Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476300
• Subject: XM_011532035.3
• Aligned Length: 1318
• Identities: 1170
• Gaps: 143

Alignment

Query    1  ATGAAGGAAACGCCACTCTCAAACTGCGAACGCCGCTTCCTACTCCGTGCCATCGAAGAGAAGAAGCGGCTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGAAACGCCACTCTCAAACTGCGAACGCCGCTTCCTACTCCGTGCCATCGAAGAGAAGAAGCGGCTGGA  74

Query   75  TGGCAGACAAACCTATGATTATAGGAACATCAGGATCTCATTTGGAACAGATTACGGATGCTGCATTGTGGAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGCAGACAAACCTATGATTATAGGAACATCAGGATCTCATTTGGAACAGATTACGGATGCTGCATTGTGGAAC  148

Query  149  TTGGAAAAACAAGAGTTCTTGGACAGGTTTCCTGTGAACTTGTGTCTCCAAAACTCAATCGGGCAACAGAAGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGGAAAAACAAGAGTTCTTGGACAGGTTTCCTGTGAACTTGTGTCTCCAAAACTCAATCGGGCAACAGAAGGT  222

Query  223  ATTCTTTTTTTTAACCTTGAACTCTCTCAGATGGCCGCTCCAGCTTTCGAACCTGGCAGGCAGTCAGATCTCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTCTTTTTTTTAACCTTGAACTCTCTCAGATGGCCGCTCCAGCTTTCGAACCTGGCAGGCAGTCAGATCTCTT  296

Query  297  GGTGAAGTTGAATCGACTCATGGAAAGATGTCTAAGAAATTCGAAGTGTATAGACACTGAGTCTCTCTGTGTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGAAGTTGAATCGACTCATGGAAAGATGTCTAAGAAATTCGAAGTGTATAGACACTGAGTCTCTCTGTGTTG  370

Query  371  TTGCTGGTGAAAAGGTTTGGCAAATACGTGTAGACCTACATTTATTAAATCATGATGGAAATATTATTGATGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGCTGGTGAAAAGGTTTGGCAAATACGTGTAGACCTACATTTATTAAATCATGATGGAAATATTATTGATGCT  444

Query  445  GCCAGCATTGCTGCAATCGTGGCCTTATGTCATTTCCGAAGACCTGATGTCTCTGTCCAAGGAGATGAAGTAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCAGCATTGCTGCAATCGTGGCCTTATGTCATTTCCGAAGACCTGATGTCTCTGTCCAAGGAGATGAAGTAAC  518

Query  519  ACTGTATACACCTGAAGAGCGTGATCCTGTACCATTAAGTATCCACCACATGCCCATTTGTGTCAGTTTTGCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTGTATACACCTGAAGAGCGTGATCCTGTACCATTAAGTATCCACCACATGCCCATTTGTGTCAGTTTTGCCT  592

Query  593  TTTTCCAGCAAGGAGCATATTTATTGGTGGATCCCAATGAACGAGAAGAACGTGTGATGGATGGCTTGCTGGTG  666
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTCCAGCAAGGAACATATTTATTGGTGGATCCCAATGAACGAGAAGAACGTGTGATGGATGGCTTGCTGGTG  666

Query  667  ATTGCCATGAACAAACATCGAGAGATTTGTACTATCCAGTCCAGTGGTGGGATAATGCTACTAAAAGATCAAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGCCATGAACAAACATCGAGAGATTTGTACTATCCAGTCCAGTGGTGGGATAATGCTACTAAAAGATCAAGT  740

Query  741  TCTGAGATGCAGTAAAATCGCTGGTGTGAAAGTAGCAGAAATTACAGAGCTAATATTGAAAGCTTTGGAGAATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGAGATGCAGTAAAATCGCTGGTGTGAAAGTAGCAGAAATTACAGAGCTAATATTGAAAGCTTTGGAGAATG  814

Query  815  ACCAAAAAGTAAGGAAAGAAGGTGGAAAGTTTGGTTTTGCAGAGTCTATAGCAAATCAAAGGATCACAGCATTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCAAAAAGTAAGGAAAGAAGGTGGAAAGTTTGGTTTTGCAGAGTCTATAGCAAATCAAAGGATCACAGCATTT  888

Query  889  AAAATGGAAAAGGCCCCTATTGATACCTCGGATGTAGAAGAAAAAGCAGAAGAAATCATTGCTGAAGCAGAACC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAATGGAAAAGGCCCCTATTGATACCTCGGATGTAGAAGAAAAAGCAGAAGAAATCATTGCTGAAGCAGAACC  962

Query  963  TCCTTCAGAAGTTGTTTCTACACCTGTGCTATGGACTCCTGGAACTGCCCAAATTGGAGAGGGAGTAGAAAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCTTCAGAAGTTGTTTCTACACCTGTGCTATGGACTCCTGGAACTGCCCAAATTGGAGAGGGAGTAGAAAACT  1036

Query 1037  CCTGGGGTGATCTTGAAGACTCTGAGAAGGAAGATGATGAAGGCGGTGGTGATCAAGCTATCATTCTTGATGGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTGGGGTGATCTTGAAGACTCTGAGAAGGAAGATGATGAAGGCGGTGGTGATCAAGCTATCATTCTTGATGGT  1110

Query 1111  ATAAAAATGGACACTGGAGTAGAAGTCTCTGATATTGGAAGCCAAGATGCTCCCATAATACTC-TCAGATAGTG  1183
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||.|| ||..|.||||
Sbjct 1111  ATAAAAATGGACACTGGAGTAGAAGTCTCTGATATTGGAAGCCAAG-TG---------TATTCTTCTAACAGTG  1174

Query 1184  AAGAAGAAGAAATGATCATTTTGGAACCAGACAAGAATCCAAAGAAAATAAGAACACAGACCACCAGTGCAAAA  1257
            ||                                                                        
Sbjct 1175  AA------------------------------------------------------------------------  1176

Query 1258  CAAGAAAAAGCACCAAGTAAAAAGCCAGTGAAAAGAAGAAAAAAGAAGAGAGCTGCCAAT  1317
                                                                        
Sbjct 1177  ------------------------------------------------------------  1176