Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476470
- Subject:
- NM_001168318.1
- Aligned Length:
- 1200
- Identities:
- 1005
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGGAGAACAAAGCTATGTACCTACACACCGTCAGCGACTGTGACACCAGCTCCATCTGTGAGGATTCCTTTGA 74
|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||.||||||.|.|||||||||.|||.||..|||||||
Sbjct 1 ATGGACAACAAAGCCATGTACCTGCACACCGTGAGTGACCGTGACAACGGCTCCATCTTTGAAGAACCCTTTGA 74
Query 75 TGGCAGGAGCCTGTCCAAGCTGAACCTGTGTGAGGATGGTCCATGTCACAAACGGCGGGCAAGCATCTGCTGTA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|...||||||||
Sbjct 75 TGGCAGGAGCCTGTCCAAGCTGAACCTGTGTGAGGATGGTCCATGTCACAAACGGCGGGCGGGAGGCTGCTGTA 148
Query 149 CCCAGCTGGGGTCCCTGTCGGCCCTGAAGCATGCTGTCCTGGGGCTCTACCTGCTGGTCTTCCTGATTCTTGTG 222
|.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CACAGCTGGGCTCCCTCTCAGCGCTGAAGCATGCAGTCCTGGGGCTGTATCTTCTGGTCTTCCTGATTCTTGTG 222
Query 223 GGCATCTTCATCTTAGCAGTGTCCAGGCCGCGCAGCTCCCCTGACGACCTGAAGGCCCTGACTCGCAATGTGAA 296
||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct 223 GGTATCTTCATCTTAGCAGTGTCCCGGCCTCGAAGCTCCCCAGATGACTTGAAGGCGCTGACTCGGAACGTCAA 296
Query 297 CCGGCTGAATGAGAGCTTCCGGGACTTGCAGCTGCGGCTGCTGCAGGCTCCGCTGCAAGCGGACCTGACGGAGC 370
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||.||.||||||||.||||
Sbjct 297 CCGGCTGAATGAGAGCCTCCGGGACATGCAGCTGCGGCTGCTGCAGGCTCCATTGCAGGCAGACCTGACAGAGC 370
Query 371 AGGTGTGGAAGGTGCAGGACGCGCTGCAGAACCAGTCAGACTCGTTGCTGGCGCTGGCGGGCGCAGTGCAGCGG 444
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||.|||||.|||...||||||.||
Sbjct 371 AGGTGTGGAAGGTTCAGGATGCGCTGCAGAACCAGACAGACTCGTTGTTGGCCCTGGCCGGCTTGGTGCAGAGG 444
Query 445 CTGGAGGGCGCGCTATGGGGGCTGCAGGCGCAGGCGGTGCAGACCGAGCAGGCGGTGGCCCTGCTGCGGGACCG 518
|||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||..|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGAGGGCACGCTGTGGGGGCTGCACGCGCAGGCGGCACAGACTGAGCAGGCGATGGCCCTGCTGCGGGACCG 518
Query 519 CACGGGCCAGCAGAGCGACACGGCGCAGCTGGAGCTCTACCAGCTGCAGGTGGAGAGCAACAGTAGCCAGCTGC 592
.||.||.||||||||.|||.|.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||.|
Sbjct 519 AACAGGACAGCAGAGTGACTCCGCACAGCTGGAACTCTACCAGCTGCAGGTGGAAAGCAATCGAAGCCAGCTAC 592
Query 593 TGCTGAGGCGCCACGCGGGCCTGCTGGACGGGCTGGCGCGCAGGGTGGGCATCCTGGGCGAGGAGCTGGCCGAC 666
|||||..|||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 593 TGCTGCAGCGCCACGCGGGCCTGCTGGATGGGCTAGCACGCAGGGTGGGGGTCCTGGGGGAGGAGCTGGCTGAC 666
Query 667 GTGGGCGGCGTGCTGCGCGGCCTCAACCACAGCCTGTCCTACGACGTGGCCCTCCACCGCACGCGGCTGCAGGA 740
||||||||.|.|||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||.||||.|||||
Sbjct 667 GTGGGCGGTGCGCTCCGTGGTCTCAACCACAGCCTGTCCTATGACGTGGCCCTGCACAGCACGTGGCTACAGGA 740
Query 741 CCTGCGGGTGCTGGTGAGCAACGCCAGCGAGGACACGCGCCGCCTGCGCCTGGCGCACGTAGGCATGGAGCTGC 814
|||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||.|||||..||||.||||.||||.|.|.|||||||.|||
Sbjct 741 CCTGCAGGTGCTGGTGAGCAATGCCAGCGCAGACACTCGCCGTATGCGGCTGGTGCACATGGACATGGAGATGC 814
Query 815 AGCTGAAGCAGGAGCTGGCCATGCTCAACGCGGTCACCGAGGACCTGCGCCTCAAGGACTGGGAGCACTCCATC 888
||||.||||||||||||||||..|||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 AGCTCAAGCAGGAGCTGGCCACACTCAACGTGGTGACCGAGGACCTGCGTCTGAAGGACTGGGAACACTCCATC 888
Query 889 GCACTGCGGAACATCTCCCTCGCGAAAGGGCCACCGGGACCCAAAGGTGATCAGGGGGATGAAGGAAAGGAAGG 962
||..||.||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||||.|||||.||
Sbjct 889 GCCTTGAGGAACATCACCCTTGCCAAAGGGCCACCGGGACCCAAAGGTGACCAAGGAAATGAAGGGAAGGAGGG 962
Query 963 CAGGCCTGGCATCCCTGGATTGCCTGGACTTCGAGGTCTGCCCGGGGAGAGAGGTACCCCAGGATTGCCCGGGC 1036
.|.|||.||.|.|||||||.|.||||||..||||||||||||.||.|||||||||..|||||||.||||.||.|
Sbjct 963 AAAGCCAGGTAGCCCTGGACTTCCTGGATCTCGAGGTCTGCCAGGAGAGAGAGGTGACCCAGGACTGCCTGGTC 1036
Query 1037 CCAAGGGCGATGATGGGAAGCTGGGGGCCACAGGACCAATGGGCATGCGTGGGTTCAAAGGTGACCGAGGCCCA 1110
|||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CCAAGGGTGATGATGGGAAGCTAGGGGCTACGGGCCCCATGGGCATGCGCGGATTCAAAGGTGATCGAGGCCCA 1110
Query 1111 AAAGGAGAGAAAGGAGAGAAAGGAGACAGAGCTGGGGATGCCAGTAAGGACATTCTGCTGGGGCCGTGGGATAT 1184
|||||||||||||||||||.||||||.||||||| || ||..||||.||
Sbjct 1111 AAAGGAGAGAAAGGAGAGAGAGGAGAGAGAGCTG-----------AA-----------TGTTGCCGAGG----- 1157
Query 1185 GGTGTTGGCACAGGGC 1200
||||
Sbjct 1158 -----TGGC------- 1161