Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476234
• Subject: XM_017028487.1
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1287
• Gaps: 153

Alignment

Query    1  ATGGCTTCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGTGCTTCATGAGAGAATGCATACTTGGAAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAATCCTTCTAGAGACGTCCACGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAGCCCAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGC  222
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----ATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGC  69

Query  223  GACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCTCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  GACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCTCTG  143

Query  297  CTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGGGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  CTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGGGATG  217

Query  371  TTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  TTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACC  291

Query  445  GCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAGCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  GCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAGCTT  365

Query  519  CACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGG  439

Query  593  ATGGGCCCCGAGAACCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCTTTTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  ATGGGCCCCGAGAACCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCTTTTCC  513

Query  667  GAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCCACGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  GAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCCACGCC  587

Query  741  CAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGGATACAAGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  CAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGGATACAAGGC  661

Query  815  AGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  AGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCTGTG  735

Query  889  CACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCGACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  CACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCGACT  809

Query  963  CTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACCCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  CTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACCCCC  883

Query 1037  GCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGTCGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  GCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGTCGGCC  957

Query 1111  ATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  ATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCC  1031

Query 1185  GTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  GTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGGTGG  1105

Query 1259  GCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAACCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  GCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAACCCC  1179

Query 1333  AGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCGCCCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  AGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCGCCCTC  1253

Query 1407  CGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  CGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1287