct 3013 CTCCCAGCGAATTACATTGAGTTTGTTAAT 3042