Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476438
• Subject: XM_017011544.1
• Aligned Length: 3216
• Identities: 3115
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGGCGCCCCCCACAGGTGTGCTCTCTTCATTGCTGCTGCTGGTGACAATTGCAGGTTGTGCCCGTAAGCAGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCCCCCCACAGGTGTGCTCTCTTCATTGCTGCTGCTGGTGACAATTGCAGGTTGTGCCCGTAAGCAGTG  74

Query   75  CAGCGAGGGGAGGACATATTCCAATGCAGTCATTTCACCTAACTTGGAAACCACCAGAATCATGCGGGTGTCTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCGAGGGGAGGACATATTCCAATGCAGTCATTTCACCTAACTTGGAAACCACCAGAATCATGCGGGTGTCTC  148

Query  149  ACACCTTCCCTGTCGTAGACTGCACGGCCGCTTGCTGTGACCTGTCCAGCTGTGACCTGGCCTGGTGGTTCGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACACCTTCCCTGTCGTAGACTGCACGGCCGCTTGCTGTGACCTGTCCAGCTGTGACCTGGCCTGGTGGTTCGAG  222

Query  223  GGCCGCTGCTACCTGGTGAGCTGCCCCCACAAAGAGAACTGTGAGCCCAAGAAGATGGGCCCCATCAGGTCTTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCCGCTGCTACCTGGTGAGCTGCCCCCACAAAGAGAACTGTGAGCCCAAGAAGATGGGCCCCATCAGGTCTTA  296

Query  297  TCTCACTTTTGTGCTCCGGCCTGTTCAGAGGCCTGCACAGCTGCTGGACTATGGGGACATGATGCTGAACAGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTCACTTTTGTGCTCCGGCCTGTTCAGAGGCCTGCACAGCTGCTGGACTATGGGGACATGATGCTGAACAGGG  370

Query  371  GCTCCCCCTCGGGGATCTGGGGGGACTCACCTGAGGATATCAGAAAGGACTTGCCCTTTCTAGGCAAAGATTGG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTCCCCCTCGGGGATCTGGGGGGACTCACCTGAGGATATCAGAAAGGACTTGACCTTTCTAGGCAAAGATTGG  444

Query  445  GGCCTAGAGGAGATGTCTGAGTACTCAGATGACTACCGGGAGCTGGAGAAGGACCTCTTGCAACCCAGTGGCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTAGAGGAGATGTCTGAGTACTCAGATGACTACCGGGAGCTGGAGAAGGACCTCTTGCAACCCAGTGGCAA  518

Query  519  GCAGGAGCCCAGAGGGAGTGCCGAGTACACGGACTGGGGCCTACTGCCGGGCAGCGAGGGGGCCTTCAACTCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGGAGCCCAGAGGGAGTGCCGAGTACACGGACTGGGGCCTACTGCCGGGCAGCGAGGGGGCCTTCAACTCCT  592

Query  593  CTGTTGGAGACAGTCCTGCGGTGCCAGCGGAGACGCAGCAGGACCCTGAGCTCCATTACCTGAATGAGTCGGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTTGGAGACAGTCCTGCGGTGCCAGCGGAGACGCAGCAGGACCCTGAGCTCCATTACCTGAATGAGTCGGCT  666

Query  667  TCAACCCCTGCCCCAAAACTCCCTGAGAGAAGTGTGTTGCTTCCCTTGCCGACTACTCCATCTTCAGGAGAGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAACCCCTGCCCCAAAACTCCCTGAGAGAAGTGTGTTGCTTCCCTTGCCGACTACTCCATCTTCAGGAGAGGT  740

Query  741  GTTGGAGAAAGAAAAGGCTTCTCAGCTCCAGGAACAATCCAGCAACAGCTCTGGAAAAGAGGTTCTAATGCCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTGGAGAAAGAAAAGGCTTCTCAGCTCCAGGAACAATCCAGCAACAGCTCTGGAAAAGAGGTTCTAATGCCTT  814

Query  815  CCCATAGTCTTCCTCCGGCAAGCCTGGAGCTCAGCTCAGTCACCGTGGAGAAAAGCCCAGTGCTCACAGTCACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCATAGTCTTCCTCCGGCAAGCCTGGAGCTCAGCTCAGTCACCGTGGAGAAAAGCCCAGTGCTCACAGTCACC  888

Query  889  CCGGGGAGTACAGAGCACAGCATCCCAACACCTCCCACTAGCGCAGCCCCCTCTGAGTCCACCCCATCTGAGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCGGGGAGTACAGAGCACAGCATCCCAACACCTCCCACTAGCGCAGCCCCCTCTGAGTCCACCCCATCTGAGCT  962

Query  963  ACCCATATCTCCTACCACTGCTCCCAGGACAGTGAAAGAACTTACGGTATCGGCTGGAGATAACCTAATTATAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct  963  ACCCATATCTCCTACCACTGCTCCCAGGAC--------------------------------------------  992

Query 1037  CTTTACCCGACAATGAAGTTGAACTGAAGGCCTTTGTTGCGCCAGCGCCACCTGTAGAAACAACCTACAACTAT  1110
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct  993  -------------------------------------------------------AGAAACAACCTACAACTAT  1011

Query 1111  GAATGGAATTTAATAAGCCACCCCACAGACTACCAAGGTGAAATAAAACAAGGACACAAGCAAACTCTTAACCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012  GAATGGAATTTAATAAGCCACCCCACAGACTACCAAGGTGAAATAAAACAAGGACACAAGCAAACTCTTAACCT  1085

Query 1185  CTCTCAATTGTCCGTCGGACTTTATGTCTTCAAAGTCACTGTTTCTAGTGAAAACGCCTTTGGAGAAGGATTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086  CTCTCAATTGTCCGTCGGACTTTATGTCTTCAAAGTCACTGTTTCTAGTGAAAACGCCTTTGGAGAAGGATTTG  1159

Query 1259  TCAATGTCACTGTTAAGCCTGCCAGAAGAGTCAACCTGCCACCTGTAGCAGTTGTTTCTCCCCAACTGCAAGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160  TCAATGTCACTGTTAAGCCTGCCAGAAGAGTCAACCTGCCACCTGTAGCAGTTGTTTCTCCCCAACTGCAAGAG  1233

Query 1333  CTCACTTTGCCTTTGACGTCAGCCCTCATTGATGGCAGCCAAAGTACAGATGATACTGAAATAGTGAGTTATCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234  CTCACTTTGCCTTTGACGTCAGCCCTCATTGATGGCAGCCAAAGTACAGATGATACTGAAATAGTGAGTTATCA  1307

Query 1407  TTGGGAAGAAATAAACGGGCCCTTCATAGAAGAGAAGACTTCAGTTGACTCTCCCGTCTTACGCTTGTCTAACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308  TTGGGAAGAAATAAACGGGCCCTTCATAGAAGAGAAGACTTCAGTTGACTCTCCCGTCTTACGCTTGTCTAACC  1381

Query 1481  TTGATCCTGGTAACTATAGTTTCAGGTTGACTGTTACAGACTCGGACGGAGCCACTAACTCTACAACTGCAGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382  TTGATCCTGGTAACTATAGTTTCAGGTTGACTGTTACAGACTCGGACGGAGCCACTAACTCTACAACTGCAGCC  1455

Query 1555  CTAATAGTGAACAATGCTGTGGACTACCCACCAGTTGCTAATGCAGGACCAAATCACACCATAACTTTGCCCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1456  CTAATAGTGAACAATGCTGTGGACTACCCACCAGTTGCTAATGCAGGACCAAATCACACCATAACTTTGCCCCA  1529

Query 1629  AAACTCCATCACTTTGAATGGAAACCAGAGCAGTGACGATCACCAGATTGTCCTCTATGAGTGGTCCCTGGGTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1530  AAACTCCATCACTTTGAATGGAAACCAGAGCAGTGACGATCACCAGATTGTCCTCTATGAGTGGTCCCTGGGTC  1603

Query 1703  CTGGGAGTGAGGGCAAACATGTGGTCATGCAGGGAGTACAGACGCCATACCTTCATTTATCTGCAATGCAGGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1604  CTGGGAGTGAGGGCAAACATGTGGTCATGCAGGGAGTACAGACGCCATACCTTCATTTATCTGCAATGCAGGAA  1677

Query 1777  GGAGATTATACATTTCAGCTGAAGGTGACAGATTCTTCAAGGCAACAGTCTACTGCTGTGGTGACTGTGATTGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678  GGAGATTATACATTTCAGCTGAAGGTGACAGATTCTTCAAGGCAACAGTCTACTGCTGTGGTGACTGTGATTGT  1751

Query 1851  CCAGCCTGAAAACAATAGACCTCCAGTGGCTGTGGCCGGCCCTGATAAAGAGCTGATCTTCCCAGTGGAAAGTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1752  CCAGCCTGAAAACAATAGACCTCCAGTGGCTGTGGCCGGCCCTGATAAAGAGCTGATCTTCCCAGTGGAAAGTG  1825

Query 1925  CTACCCTGGATGGGAGCAGCAGCAGCGATGACCACGGCATTGTCTTCTACCACTGGGAGCACGTCAGAGGCCCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1826  CTACCCTGGATGGGAGCAGCAGCAGCGATGACCACGGCATTGTCTTCTACCACTGGGAGCACGTCAGAGGCCCC  1899

Query 1999  AGTGCAGTGGAGATGGAAAATATTGACAAAGCAATAGCCACTGTGACTGGTCTCCAGGTGGGGACCTACCACTT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1900  AGTGCAGTGGAGATGGAAAATATTGACAAAGCAATAGCCACTGTGACTGGTCTCCAGGTGGGGACCTACCACTT  1973

Query 2073  CCGTTTGACAGTGAAAGACCAGCAGGGACTGAGCAGCACGTCCACCCTCACTGTGGCTGTGAAGAAGGAAAATA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974  CCGTTTGACAGTGAAAGACCAGCAGGGACTGAGCAGCACGTCCACCCTCACTGTGGCTGTGAAGAAGGAAAATA  2047

Query 2147  ATAGTCCTCCCAGAGCCCGGGCTGGTGGCAGACATGTTCTTGTGCTTCCCAATAATTCCATTACTTTGGATGGT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2048  ATAGTCCTCCCAGAGCCCGGGCTGGTGGCAGACATGTTCTTGTGCTTCCCAATAATTCCATTACTTTGGATGGT  2121

Query 2221  TCAAGGTCTACTGATGACCAAAGAATTGTGTCCTATCTGTGGATCCGGGATGGCCAGAGTCCAGCAGCTGGAGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2122  TCAAGGTCTACTGATGACCAAAGAATTGTGTCCTATCTGTGGATCCGGGATGGCCAGAGTCCAGCAGCTGGAGA  2195

Query 2295  TGTCATCGATGGCTCTGACCACAGTGTGGCTCTGCAGCTTACGAATCTGGTGGAGGGGGTGTACACTTTCCACT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2196  TGTCATCGATGGCTCTGACCACAGTGTGGCTCTGCAGCTTACGAATCTGGTGGAGGGGGTGTACACTTTCCACT  2269

Query 2369  TGCGAGTCACCGACAGTCAGGGGGCCTCGGACACAGACACTGCCACTGTGGAAGTGCAGCCAGACCCTAGGAAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270  TGCGAGTCACCGACAGTCAGGGGGCCTCGGACACAGACACTGCCACTGTGGAAGTGCAGCCAGACCCTAGGAAG  2343

Query 2443  AGTGGCCTGGTGGAGCTGACCCTGCAGGTTGGTGTTGGGCAGCTGACAGAGCAGCGGAAGGACACCCTTGTGAG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2344  AGTGGCCTGGTGGAGCTGACCCTGCAGGTTGGTGTTGGGCAGCTGACAGAGCAGCGGAAGGACACCCTTGTGAG  2417

Query 2517  GCAGCTGGCTGTGCTGCTGAACGTGCTGGACTCGGACATTAAGGTCCAGAAGATTCGGGCCCACTCGGATCTCA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2418  GCAGCTGGCTGTGCTGCTGAACGTGCTGGACTCGGACATTAAGGTCCAGAAGATTCGGGCCCACTCGGATCTCA  2491

Query 2591  GCACCGTGATTGTGTTTTATGTACAGAACAGGCCGCCTTTCAAGGTTCTCAAAGCTGCTGAAGTGGCCCGAAAT  2664
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492  GCACCGTGATTGTGTTTTATGTACAGAGCAGGCCGCCTTTCAAGGTTCTCAAAGCTGCTGAAGTGGCCCGAAAT  2565

Query 2665  CTGCACATGCGGCTCTCAAAGGAGAAGGCTGACTTCTTGCTTTTCAAGGTCTTGAGGGTTGATACAGCAGGTTG  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566  CTGCACATGCGGCTCTCAAAGGAGAAGGCTGACTTCTTGCTTTTCAAGGTCTTGAGGGTTGATACAGCAGGTTG  2639

Query 2739  CCTTCTGAAGTGTTCTGGCCATGGTCACTGCGACCCCCTCACAAAGCGCTGCATTTGCTCTCACTTATGGATGG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640  CCTTCTGAAGTGTTCTGGCCATGGTCACTGCGACCCCCTCACAAAGCGCTGCATTTGCTCTCACTTATGGATGG  2713

Query 2813  AGAACCTTATACAGCGTTATATCTGGGATGGAGAGAGCAACTGTGAGTGGAGTATATTCTATGTGACAGTGTTG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2714  AGAACCTTATACAGCGTTATATCTGGGATGGAGAGAGCAACTGTGAGTGGAGTATATTCTATGTGACAGTGTTG  2787

Query 2887  GCTTTTACTCTTATTGTGCTAACAGGAGGTTTCACTTGGCTTTGCATCTGCTGCTGCAAAAGACAAAAAAGGAC  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2788  GCTTTTACTCTTATTGTGCTAACAGGAGGTTTCACTTGGCTTTGCATCTGCTGCTGCAAAAGACAAAAAAGGAC  2861

Query 2961  TAAAATCAGGAAAAAAACAAAGTACACCATCCTGGATAACATGGATGAACAGGAAAGAATGGAACTGAGGCCCA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862  TAAAATCAGGAAAAAAACAAAGTACACCATCCTGGATAACATGGATGAACAGGAAAGAATGGAACTGAGGCCCA  2935

Query 3035  AATATGGTATCAAGCACCGAAGCACAGAGCACAACTCCAGCCTGATGGTATCCGAGTCTGAGTTTGACAGTGAC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936  AATATGGTATCAAGCACCGAAGCACAGAGCACAACTCCAGCCTGATGGTATCCGAGTCTGAGTTTGACAGTGAC  3009

Query 3109  CAGGACACAATCTTCAGCCGAGAAAAGATGGAGAGAGGGAATCCAAAGGTTTCCATGAATGGTTCCATCAGAAA  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010  CAGGACACAATCTTCAGCCGAGAAAAGATGGAGAGAGGGAATCCAAAGGTTTCCATGAATGGTTCCATCAGAAA  3083

Query 3183  TGGAGCTTCCTTCAGTTATTGCTCAAAGGACAGA  3216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3084  TGGAGCTTCCTTCAGTTATTGCTCAAAGGACAGA  3117