Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476470
- Subject:
- NM_173833.6
- Aligned Length:
- 1490
- Identities:
- 1186
- Gaps:
- 295
Alignment
Query 1 ATGGAGAACAAAGCTATGTACCTACACACCGTCAGCGACTGTGACACCAGCTCCATCTGTGAGGATTCCTTTGA 74
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Sbjct 1 ATGGAGAACAAAGCTATGTACCTACACACCGTCAGCGACTGTGACACCAGCTCCATCTGTGAGGATTCCTTTGA 74
Query 75 TGGCAGGAGCCTGTCCAAGCTGAACCTGTGTGAGGATGGTCCATGTCACAAACGGCGGGCAAGCATCTGCTGTA 148
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Sbjct 75 TGGCAGGAGCCTGTCCAAGCTGAACCTGTGTGAGGATGGTCCATGTCACAAACGGCGGGCAAGCATCTGCTGTA 148
Query 149 CCCAGCTGGGGTCCCTGTCGGCCCTGAAGCATGCTGTCCTGGGGCTCTACCTGCTGGTCTTCCTGATTCTTGTG 222
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Sbjct 149 CCCAGCTGGGGTCCCTGTCGGCCCTGAAGCATGCTGTCCTGGGGCTCTACCTGCTGGTCTTCCTGATTCTTGTG 222
Query 223 GGCATCTTCATCTTAGCAGTGTCCAGGCCGCGCAGCTCCCCTGACGACCTGAAGGCCCTGACTCGCAATGTGAA 296
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Sbjct 223 GGCATCTTCATCTTAGCAGTGTCCAGGCCGCGCAGCTCCCCTGACGACCTGAAGGCCCTGACTCGCAATGTGAA 296
Query 297 CCGGCTGAATGAGAGCTTCCGGGACTTGCAGCTGCGGCTGCTGCAGGCTCCGCTGCAAGCGGACCTGACGGAGC 370
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Sbjct 297 CCGGCTGAATGAGAGCTTCCGGGACTTGCAGCTGCGGCTGCTGCAGGCTCCGCTGCAAGCGGACCTGACGGAGC 370
Query 371 AGGTGTGGAAGGTGCAGGACGCGCTGCAGAACCAGTCAGACTCGTTGCTGGCGCTGGCGGGCGCAGTGCAGCGG 444
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Sbjct 371 AGGTGTGGAAGGTGCAGGACGCGCTGCAGAACCAGTCAGACTCGTTGCTGGCGCTGGCGGGCGCAGTGCAGCGG 444
Query 445 CTGGAGGGCGCGCTATGGGGGCTGCAGGCGCAGGCGGTGCAGACCGAGCAGGCGGTGGCCCTGCTGCGGGACCG 518
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Sbjct 445 CTGGAGGGCGCGCTGTGGGGGCTGCAGGCGCAGGCGGTGCAGACCGAGCAGGCGGTGGCCCTGCTGCGGGACCG 518
Query 519 CACGGGCCAGCAGAGCGACACGGCGCAGCTGGAGCTCTACCAGCTGCAGGTGGAGAGCAACAGTAGCCAGCTGC 592
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Sbjct 519 CACGGGCCAGCAGAGCGACACGGCGCAGCTGGAGCTCTACCAGCTGCAGGTGGAGAGCAACAGTAGCCAGCTGC 592
Query 593 TGCTGAGGCGCCACGCGGGCCTGCTGGACGGGCTGGCGCGCAGGGTGGGCATCCTGGGCGAGGAGCTGGCCGAC 666
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Sbjct 593 TGCTGAGGCGCCACGCGGGCCTGCTGGACGGGCTGGCGCGCAGGGTGGGCATCCTGGGCGAGGAGCTGGCCGAC 666
Query 667 GTGGGCGGCGTGCTGCGCGGCCTCAACCACAGCCTGTCCTACGACGTGGCCCTCCACCGCACGCGGCTGCAGGA 740
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Sbjct 667 GTGGGCGGCGTGCTGCGCGGCCTCAACCACAGCCTGTCCTACGACGTGGCCCTCCACCGCACGCGGCTGCAGGA 740
Query 741 CCTGCGGGTGCTGGTGAGCAACGCCAGCGAGGACACGCGCCGCCTGCGCCTGGCGCACGTAGGCATGGAGCTGC 814
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Sbjct 741 CCTGCGGGTGCTGGTGAGCAACGCCAGCGAGGACACGCGCCGCCTGCGCCTGGCGCACGTAGGCATGGAGCTGC 814
Query 815 AGCTGAAGCAGGAGCTGGCCATGCTCAACGCGGTCACCGAGGACCTGCGCCTCAAGGACTGGGAGCACTCCATC 888
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Sbjct 815 AGCTGAAGCAGGAGCTGGCCATGCTCAACGCGGTCACCGAGGACCTGCGCCTCAAGGACTGGGAGCACTCCATC 888
Query 889 GCACTGCGGAACATCTCCCTCGCGAAAGGGCCACCGGGACCCAAAGGTGATCAGGGGGATGAAGGAAAGGAAGG 962
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Sbjct 889 GCACTGCGGAACATCTCCCTCGCGAAAGGGCCACCGGGACCCAAAGGTGATCAGGGGGATGAAGGAAAGGAAGG 962
Query 963 CAGGCCTGGCATCCCTGGATTGCCTGGACTTCGAGGTCTGCCCGGGGAGAGAGGTACCCCAGGATTGCCCGGGC 1036
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Sbjct 963 CAGGCCTGGCATCCCTGGATTGCCTGGACTTCGAGGTCTGCCCGGGGAGAGAGGTACCCCAGGATTGCCCGGGC 1036
Query 1037 CCAAGGGCGATGATGGGAAGCTGGGGGCCACAGGACCAATGGGCATGCGTGGGTTCAAAGGTGACCGAGGCCCA 1110
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Sbjct 1037 CCAAGGGCGATGATGGGAAGCTGGGGGCCACAGGACCAATGGGCATGCGTGGGTTCAAAGGTGACCGAGGCCCA 1110
Query 1111 AAAGGAGAGAAAGGAGAGAAAGGAGACAGAGCTGGGGATGCCAGT------AAGGAC---ATTCTGCTGGGGCC 1175
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Sbjct 1111 AAAGGAGAGAAAGGAGAGAAAGGAGACAGAGCTGGGGATGCCAGTGGCGTGGAGGCCCCGATGATGAT----CC 1180
Query 1176 G--TGG-GATATGG----TGTTGGCAC-AGGGC----------------------------------------- 1200
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Sbjct 1181 GCCTGGTGA-ATGGCTCAGGTCCGCACGAGGGCCGCGTGGAAGTGTACCACGACCGGCGTTGGGGCACCGTGTG 1253
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1254 TGACGACGGCTGGGACAAGAAGGACGGAGACGTGGTGTGCCGCATGCTCGGCTTCCGCGGTGTGGAGGAGGTGT 1327
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1328 ACCGCACAGCTCGATTCGGGCAAGGCACTGGGAGGATCTGGATGGATGACGTTGCCTGCAAGGGCACAGAGGAA 1401
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1402 ACCATCTTCCGCTGCAGCTTCTCCAAATGGGGGGTGACAAACTGTGGACATGCCGAAGATGCCAGCGTGACATG 1475
Query 1201 ---------- 1200
Sbjct 1476 CAACAGACAC 1485