Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476514
• Subject: XM_017013199.1
• Aligned Length: 1665
• Identities: 1542
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGACGCTGCGCGCGGCCGTCTTCGACCTTGACGGGGTGCTGGCGCTGCCAGCGGTGTTCGGCGTCCTCGGCCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGCTGCGCGCGGCCGTCTTCGACCTTGACGGGGTGCTGGCGCTGCCAGCGGTGTTCGGCGTCCTCGGCCG  74

Query   75  CACGGAGGAGGCCCTGGCGCTGCCCAGAGGACTTCTGAATGATGCTTTCCAGAAAGGGGGACCAGAGGGTGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACGGAGGAGGCCCTGGCGCTGCCCAGAGGACTTCTGAATGATGCTTTCCAGAAAGGGGGACCAGAGGGTGCCA  148

Query  149  CTACCCGGCTTATGAAAGGAGAGATCACACTTTCCCAGTGGATACCACTCATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTACCCGGCTTATGAAAGGAGAGATCACACTTTCCCAGTGGATACCACTCATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGC  222

Query  223  TCCGAGACCGCTAAAGTCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCGAGACCGCTAAAGTCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAG  296

Query  297  AAAGATCAACCGCCCCATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAGATCAACCGCCCCATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCA  370

Query  371  ACACCTGGCTGGACGACCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACACCTGGCTGGACGACCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGAC  444

Query  445  TTCCTGATAGAGTCGTGTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCCTGATAGAGTCGTGTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCT  518

Query  519  GAAGGCCAGCCCCAGTGAGGTCGTTTTTTTGGATGACATCGGGGCTAATCTGAAGCCAGCCCGTGACTTGGGAA  592
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  519  GAAGGCCAGCCCCAGTG---------------------------------------------------------  535

Query  593  TGGTCACCATCCTGGTCCAGGACACTGACACGGCCCTGAAAGAACTGGAGAAAGTGACCGGAATCCAGCTTCTC  666
                                                                              ||||||||
Sbjct  536  ------------------------------------------------------------------AGCTTCTC  543

Query  667  AATACCCCGGCCCCTCTGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  AATACCCCGGCCCCTCTGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAG  617

Query  741  GGTCCGTCTGCATTTTGTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  GGTCCGTCTGCATTTTGTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGT  691

Query  815  ATTCTTGGAGGTACCAGATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  ATTCTTGGAGGTACCAGATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTAT  765

Query  889  GGAGAGTCATCTGCTCCTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  GGAGAGTCATCTGCTCCTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCT  839

Query  963  GGATAAACTGGGCCTCTCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  GGATAAACTGGGCCTCTCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTC  913

Query 1037  TCTTCTACCCCGAGAGAGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  TCTTCTACCCCGAGAGAGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCC  987

Query 1111  CCTTTGGAGAGTATCAAAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  CCTTTGGAGAGTATCAAAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGC  1061

Query 1185  TGAACTGGAACAGAACCTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  TGAACTGGAACAGAACCTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGC  1135

Query 1259  ATAAAGTCTGTGAAGCGGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  ATAAAGTCTGTGAAGCGGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAG  1209

Query 1333  GAGGAAATCCAGTTCTATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  GAGGAAATCCAGTTCTATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACAT  1283

Query 1407  GGAAAGGAACTGGAAGTGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  GGAAAGGAACTGGAAGTGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGG  1357

Query 1481  AGAAGGACTTCGTGCTCGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  AGAAGGACTTCGTGCTCGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACAC  1431

Query 1555  ATTGAGGACTGTGGGCACTGGACACAGATGGACAAGCCAACCGAGGTGAATCAGATCCTCATTAAGTGGCTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432  ATTGAGGACTGTGGGCACTGGACACAGATGGACAAGCCAACCGAGGTGAATCAGATCCTCATTAAGTGGCTGGA  1505

Query 1629  TTCTGATGCCCGGAACCCACCGGTGGTCTCAAAGATG  1665
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506  TTCTGATGCCCGGAACCCACCGGTGGTCTCAAAGATG  1542