Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476469
- Subject:
- NM_001030003.3
- Aligned Length:
- 1415
- Identities:
- 1131
- Gaps:
- 253
Alignment
Query 1 ATGCGACTCTCCAAAACCCTCGTCGACATGGACA---TG-----GCCGACTACAGTGCTGCACTGGACCCAGCC 66
||||.|| || ||| |..|.|.|||.||.||||
Sbjct 1 ---------------------------ATGGTCAGCGTGAACGCGCC--CCTCGGGGCTCCAGTGGA------- 38
Query 67 TACACCACCCTGGAATTTGAGAATGTGCAGGTGTTGACGATGGGCAATGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAA 140
.||.|.|| |.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 ---------------------------GAGTTCTT-----------ACGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAA 74
Query 141 CCTCAACGCGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACT 214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCAACGCGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACT 148
Query 215 ACGGTGCCTCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGC 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACGGTGCCTCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGC 222
Query 289 AGATTTAGCCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTT 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGATTTAGCCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTT 296
Query 363 CCGGGCTGGCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGG 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGGGCTGGCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGG 370
Query 437 ACAGCAGCCTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCC 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAGCAGCCTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCC 444
Query 511 GGGATCAACGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCT 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGATCAACGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCT 518
Query 585 GCTGGTTCTCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGC 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGGTTCTCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGC 592
Query 659 TCAGAGCCCATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTC 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAGAGCCCATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTC 666
Query 733 CTAGGCAATGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCT 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTAGGCAATGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCT 740
Query 807 TGACGAGCTGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCT 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGACGAGCTGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCT 814
Query 881 TCTTTGACCCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGC 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTTTGACCCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGC 888
Query 955 TTGGAGGACTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCAC 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTGGAGGACTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCAC 962
Query 1029 CTTGCAGAGCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACA 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTTGCAGAGCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACA 1036
Query 1103 ACCTGTTGCAGGAGATGCTGCTGGGA-GGTCC----GTG-------CCAAGCCCA------------------- 1145
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |.| |||.|||||
Sbjct 1037 ACCTGTTGCAGGAGATGCTGCTGGGAGGGTCCCCCAGCGATGCACCCCATGCCCACCACCCCCTGCACCCTCAC 1110
Query 1146 -----GGAGGGGC----GGG-------------GTTG------GAGTGGGGACT--CCCCAGGA---GACAG-- 1184
|.|||..| ||| |||| .|.||...||| ||.|||.| |||||
Sbjct 1111 CTGATGCAGGAACATATGGGAACCAACGTCATCGTTGCCAACACAATGCCCACTCACCTCAGCAACGGACAGAT 1184
Query 1185 GCCTCACACAGTGAGCTCACCCCTCAGCTCCT----------TGGCTTCCCCA----CTGTGCCGCTTTGGGCA 1244
|.| ||| |..|||| |||||.|||| ||| ||||| || |||.||| ||.| |
Sbjct 1185 GTC-CAC-CCCTGAG---ACCCCACAGC-CCTCACCGCCAGGTGGCT----CAGGGTCTGAGCC-CTAT----A 1243
Query 1245 AGTTGCT------------------------------------------------------------------- 1251
||.|.||
Sbjct 1244 AGCTCCTGCCGGGAGCCGTCGCCACAATCGTCAAGCCCCTCTCTGCCATCCCCCAGCCGACCATCACCAAGCAG 1317
Query 1252 --------- 1251
Sbjct 1318 GAAGTTATC 1326