Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476385
- Subject:
- XM_024454240.1
- Aligned Length:
- 1869
- Identities:
- 1666
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCAACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCAGTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCAACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCAGTG 74
Query 75 TGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGACCAGCAAGAGGATGGGGCCCTGGATGAGGGGGAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGACCAGCAAGAGGATGGGGCCCTGGATGAGGGGGAAG 148
Query 149 GGCCTCAAAGCCAGA------------------------------------AGATTCTTCAGTTTGAAGATATC 186
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGCCTCAAAGCCAGAAGCAGAAGCTACAGATAGAAGGTTCAATATCTCCACAGATTCTTCAGTTTGAAGATATC 222
Query 187 TTGGCCAATACGTTCTACCGAGAGCACTTTGGAATGTACATGGAAAGGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAGTTT 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGGCCAATACGTTCTACCGAGAGCACTTTGGAATGTACATGGAAAGGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAGTTT 296
Query 261 TTGGGAATCTGTGGAACATTTAAAGAATGCTAACAAGAATGAAATTCCACAATTAGTTGGTGAAATTTATCAGA 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTGGGAATCTGTGGAACATTTAAAGAATGCTAACAAGAATGAAATTCCACAATTAGTTGGTGAAATTTATCAGA 370
Query 335 ATTTCTTTGTGGAGAGCAAAGAAATATCTGTGGAAAAATCACTTTACAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTAGGA 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTCTTTGTGGAGAGCAAAGAAATATCTGTGGAAAAATCACTTTACAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTAGGA 444
Query 409 AATAAAGGTATTGAAGTATTCTACAAAATCCAGGAAGATGTTTATGAGACCCTAAAGGACAGGTATTACCCTTC 482
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 AATAAAGGTATTGAAGTATTCTACAAAATCCAGGAAGATGTTTATGAGACCCTAAAGGATAGGTATTACCCTTC 518
Query 483 ATTTATTGTCAGTGACCTGTATGAGAAATTGTTGATAAAAGAGGAAGAAAAACATGCCTCACAGATGATTTCCA 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATTTATTGTCAGTGACCTGTATGAGAAATTGTTGATAAAAGAGGAAGAAAAACATGCCTCACAGATGATTTCCA 592
Query 557 ACAAGGATGAGATGGGCCCAAGAGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGTGGATGATGGTACCAATCAGATCAATGAA 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAAGGATGAGATGGGCCCAAGAGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGTGGATGATGGTACCAATCAGATCAATGAA 666
Query 631 CAAGCCAGTTTTGCTGTAAACAAACTGCGAGAACTAAATGAGAAACTTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAATTC 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAGCCAGTTTTGCTGTAAACAAACTGCGAGAACTAAATGAGAAACTTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAATTC 740
Query 705 TATTCAAAATGCACCAAAACCTGACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTGAAGGATGAAATAATCCTAATAGAGAAAG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TATTCAAAATGCACCAAAACCTGACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTGAAGGATGAAATAATCCTAATAGAGAAAG 814
Query 779 AACGCACAGACCTTCAGCTGCACATAGCAAGAACGGATTGGTGGTGTGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCCTCC 852
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACGCACAGACCTTCAGCTGCACATGGCAAGAACGGATTGGTGGTGTGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCCTCC 888
Query 853 ATCACCAGTGGAGAGGTTACAGAAGAGAATGGTGAGCAATTGCCATGTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACAAGA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCACCAGTGGAGAGGTTACAGAAGAGAATGGTGAGCAATTGCCATGTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACAAGA 962
Query 927 AGTTGGAGGAGTTGAAACTAAGAACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTCAGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGAAAC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTTGGAGGAGTTGAAACTAAGAACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTCAGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGAAAC 1036
Query 1001 TCAGTGAGTGCGTCCCTTCTTTAAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTTAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGAT 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCAGTGAGTGCGTCCCTTCTTTAAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTTAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGAT 1110
Query 1075 CAAAAGTTTATGGAAAAGTCGAAGAATCAATTAAATAAGTTTTTAC---------------------------- 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAAAAGTTTATGGAAAAGTCGAAGAATCAATTAAATAAGTTTTTACAGAATCTGCTTTCAGATGAAAGACTGTG 1184
Query 1121 -------------------------------------------------------------------------- 1120
Sbjct 1185 TCAGAGTGAAGCACTTTATGCCTTCTTGAGCCCTTCTCCTGACTACCTCAAGGTTATCGACGTGCAGGGGAAAA 1258
Query 1121 ---------------------------------------------------------------AGGAGGAGACA 1131
|||||||||||
Sbjct 1259 AAAATTCTTTTTCATTATCCTCATTTTTGGAAAGACTTCCTCGCGACTTCTTCTCCCACCAGGAGGAGGAGACA 1332
Query 1132 GAGGAGGACAGTGACCTGTCAGATTATGGTGATGATGTGGATGGGAGGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATGTTT 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGGAGGACAGTGACCTGTCAGATTATGGTGATGATGTGGATGGGAGGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATGTTT 1406
Query 1206 CATGTTGATTGGGGAGATTTTTGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCGTTC 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CATGTTGATTGGGGAGATTTTTGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCGTTC 1480
Query 1280 AGGTCACTTTTGGAAGAACCATCAACAAACAAATCCGGGACACAGTCAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATGTTG 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGTCACTTTTGGAAGAACCATCAACAAACAAATCCGGGACACAGTCAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATGTTG 1554
Query 1354 GTTTACTACATCAATATTTTCCGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGAAGTTGGCACCACCGACCACAATCAGAAG 1427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTTTACTACATCAATATTTTCCGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGAAGTTGGCACCACCGACCACAATCAGAAG 1628
Query 1428 CAAAGAGCAAAGTCAGGAAACAAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTGCTTGAAAACATTCCAGATATGCTTCAGA 1501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAAAGAGCAAAGTCAGGAAACAAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTGCTTGAAAACATTCCAGATATGCTTCAGA 1702
Query 1502 GCCTTGTTGGACAGCAAAATGCCCGCCACGGTATAATAAAAATATTCAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCCAAC 1575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCCTTGTTGGACAGCAAAATGCCCGCCACGGTATAATAAAAATATTCAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCCAAC 1776
Query 1576 AAGCATCTGTTATATGCGCTGATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGTGTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGATCA 1649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAGCATCTGTTATATGCGCTGATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGTGTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGATCA 1850
Query 1650 ACTTAAAGCTGGCCAAGTT 1668
|||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACTTAAAGCTGGCCAAGTT 1869