Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476385
- Subject:
- XM_017008683.2
- Aligned Length:
- 2193
- Identities:
- 1666
- Gaps:
- 525
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGCTTGCCCAGCTGGCGTACAGAGAGCAAATGAATGAGCATCACAAGAGAGCCTACACCTATGCCCCCTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTACGAGGACTTCATCAAGCTCATTAACAGCAACTCTGATGTGGAGTTCTTGAAGCAACTAAGGGAAAGCGTAC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AAACATCAGCCCTCCTGATTCTTGAACCGAACTCAGCACTTGCAAAGTCGTATCCTCCTCTGGAGAAAGAAAAC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CGAGTGAGTGCCAGGTATCAAATTGTAGTGGAAATAATCCAGGCGACTACAATTAGCAGCTTTCCCCAACTGAA 296
Query 1 ----------------------------ATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGGCACAAAGGTAAAGAAACTGCGGCAATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCA 370
Query 47 ACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCAGTGTGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGACCAGCAA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCAGTGTGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGACCAGCAA 444
Query 121 GAGGATGGGGCCCTGGATGAGGGGGAAGGGCCTCAAAGCCAGA------------------------------- 163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGGATGGGGCCCTGGATGAGGGGGAAGGGCCTCAAAGCCAGAAGCAGAAGCTACAGATAGAAGGTTCAATATC 518
Query 164 -----AGATTCTTCAGTTTGAAGATATCTTGGCCAATACGTTCTACCGAGAGCACTTTGGAATGTACATGGAAA 232
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCACAGATTCTTCAGTTTGAAGATATCTTGGCCAATACGTTCTACCGAGAGCACTTTGGAATGTACATGGAAA 592
Query 233 GGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAGTTTTTGGGAATCTGTGGAACATTTAAAGAATGCTAACAAGAATGAAATT 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAGTTTTTGGGAATCTGTGGAACATTTAAAGAATGCTAACAAGAATGAAATT 666
Query 307 CCACAATTAGTTGGTGAAATTTATCAGAATTTCTTTGTGGAGAGCAAAGAAATATCTGTGGAAAAATCACTTTA 380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCACAATTAGTTGGTGAAATTTATCAGAATTTCTTTGTGGAGAGCAAAGAAATATCTGTGGAAAAATCACTTTA 740
Query 381 CAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTAGGAAATAAAGGTATTGAAGTATTCTACAAAATCCAGGAAGATGTTTATG 454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTAGGAAATAAAGGTATTGAAGTATTCTACAAAATCCAGGAAGATGTTTATG 814
Query 455 AGACCCTAAAGGACAGGTATTACCCTTCATTTATTGTCAGTGACCTGTATGAGAAATTGTTGATAAAAGAGGAA 528
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGACCCTAAAGGATAGGTATTACCCTTCATTTATTGTCAGTGACCTGTATGAGAAATTGTTGATAAAAGAGGAA 888
Query 529 GAAAAACATGCCTCACAGATGATTTCCAACAAGGATGAGATGGGCCCAAGAGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGT 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAAAACATGCCTCACAGATGATTTCCAACAAGGATGAGATGGGCCCAAGAGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGT 962
Query 603 GGATGATGGTACCAATCAGATCAATGAACAAGCCAGTTTTGCTGTAAACAAACTGCGAGAACTAAATGAGAAAC 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGATGATGGTACCAATCAGATCAATGAACAAGCCAGTTTTGCTGTAAACAAACTGCGAGAACTAAATGAGAAAC 1036
Query 677 TTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAATTCTATTCAAAATGCACCAAAACCTGACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAATTCTATTCAAAATGCACCAAAACCTGACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTG 1110
Query 751 AAGGATGAAATAATCCTAATAGAGAAAGAACGCACAGACCTTCAGCTGCACATAGCAAGAACGGATTGGTGGTG 824
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGGATGAAATAATCCTAATAGAGAAAGAACGCACAGACCTTCAGCTGCACATGGCAAGAACGGATTGGTGGTG 1184
Query 825 TGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCCTCCATCACCAGTGGAGAGGTTACAGAAGAGAATGGTGAGCAATTGCCAT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCCTCCATCACCAGTGGAGAGGTTACAGAAGAGAATGGTGAGCAATTGCCAT 1258
Query 899 GTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACAAGAAGTTGGAGGAGTTGAAACTAAGAACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTC 972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACAAGAAGTTGGAGGAGTTGAAACTAAGAACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTC 1332
Query 973 AGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGAAACTCAGTGAGTGCGTCCCTTCTTTAAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCT 1046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGAAACTCAGTGAGTGCGTCCCTTCTTTAAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCT 1406
Query 1047 TAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGATCAAAAGTTTATGGAAAAGTCGAAGAATCAATTAAATAAGTTTTTAC 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGATCAAAAGTTTATGGAAAAGTCGAAGAATCAATTAAATAAGTTTTTAC 1480
Query 1121 -------------------------------------------------------------------------- 1120
Sbjct 1481 AGAATCTGCTTTCAGATGAAAGACTGTGTCAGAGTGAAGCACTTTATGCCTTCTTGAGCCCTTCTCCTGACTAC 1554
Query 1121 -------------------------------------------------------------------------- 1120
Sbjct 1555 CTCAAGGTTATCGACGTGCAGGGGAAAAAAAATTCTTTTTCATTATCCTCATTTTTGGAAAGACTTCCTCGCGA 1628
Query 1121 -----------------AGGAGGAGACAGAGGAGGACAGTGACCTGTCAGATTATGGTGATGATGTGGATGGGA 1177
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTTCTTCTCCCACCAGGAGGAGGAGACAGAGGAGGACAGTGACCTGTCAGATTATGGTGATGATGTGGATGGGA 1702
Query 1178 GGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATGTTTCATGTTGATTGGGGAGATTTTTGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGG 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATGTTTCATGTTGATTGGGGAGATTTTTGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGG 1776
Query 1252 GTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCGTTCAGGTCACTTTTGGAAGAACCATCAACAAACAAATCCGGGACACAGT 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCGTTCAGGTCACTTTTGGAAGAACCATCAACAAACAAATCCGGGACACAGT 1850
Query 1326 CAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATGTTGGTTTACTACATCAATATTTTCCGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGA 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATGTTGGTTTACTACATCAATATTTTCCGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGA 1924
Query 1400 AGTTGGCACCACCGACCACAATCAGAAGCAAAGAGCAAAGTCAGGAAACAAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTG 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGTTGGCACCACCGACCACAATCAGAAGCAAAGAGCAAAGTCAGGAAACAAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTG 1998
Query 1474 CTTGAAAACATTCCAGATATGCTTCAGAGCCTTGTTGGACAGCAAAATGCCCGCCACGGTATAATAAAAATATT 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTTGAAAACATTCCAGATATGCTTCAGAGCCTTGTTGGACAGCAAAATGCCCGCCACGGTATAATAAAAATATT 2072
Query 1548 CAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCCAACAAGCATCTGTTATATGCGCTGATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGT 1621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCCAACAAGCATCTGTTATATGCGCTGATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGT 2146
Query 1622 GTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGATCAACTTAAAGCTGGCCAAGTT 1668
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGATCAACTTAAAGCTGGCCAAGTT 2193