Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476469
• Subject: NM_001287183.1
• Aligned Length: 1443
• Identities: 1130
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  ATGCGACTCTCCAAAACCCTCGTCGACATGGACATGGCCGACT----ACAGTGCT--GCACTGGACCCAGCCTA  68
                                             |||.|.||||    .|||.|||  .|.|.|||||       
Sbjct    1  ---------------------------------ATGTCGGACTGGGGCCAGGGCTTCCCCCAGGACC-------  34

Query   69  CACCACCCTGGAATTTGAGAATGTGCAGGTGTTGACGATGGGCAATGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAACC  142
            |||||                                         ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   35  CACCA-----------------------------------------GACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAACC  67

Query  143  TCAACGCGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACTAC  216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  TCAACGCGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACTAC  141

Query  217  GGTGCCTCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGCAG  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  142  GGTGCCTCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGCAG  215

Query  291  ATTTAGCCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTTCC  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  ATTTAGCCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTTCC  289

Query  365  GGGCTGGCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGGAC  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  GGGCTGGCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGGAC  363

Query  439  AGCAGCCTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCCGG  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  AGCAGCCTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCCGG  437

Query  513  GATCAACGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCTGC  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  GATCAACGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCTGC  511

Query  587  TGGTTCTCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGCTC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  TGGTTCTCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGCTC  585

Query  661  AGAGCCCATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTCCT  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  AGAGCCCATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTCCT  659

Query  735  AGGCAATGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCTTG  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  AGGCAATGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCTTG  733

Query  809  ACGAGCTGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCTTC  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  ACGAGCTGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCTTC  807

Query  883  TTTGACCCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGCTT  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  TTTGACCCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGCTT  881

Query  957  GGAGGACTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCACCT  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  GGAGGACTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCACCT  955

Query 1031  TGCAGAGCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACAAC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  TGCAGAGCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACAAC  1029

Query 1105  CTGTTGCAGGAGATGCTGCTGGGA-GGTCC----GTG-------CCAAGCCCA---------------------  1145
            |||||||||||||||||||||||| |||||    |.|       |||.|||||                     
Sbjct 1030  CTGTTGCAGGAGATGCTGCTGGGAGGGTCCCCCAGCGATGCACCCCATGCCCACCACCCCCTGCACCCTCACCT  1103

Query 1146  ---GGAGGGGC----GGG-------------GTTG---------------------------------------  1160
               |.|||..|    |||             ||||                                       
Sbjct 1104  GATGCAGGAACATATGGGAACCAACGTCATCGTTGCCAACACAATGCCCACTCACCTCAGCAACGGACAGATGT  1177

Query 1161  --GAGTGGGGACTCCCCAGGAGACAGGC--CTCACACAGTGAGCTCACCCCTCAGCTCCT----------TGGC  1220
              ||||||...|..||||||.|||||||  | ||| |..||||   |||||.|||| |||          ||||
Sbjct 1178  GTGAGTGGCCCCGACCCAGGGGACAGGCAGC-CAC-CCCTGAG---ACCCCACAGC-CCTCACCGCCAGGTGGC  1245

Query 1221  TTCCCCA----CTGTGCCGCTTTGGGCAAGTTGCT---------------------------------------  1251
            |    ||    |||.||| ||.|    |||.|.||                                       
Sbjct 1246  T----CAGGGTCTGAGCC-CTAT----AAGCTCCTGCCGGGAGCCGTCGCCACAATCGTCAAGCCCCTCTCTGC  1310

Query 1252  -------------------------------------  1251
                                                 
Sbjct 1311  CATCCCCCAGCCGACCATCACCAAGCAGGAAGTTATC  1347