Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476234
• Subject: XM_005261069.4
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1248
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGGCTTCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGTGCTTCATGAGAGAATGCATACTTGGAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGTGCTTCATGAGAGAATGCATACTTGGAAT  74

Query   75  GAATCCTTCTAGAGACGTCCACGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAGCCCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAATCCTTCTAGAGACGTCCACGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAGCCCAG  148

Query  149  GCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGC  222

Query  223  GACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCTCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCTCTG  296

Query  297  CTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGGGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGGGATG  370

Query  371  TTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACC  444

Query  445  GCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAGCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAGCTT  518

Query  519  CACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGG  592

Query  593  ATGGGCCCCGAGAACCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCTTTTCC  666
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  593  ATGGGCCCCGAGAACCTCGAA-----------------------------------------------------  613

Query  667  GAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCCACGCC  740
                                                                                      
Sbjct  614  --------------------------------------------------------------------------  613

Query  741  CAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGGATACAAGGC  814
                                                                             |||||||||
Sbjct  614  -----------------------------------------------------------------ATACAAGGC  622

Query  815  AGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCTGTG  888
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Sbjct  623  AGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCTGTG  696

Query  889  CACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCGACT  962
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Sbjct  697  CACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCGACT  770

Query  963  CTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACCCCC  1036
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Sbjct  771  CTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACCCCC  844

Query 1037  GCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGTCGGCC  1110
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Sbjct  845  GCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGTCGGCC  918

Query 1111  ATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  919  ATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCC  992

Query 1185  GTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  993  GTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGGTGG  1066

Query 1259  GCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAACCCC  1332
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Sbjct 1067  GCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAACCCC  1140

Query 1333  AGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCGCCCTC  1406
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Sbjct 1141  AGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCGCCCTC  1214

Query 1407  CGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1440
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Sbjct 1215  CGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1248