Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476527
• Subject: NM_177387.3
• Aligned Length: 1221
• Identities: 1101
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGA---AGCAGCAGCATCCCGGCGGCGGCGCGGATCCCTGGCCCCATGGGGCCCCTATGGGGGGCGC  71
            ||||||||||   |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGAAGCAGCAGCAGCATCCCGGCGGCGGCACGGATCCCTGGCCCCATGGGGCCCCTGTGGGGGGCGC  74

Query   72  CCCTCCGGGCCTGGGCAGCTGGAAGCGTCGGGTGCCCCTGCTGCCTTTCCTGCGCTTCTCCCTCCGGGACTACG  145
            |||||||.|||||||||||||.|||||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCTCCGTGCCTGGGCAGCTGCAAGCGCCGGATCCCGCTGCTGCCTTTCCTGCGCTTCTCCCTCCGGGACTACG  148

Query  146  GCTTCTGCATGGCCACCCTGCTGGTCTTCTGCCTGGGCTCCCTCCTCTATCAGCTCAGCGGGGGACCCCCTCGC  219
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTTTCTGCATGGCTACCCTGCTGGTCTTCTGCCTGGGCTCCCTCTTCTACCAGCTCAGCGGGGGACCCCCTCGC  222

Query  220  TTCCTGCTCGACCTGCGGCAGTACTTGGGAAATTCCACTTACTTGGATGACCATGGACCACCTCCTAGTAAGGT  293
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTGCTCGACCTGCGGCAGTATTTGGGAAATTCCACTTACTTGGATGACCATGGACCACCTCCTAGTAAGGT  296

Query  294  ACTACCTTTCCCAAGCCAGGTGGTGTACAACAGGGTAGGCAAGTGTGGGAGCCGTACTGTGGTCTTGCTTCTGA  367
            .||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTTCCCTTCCCCAGCCAGGTGGTGTACAACAGAGTTGGCAAGTGTGGCAGTCGTACCGTGGTCTTGCTTCTGA  370

Query  368  GAATCTTGTCGGAGAAGCACGGATTTAATTTGGTCACATCAGACATTCACAACAAAACCAGGCTTACTAAAAAT  441
            ||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  371  GAATCTTGTCAGAGAAGCACGGCTTCAATTTGGTCACATCAGACATTCACAACAAGACCCGGCTTACTAAAAAT  444

Query  442  GAACAAATGGAACTGATTAAAAATATAAGTACTGCCGAACAACCCTATTTATTCACTCGACATGTTCATTTCCT  515
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||.||.|||||
Sbjct  445  GAACAAATGGAACTGATTAAGAATATAAGTACCGCCGAACAGCCCTATTTATTCACGAGACATGTCCACTTCCT  518

Query  516  CAACTTCTCAAGGTTTGGAGGAGACCAGCCTGTCTACATCAACATCATTAGAGACCCCGTCAACCGGTTCTTAT  589
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||...|.||..|.|
Sbjct  519  CAACTTCTCCAGGTTTGGAGGAGACCAGCCTGTCTACATCAACATCATCAGAGACCCCGTCAGTAGATTTCTGT  592

Query  590  CCAACTATTTTTTCCGTCGCTTTGGAGACTGGAGAGGGGAACAAAATCACATGATCCGCACCCCCAGCATGAGG  663
            |.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTAACTATTTCTTCCGTCGCTTTGGAGATTGGAGAGGGGAACAGAATCACATGATCCGCACCCCCAGCATGAGG  666

Query  664  CAGGAGGAGCGCTACCTGGATATCAATGAGTGTATTCTTGAAAACTATCCCGAGTGCTCCAACCCCAGGTTATT  737
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||
Sbjct  667  CAGGAGGAGCGCTACCTGGACATCAATGAGTGCATTCTGGAAAACTACCCTGAGTGTTCCAACCCCAGGCTGTT  740

Query  738  TTACATCATTCCGTACTTTTGTGGACAGCATCCCAGATGCAGGGAGCCTGGTGAATGGGCCCTTGAGAGAGCAA  811
            |||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||.|
Sbjct  741  TTACATCATCCCATATTTCTGTGGACAGCACCCCAGATGTAGGGAGCCCGGCGAGTGGGCGCTGGAGCGGGCCA  814

Query  812  AGCTGAACGTGAATGAAAACTTCCTGCTCGTGGGGATTCTTGAAGAGTTGGAAGATGTGCTGCTGTTACTGGAA  885
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGCTGAACGTGAACGAAAACTTCCTGCTCGTGGGGATCCTGGAGGAGCTGGAAGATGTGCTGCTCTTACTGGAA  888

Query  886  AGATTTTTACCTCATTACTTCAAGGGCGTGCTCAGTATCTACAAAGACCCAGAGCACAGGAAGCTTGGAAACAT  959
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  889  AGATTTTTACCTCATTACTTCAAGGGTGTGCTGAGCATCTACAAGGACCCAGAGCACAGGAAACTTGGCAACAT  962

Query  960  GACTGTGACGGTGAAGAAGACTGTCCCCTCTCCTGAGGCTGTGCAGATCCTCTACCAGCGGATGAGATACGAGT  1033
            |||||||||.||||.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  GACTGTGACCGTGAGGAAGACTGTCCCCTCCCCCGAGGCGGTGCAGATTCTCTACCAGCGAATGAGATACGAGT  1036

Query 1034  ACGAGTTTTACCACTACGTCAAAGAGCAGTTCCACCTGCTGAAGCGCAAGTTTGGACTTAAGTCTCACGTCAGC  1107
            |||||||.|||||||||||||.|||.||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||.|||.|||
Sbjct 1037  ACGAGTTCTACCACTACGTCAGAGAACAATTCCACCTGCTCAAGCGCAAGCTTGGACTGAAGTCTCGCGTGAGC  1110

Query 1108  AAGCCCCCCCTGAGGCCACACTTCTTTATCCCAACTCCACTGGAAACCGAGGAGCCAATCGACGATGAAGAACA  1181
            ...||.|||.||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1111  GGACCTCCCGTGAGACCACAGTTCTTCATCCCCACGCCCCTGGAGACGGAGGAGCCAATCGACGACGAGGAGCA  1184

Query 1182  GGATGATGAAAAGTGGCTGGAAGATATTTATAAGAGG  1218
            .|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATGACGAAAAATGGCTAGAAGATATTTATAAGAGG  1221