Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476589
• Subject: XM_006521351.2
• Aligned Length: 1646
• Identities: 1360
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGGATCCCATGGAACTGAGAAATGTCAACATCGAACCAGATGATGAGAGCAGCAGTGGAGAAAGTGCTCCAGA  74
            |||||.|||||||||||||..||.||||.|||||||||.||.|..||.|||.||||.||.||.|||..||..||
Sbjct    1  ATGGACCCCATGGAACTGAACAACGTCAGCATCGAACCCGACGGAGACAGCTGCAGCGGGGACAGTATTCAGGA  74

Query   75  TAGCTACATCGGGATAGGAAATTCAGAAAAGGCAGCAATGAGCAGTCAATTTGCTAATGAAGACACTGAAAGTC  148
            .|||||||.|||.||.|.|||.||.||.||||..||.||||.|||.|||||||||||||||||..|.|||||||
Sbjct   75  CAGCTACACCGGCATGGAAAACTCCGACAAGGACGCCATGAACAGCCAATTTGCTAATGAAGATGCCGAAAGTC  148

Query  149  AGAAATTCCTGACAAATGGATTTTTGGGGAAAAAGAAGCTGGCAGATTATGCCGATGAACACCATCCCGGAACC  222
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||||..
Sbjct  149  AGAAGTTCCTGACAAATGGGTTTTTAGGGAAGAAGAAGCTAGCCGATTACGCGGATGAGCATCACCCTGGAATG  222

Query  223  ACTTCCTTTGGAATGTCTTCATTTAACCTGAGTAATGCCATCATGGGCAGTGGGATCCTGGGCTTGTCCTATGC  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct  223  ACTTCCTTTGGAATGTCCTCATTTAACCTGAGCAACGCCATCATGGGCAGTGGGATCTTAGGCTTGTCCTATGC  296

Query  297  CATGGCCAACACAGGGATCATACTTTTTATAATCATGCTGCTTGCTGTGGCAATATTATCACTGTATTCAGTTC  370
            ||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||.||.||.||.||||
Sbjct  297  CATGGCCAACACCGGGATCATCCTTTTTATAATCATGCTGCTTACTGTGGCAATACTCTCGCTCTACTCGGTTC  370

Query  371  ACCTTTTATTAAAAACAGCCAAGGAAGGAGGGTCTTTGATTTATGAAAAATTAGGAGAAAAGGCATTTGGATGG  444
            |||||||..|.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct  371  ACCTTTTGCTGAAGACAGCCAAGGAAGGAGGGTCTCTAATCTATGAAAAATTGGGCGAGAAAGCATTTGGATGG  444

Query  445  CCGGGAAAAATTGGAGCTTTTGTTTCCATTACAATGCAGAACATTGGAGCAATGTCAAGCTACCTCTTTATCAT  518
            ||.||.|||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  CCTGGGAAAATTGGAGCCTTCATCTCTATTACAATGCAGAACATTGGAGCCATGTCAAGCTACCTCTTCATCAT  518

Query  519  TAAATATGAACTACCTGAAGTAATCAGAGCATTCATGGGACTTGAAGAAAATACTGGAGAATGGTACCTCAATG  592
            |||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  TAAGTACGAACTGCCTGAAGTAATCAGAGCATTCATGGGACTTGAAGAAAACACTGGGGAATGGTACCTCAACG  592

Query  593  GCAACTACCTCATCATATTTGTGTCTGTTGGAATTATTCTTCCACTTTCGCTCCTTAAAAATTTAGGTTATCTT  666
            |||||||||||.||.||||||||||.||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  593  GCAACTACCTCGTCTTATTTGTGTCCGTGGGGATCATCCTCCCGCTCTCTCTCCTTAAAAATTTAGGCTACCTT  666

Query  667  GGCTATACCAGTGGATTTTCTCTTACCTGCATGGTGTTTTTTGTTAGTGTGGTGATTTACAAGAAATTCCAAAT  740
            |||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GGCTACACCAGTGGATTTTCTCTCTCCTGCATGGTGTTTTTCGTCAGTGTGGTGATTTACAAAAAATTCCAAAT  740

Query  741  ACCCTGCCCTCTACCTGTTTTGGATCACAGTGTTGGAAATCTGTCATTCAACAACACGCTTCCAATGCATGTGG  814
            .|||||||||||.||||.|.|||||||||.....|||||||||.|.|||||||||||.|||||.||.||..||.
Sbjct  741  TCCCTGCCCTCTGCCTGCTCTGGATCACAACAACGGAAATCTGACGTTCAACAACACACTTCCGATTCACATGA  814

Query  815  TAATGTTACCCAACAACTCTGAGAGTTCTGATGTGAACTTCATGATGGATTACACCCACCGCAATCCTGCAGGG  888
            |...|.|.||.||..||||.|||||.||.|.||||||||||||||||||||||.|.||||.|||.||.||.|||
Sbjct  815  TCTCGCTGCCTAATGACTCGGAGAGCTCGGGTGTGAACTTCATGATGGATTACGCTCACCACAACCCAGCTGGG  888

Query  889  CTGGATGAGAACCAGGCCAAGGGCTCTCTTCATGACAGTGGAGTAGAATATGAAGCTCATAGTGATGACAAGTG  962
            |||||||||||.||||.|...|||.|||||||...||.|||.||.||.||.|||||.||..|||.|||.||.||
Sbjct  889  CTGGATGAGAAGCAGGTCGCAGGCCCTCTTCACAGCAATGGCGTGGAGTACGAAGCCCAGGGTGCTGAGAAATG  962

Query  963  TGAACCCAAATACTTTGTATTCAACTCCCGGACGGCCTATGCAATTCCTATCCTAGTATTTGCTTTTGTATGCC  1036
            ..||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||||||||.||||
Sbjct  963  CCAACCAAAATACTTTGTGTTCAATTCCCGGACGGCCTATGCAATCCCAATCCTGGCTTTTGCTTTTGTCTGCC  1036

Query 1037  ACCCTGAGGTCCTTCCCATCTACAGTGAACTTAAAGATCGGTCCCGGAGAAAAATGCAAACGGTGTCAAATATT  1110
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1037  ACCCTGAGGTCCTTCCCATCTACAGCGAGCTTAAAGATCGATCCCGCAGAAAGATGCAGACGGTGTCCAACATT  1110

Query 1111  TCCATCACGGGGATGCTTGTCATGTACCTGCTTGCCGCCCTCTTTGGTTACCTAACCTTCTATGGAGAAGTTGA  1184
            ||||||.|.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|.||||||.||.||.|||||
Sbjct 1111  TCCATCTCAGGCATGCTCGTCATGTACCTTCTTGCGGCCCTCTTTGGTTATCTGAGCTTCTACGGGGACGTTGA  1184

Query 1185  AGATGAATTACTTCATGCCTACAGCAAAGTGTATACATTAGACATCCCTCTTCTCATGGTTCGCCTGGCAGTCC  1258
            |||.||..|.||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.|...|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  AGACGAGCTGCTGCATGCTTACAGCAAGGTCTACACATTTGATACGGCTCTTCTCATGGTGCGCCTGGCAGTCC  1258

Query 1259  TTGTGGCAGTAACACTAACTGTGCCCATTGTCCTCTTCCCAATTCGTACATCAGTGATCACACTGTTATTTCCC  1332
            |.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||.|.||||| 
Sbjct 1259  TGGTGGCAGTGACACTGACCGTGCCCATCGTGCTGTTCCCGATCCGTACTTCGGTGATCACACTGCTGTTTCC-  1331

Query 1333  AAACG--ACCCTTCAGCTGGATACGA--CATTTCCTGATTGCAGCTGTGCTTATTGCACTTAATAATGTTCTGG  1402
             ||.|  |||||||||||||.|  ||  ||||||..|||.||.||..|..|.||.|||||.||.||..|.||||
Sbjct 1332  -AAGGAAACCCTTCAGCTGGCT--GAAGCATTTCGGGATCGCTGCAATCATCATCGCACTCAACAACATCCTGG  1402

Query 1403  TCATCCTTGTGCCAACTATAAAATACATCTTCGGATTCATAGGGGCTTCTTCTGCCACTATGCTGATTTTTATT  1476
            |||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1403  TCATCCTCGTGCCTACCATCAAATACATCTTTGGATTCATAGGGGCTTCTTCTGCCACTATGCTGATTTTCATT  1476

Query 1477  CTTCCAGCAGTTTTTTATCTTAAACTTGTCAAGAAAGAAACTTTTAGGTCACCCCAAAAGGTCGGGGCTTTAAT  1550
            |||||.||.|..||||||||.||.||.||||||||||||.||.|.||.||||||||.|||.|.||||||||..|
Sbjct 1477  CTTCCGGCTGCGTTTTATCTCAAGCTCGTCAAGAAAGAACCTCTAAGATCACCCCAGAAGATTGGGGCTTTGGT  1550

Query 1551  TTTCCTTGTGGTTGGAA-TATTCTTCATGATTGGAAGCATGGCACTCATTATAATTGACTGGATTTATGATCCT  1623
            .|||||||||..||||| |||| ||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||..|.||.
Sbjct 1551  CTTCCTTGTGACTGGAATTATT-TTCATGATGGGAAGCATGGCGCTCATTATACTCGACTGGATCTACAACCCG  1623

Query 1624  CCAAATTCCAAGCATCAC  1641
            ||.|||.||||.||.|||
Sbjct 1624  CCGAATCCCAATCACCAC  1641