Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476438
• Subject: XM_017011541.1
• Aligned Length: 3223
• Identities: 3172
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGGCGCCCCCCACAGGTGTGCTCTCTTCATTGCT-------GCTGCTGGTGACAATTGCAGGTTGTGCCCGTA  67
                                         ||..||       ||||     |.|.|...||.||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------ATGACTAGACTGGGCTG-----GCCGAGCCCATGTTGTGCCCGTA  40

Query   68  AGCAGTGCAGCGAGGGGAGGACATATTCCAATGCAGTCATTTCACCTAACTTGGAAACCACCAGAATCATGCGG  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   41  AGCAGTGCAGCGAGGGGAGGACATATTCCAATGCAGTCATTTCACCTAACTTGGAAACCACCAGAATCATGCGG  114

Query  142  GTGTCTCACACCTTCCCTGTCGTAGACTGCACGGCCGCTTGCTGTGACCTGTCCAGCTGTGACCTGGCCTGGTG  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115  GTGTCTCACACCTTCCCTGTCGTAGACTGCACGGCCGCTTGCTGTGACCTGTCCAGCTGTGACCTGGCCTGGTG  188

Query  216  GTTCGAGGGCCGCTGCTACCTGGTGAGCTGCCCCCACAAAGAGAACTGTGAGCCCAAGAAGATGGGCCCCATCA  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  189  GTTCGAGGGCCGCTGCTACCTGGTGAGCTGCCCCCACAAAGAGAACTGTGAGCCCAAGAAGATGGGCCCCATCA  262

Query  290  GGTCTTATCTCACTTTTGTGCTCCGGCCTGTTCAGAGGCCTGCACAGCTGCTGGACTATGGGGACATGATGCTG  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  GGTCTTATCTCACTTTTGTGCTCCGGCCTGTTCAGAGGCCTGCACAGCTGCTGGACTATGGGGACATGATGCTG  336

Query  364  AACAGGGGCTCCCCCTCGGGGATCTGGGGGGACTCACCTGAGGATATCAGAAAGGACTTGCCCTTTCTAGGCAA  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  337  AACAGGGGCTCCCCCTCGGGGATCTGGGGGGACTCACCTGAGGATATCAGAAAGGACTTGACCTTTCTAGGCAA  410

Query  438  AGATTGGGGCCTAGAGGAGATGTCTGAGTACTCAGATGACTACCGGGAGCTGGAGAAGGACCTCTTGCAACCCA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  AGATTGGGGCCTAGAGGAGATGTCTGAGTACTCAGATGACTACCGGGAGCTGGAGAAGGACCTCTTGCAACCCA  484

Query  512  GTGGCAAGCAGGAGCCCAGAGGGAGTGCCGAGTACACGGACTGGGGCCTACTGCCGGGCAGCGAGGGGGCCTTC  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  GTGGCAAGCAGGAGCCCAGAGGGAGTGCCGAGTACACGGACTGGGGCCTACTGCCGGGCAGCGAGGGGGCCTTC  558

Query  586  AACTCCTCTGTTGGAGACAGTCCTGCGGTGCCAGCGGAGACGCAGCAGGACCCTGAGCTCCATTACCTGAATGA  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  AACTCCTCTGTTGGAGACAGTCCTGCGGTGCCAGCGGAGACGCAGCAGGACCCTGAGCTCCATTACCTGAATGA  632

Query  660  GTCGGCTTCAACCCCTGCCCCAAAACTCCCTGAGAGAAGTGTGTTGCTTCCCTTGCCGACTACTCCATCTTCAG  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GTCGGCTTCAACCCCTGCCCCAAAACTCCCTGAGAGAAGTGTGTTGCTTCCCTTGCCGACTACTCCATCTTCAG  706

Query  734  GAGAGGTGTTGGAGAAAGAAAAGGCTTCTCAGCTCCAGGAACAATCCAGCAACAGCTCTGGAAAAGAGGTTCTA  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  GAGAGGTGTTGGAGAAAGAAAAGGCTTCTCAGCTCCAGGAACAATCCAGCAACAGCTCTGGAAAAGAGGTTCTA  780

Query  808  ATGCCTTCCCATAGTCTTCCTCCGGCAAGCCTGGAGCTCAGCTCAGTCACCGTGGAGAAAAGCCCAGTGCTCAC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  ATGCCTTCCCATAGTCTTCCTCCGGCAAGCCTGGAGCTCAGCTCAGTCACCGTGGAGAAAAGCCCAGTGCTCAC  854

Query  882  AGTCACCCCGGGGAGTACAGAGCACAGCATCCCAACACCTCCCACTAGCGCAGCCCCCTCTGAGTCCACCCCAT  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  AGTCACCCCGGGGAGTACAGAGCACAGCATCCCAACACCTCCCACTAGCGCAGCCCCCTCTGAGTCCACCCCAT  928

Query  956  CTGAGCTACCCATATCTCCTACCACTGCTCCCAGGACAGTGAAAGAACTTACGGTATCGGCTGGAGATAACCTA  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  CTGAGCTACCCATATCTCCTACCACTGCTCCCAGGACAGTGAAAGAACTTACGGTATCGGCTGGAGATAACCTA  1002

Query 1030  ATTATAACTTTACCCGACAATGAAGTTGAACTGAAGGCCTTTGTTGCGCCAGCGCCACCTGTAGAAACAACCTA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  ATTATAACTTTACCCGACAATGAAGTTGAACTGAAGGCCTTTGTTGCGCCAGCGCCACCTGTAGAAACAACCTA  1076

Query 1104  CAACTATGAATGGAATTTAATAAGCCACCCCACAGACTACCAAGGTGAAATAAAACAAGGACACAAGCAAACTC  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  CAACTATGAATGGAATTTAATAAGCCACCCCACAGACTACCAAGGTGAAATAAAACAAGGACACAAGCAAACTC  1150

Query 1178  TTAACCTCTCTCAATTGTCCGTCGGACTTTATGTCTTCAAAGTCACTGTTTCTAGTGAAAACGCCTTTGGAGAA  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  TTAACCTCTCTCAATTGTCCGTCGGACTTTATGTCTTCAAAGTCACTGTTTCTAGTGAAAACGCCTTTGGAGAA  1224

Query 1252  GGATTTGTCAATGTCACTGTTAAGCCTGCCAGAAGAGTCAACCTGCCACCTGTAGCAGTTGTTTCTCCCCAACT  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  GGATTTGTCAATGTCACTGTTAAGCCTGCCAGAAGAGTCAACCTGCCACCTGTAGCAGTTGTTTCTCCCCAACT  1298

Query 1326  GCAAGAGCTCACTTTGCCTTTGACGTCAGCCCTCATTGATGGCAGCCAAAGTACAGATGATACTGAAATAGTGA  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  GCAAGAGCTCACTTTGCCTTTGACGTCAGCCCTCATTGATGGCAGCCAAAGTACAGATGATACTGAAATAGTGA  1372

Query 1400  GTTATCATTGGGAAGAAATAAACGGGCCCTTCATAGAAGAGAAGACTTCAGTTGACTCTCCCGTCTTACGCTTG  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373  GTTATCATTGGGAAGAAATAAACGGGCCCTTCATAGAAGAGAAGACTTCAGTTGACTCTCCCGTCTTACGCTTG  1446

Query 1474  TCTAACCTTGATCCTGGTAACTATAGTTTCAGGTTGACTGTTACAGACTCGGACGGAGCCACTAACTCTACAAC  1547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447  TCTAACCTTGATCCTGGTAACTATAGTTTCAGGTTGACTGTTACAGACTCGGACGGAGCCACTAACTCTACAAC  1520

Query 1548  TGCAGCCCTAATAGTGAACAATGCTGTGGACTACCCACCAGTTGCTAATGCAGGACCAAATCACACCATAACTT  1621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521  TGCAGCCCTAATAGTGAACAATGCTGTGGACTACCCACCAGTTGCTAATGCAGGACCAAATCACACCATAACTT  1594

Query 1622  TGCCCCAAAACTCCATCACTTTGAATGGAAACCAGAGCAGTGACGATCACCAGATTGTCCTCTATGAGTGGTCC  1695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595  TGCCCCAAAACTCCATCACTTTGAATGGAAACCAGAGCAGTGACGATCACCAGATTGTCCTCTATGAGTGGTCC  1668

Query 1696  CTGGGTCCTGGGAGTGAGGGCAAACATGTGGTCATGCAGGGAGTACAGACGCCATACCTTCATTTATCTGCAAT  1769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669  CTGGGTCCTGGGAGTGAGGGCAAACATGTGGTCATGCAGGGAGTACAGACGCCATACCTTCATTTATCTGCAAT  1742

Query 1770  GCAGGAAGGAGATTATACATTTCAGCTGAAGGTGACAGATTCTTCAAGGCAACAGTCTACTGCTGTGGTGACTG  1843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743  GCAGGAAGGAGATTATACATTTCAGCTGAAGGTGACAGATTCTTCAAGGCAACAGTCTACTGCTGTGGTGACTG  1816

Query 1844  TGATTGTCCAGCCTGAAAACAATAGACCTCCAGTGGCTGTGGCCGGCCCTGATAAAGAGCTGATCTTCCCAGTG  1917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817  TGATTGTCCAGCCTGAAAACAATAGACCTCCAGTGGCTGTGGCCGGCCCTGATAAAGAGCTGATCTTCCCAGTG  1890

Query 1918  GAAAGTGCTACCCTGGATGGGAGCAGCAGCAGCGATGACCACGGCATTGTCTTCTACCACTGGGAGCACGTCAG  1991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1891  GAAAGTGCTACCCTGGATGGGAGCAGCAGCAGCGATGACCACGGCATTGTCTTCTACCACTGGGAGCACGTCAG  1964

Query 1992  AGGCCCCAGTGCAGTGGAGATGGAAAATATTGACAAAGCAATAGCCACTGTGACTGGTCTCCAGGTGGGGACCT  2065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965  AGGCCCCAGTGCAGTGGAGATGGAAAATATTGACAAAGCAATAGCCACTGTGACTGGTCTCCAGGTGGGGACCT  2038

Query 2066  ACCACTTCCGTTTGACAGTGAAAGACCAGCAGGGACTGAGCAGCACGTCCACCCTCACTGTGGCTGTGAAGAAG  2139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039  ACCACTTCCGTTTGACAGTGAAAGACCAGCAGGGACTGAGCAGCACGTCCACCCTCACTGTGGCTGTGAAGAAG  2112

Query 2140  GAAAATAATAGTCCTCCCAGAGCCCGGGCTGGTGGCAGACATGTTCTTGTGCTTCCCAATAATTCCATTACTTT  2213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113  GAAAATAATAGTCCTCCCAGAGCCCGGGCTGGTGGCAGACATGTTCTTGTGCTTCCCAATAATTCCATTACTTT  2186

Query 2214  GGATGGTTCAAGGTCTACTGATGACCAAAGAATTGTGTCCTATCTGTGGATCCGGGATGGCCAGAGTCCAGCAG  2287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2187  GGATGGTTCAAGGTCTACTGATGACCAAAGAATTGTGTCCTATCTGTGGATCCGGGATGGCCAGAGTCCAGCAG  2260

Query 2288  CTGGAGATGTCATCGATGGCTCTGACCACAGTGTGGCTCTGCAGCTTACGAATCTGGTGGAGGGGGTGTACACT  2361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2261  CTGGAGATGTCATCGATGGCTCTGACCACAGTGTGGCTCTGCAGCTTACGAATCTGGTGGAGGGGGTGTACACT  2334

Query 2362  TTCCACTTGCGAGTCACCGACAGTCAGGGGGCCTCGGACACAGACACTGCCACTGTGGAAGTGCAGCCAGACCC  2435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335  TTCCACTTGCGAGTCACCGACAGTCAGGGGGCCTCGGACACAGACACTGCCACTGTGGAAGTGCAGCCAGACCC  2408

Query 2436  TAGGAAGAGTGGCCTGGTGGAGCTGACCCTGCAGGTTGGTGTTGGGCAGCTGACAGAGCAGCGGAAGGACACCC  2509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2409  TAGGAAGAGTGGCCTGGTGGAGCTGACCCTGCAGGTTGGTGTTGGGCAGCTGACAGAGCAGCGGAAGGACACCC  2482

Query 2510  TTGTGAGGCAGCTGGCTGTGCTGCTGAACGTGCTGGACTCGGACATTAAGGTCCAGAAGATTCGGGCCCACTCG  2583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2483  TTGTGAGGCAGCTGGCTGTGCTGCTGAACGTGCTGGACTCGGACATTAAGGTCCAGAAGATTCGGGCCCACTCG  2556

Query 2584  GATCTCAGCACCGTGATTGTGTTTTATGTACAGAACAGGCCGCCTTTCAAGGTTCTCAAAGCTGCTGAAGTGGC  2657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2557  GATCTCAGCACCGTGATTGTGTTTTATGTACAGAGCAGGCCGCCTTTCAAGGTTCTCAAAGCTGCTGAAGTGGC  2630

Query 2658  CCGAAATCTGCACATGCGGCTCTCAAAGGAGAAGGCTGACTTCTTGCTTTTCAAGGTCTTGAGGGTTGATACAG  2731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2631  CCGAAATCTGCACATGCGGCTCTCAAAGGAGAAGGCTGACTTCTTGCTTTTCAAGGTCTTGAGGGTTGATACAG  2704

Query 2732  CAGGTTGCCTTCTGAAGTGTTCTGGCCATGGTCACTGCGACCCCCTCACAAAGCGCTGCATTTGCTCTCACTTA  2805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2705  CAGGTTGCCTTCTGAAGTGTTCTGGCCATGGTCACTGCGACCCCCTCACAAAGCGCTGCATTTGCTCTCACTTA  2778

Query 2806  TGGATGGAGAACCTTATACAGCGTTATATCTGGGATGGAGAGAGCAACTGTGAGTGGAGTATATTCTATGTGAC  2879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2779  TGGATGGAGAACCTTATACAGCGTTATATCTGGGATGGAGAGAGCAACTGTGAGTGGAGTATATTCTATGTGAC  2852

Query 2880  AGTGTTGGCTTTTACTCTTATTGTGCTAACAGGAGGTTTCACTTGGCTTTGCATCTGCTGCTGCAAAAGACAAA  2953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2853  AGTGTTGGCTTTTACTCTTATTGTGCTAACAGGAGGTTTCACTTGGCTTTGCATCTGCTGCTGCAAAAGACAAA  2926

Query 2954  AAAGGACTAAAATCAGGAAAAAAACAAAGTACACCATCCTGGATAACATGGATGAACAGGAAAGAATGGAACTG  3027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2927  AAAGGACTAAAATCAGGAAAAAAACAAAGTACACCATCCTGGATAACATGGATGAACAGGAAAGAATGGAACTG  3000

Query 3028  AGGCCCAAATATGGTATCAAGCACCGAAGCACAGAGCACAACTCCAGCCTGATGGTATCCGAGTCTGAGTTTGA  3101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001  AGGCCCAAATATGGTATCAAGCACCGAAGCACAGAGCACAACTCCAGCCTGATGGTATCCGAGTCTGAGTTTGA  3074

Query 3102  CAGTGACCAGGACACAATCTTCAGCCGAGAAAAGATGGAGAGAGGGAATCCAAAGGTTTCCATGAATGGTTCCA  3175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3075  CAGTGACCAGGACACAATCTTCAGCCGAGAAAAGATGGAGAGAGGGAATCCAAAGGTTTCCATGAATGGTTCCA  3148

Query 3176  TCAGAAATGGAGCTTCCTTCAGTTATTGCTCAAAGGACAGA  3216
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3149  TCAGAAATGGAGCTTCCTTCAGTTATTGCTCAAAGGACAGA  3189