Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476593
• Subject: NM_007386.2
• Aligned Length: 2668
• Identities: 2321
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGAGCAACCCATTCGCACACCTTGCTGAGCCATTGGATCCTGTACAACCAGGAAAGAAATTCTTCAATTTGAA  74
            ||||..||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|||..|||||||||||||..||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAAGAACCCATTTGCACACCTTGCTGAGCCCTTGGACGCTGCCCAACCAGGAAAGAGGTTCTTCAACTTGAA  74

Query   75  TAAATTGGAGGATTCAAGATATGGGCGCTTACCATTTTCGATCAGAGTTCTTCTGGAAGCAGCCATTCGGAATT  148
            ||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||.|
Sbjct   75  TAAATTGGAGGACTCAAGATACGGACGCTTACCATTTTCTATCAGAGTTCTCCTGGAGGCAGCCGTTCGGAACT  148

Query  149  GTGATGAGTTTTTGGTGAAGAAACAGGATATTGAAAATATTCTACATTGGAATGTCACGCAGCACAAGAACATA  222
            |||||||||||.|||||||||||.|.||.||.||.|||||.||..||||||||||||.|||.||.|||||||||
Sbjct  149  GTGATGAGTTTCTGGTGAAGAAAAATGACATCGAGAATATCCTGAATTGGAATGTCATGCAACATAAGAACATA  222

Query  223  GAAGTGCCATTTAAGCCTGCTCGTGTCATCCTGCAGGACTTTACGGGTGTGCCCGCTGTGGTTGACTTTGCTGC  296
            ||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct  223  GAAGTGCCGTTTAAGCCAGCCCGAGTCATACTGCAAGACTTTACGGGTGTGCCTGCTGTGGTGGATTTTGCAGC  296

Query  297  AATGCGTGATGCTGTGAAAAAGTTAGGAGGAGATCCAGAGAAAATAAACCCTGTCTGCCCTGCTGATCTTGTAA  370
            ||||||.|||||||||||.|||||.|||||..||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  297  AATGCGCGATGCTGTGAAGAAGTTGGGAGGGAATCCGGAGAAAATTAACCCTGTCTGCCCCGCTGACCTTGTAA  370

Query  371  TAGATCATTCCATCCAGGTTGATTTCAACAGAAGGGCAGACAGTTTACAGAAGAATCAAGACCTGGAATTTGAA  444
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  TTGATCATTCCATCCAGGTTGATTTCAACAGAAGGGCAGACAGTTTACAGAAGAATCAAGACCTGGAGTTTGAA  444

Query  445  AGAAATAGAGAGCGATTTGAATTTTTAAAGTGGGGTTCCCAGGCTTTTCACAACATGCGGATTATTCCCCCTGG  518
            |||||||.|||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||..||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  445  AGAAATAAAGAACGATTTGAATTTCTAAAGTGGGGTTCCCAGGCCTTTTGCAACATGCGGATAATCCCTCCTGG  518

Query  519  CTCAGGAATCATCCACCAGGTGAATTTGGAATATTTGGCAAGAGTGGTATTTGATCAGGATGGATATTATTACC  592
            |||.||||||||.|||||.|||||..||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||..||.||||
Sbjct  519  CTCGGGAATCATTCACCAAGTGAACCTGGAGTATTTGGCAAGAGTAGTGTTTGATCAGGATGGATGCTACTACC  592

Query  593  CAGACAGCCTCGTGGGCACAGACTCGCACACTACCATGATTGATGGCTTGGGCATTCTTGGTTGGGGTGTCGGT  666
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||..||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  CAGACAGCCTCGTGGGCACAGATTCACACACGACCATGATTGACGGCCTGGGAGTTCTTGGTTGGGGTGTGGGT  666

Query  667  GGTATTGAAGCAGAAGCTGTCATGCTGGGTCAGCCAATCAGTATGGTGCTTCCTCAGGTGATTGGCTACAGGCT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct  667  GGTATTGAAGCAGAAGCTGTCATGCTGGGTCAGCCCATCAGCATGGTGCTTCCCCAGGTGATTGGCTACAAGCT  740

Query  741  GATGGGGAAGCCCCACCCTCTGGTAACATCCACTGACATCGTGCTCACCATTACCAAGCACCTCCGCCAGGTTG  814
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  741  GATGGGGAAGCCTCACCCTCTGGTGACATCCACGGACATCGTGCTCACCATTACCAAGCACCTCCGACAAGTGG  814

Query  815  GGGTAGTGGGCAAATTTGTCGAGTTCTTCGGGCCTGGAGTAGCCCAGTTGTCCATTGCTGACCGAGCTACGATT  888
            |.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGTTGTGGGCAAATTTGTGGAGTTTTTCGGGCCAGGAGTGGCTCAGCTGTCCATTGCTGACCGAGCTACGATT  888

Query  889  GCTAACATGTGTCCAGAGTACGGAGCAACTGCTGCCTTTTTCCCAGTTGATGAAGTTAGTATCACGTACCTGGT  962
            ||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||.|
Sbjct  889  GCCAATATGTGCCCAGAGTATGGTGCGACAGCAGCCTTCTTCCCGGTTGATGAAGTTAGCATCGCGTACCTGCT  962

Query  963  GCAAACAGGTCGTGATGAAGAAAAATTAAAGTATATTAAAAAATATCTTCAGGCTGTAGGAATGTTTCGAGATT  1036
            |||.|||||.||.||.|||||.|||.|.|||.|.|||.|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  GCAGACAGGCCGCGAGGAAGACAAAGTCAAGCACATTCAGAAGTATCTTCAGGCTGTAGGCATGTTTCGAGATT  1036

Query 1037  TCAATGACCCTTCTCAAGACCCAGACTTCACCCAGGTTGTGGAATTAGATTTGAAAACAGTAGTGCCTTGCTGT  1110
            ||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037  TCAACGACACCTCTCAAGACCCAGACTTCACTCAGGTTGTGGAGTTAGATCTGAAAACAGTTGTGCCTTGCTGC  1110

Query 1111  AGTGGACCCAAAAGGCCTCAGGACAAAGTTGCTGTGTCCGACATGAAAAAGGACTTTGAGAGCTGCCTTGGAGC  1184
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGGACCCAAAAGACCTCAGGACAAAGTCGCGGTGTCTGAGATGAAAAAGGACTTTGAAAGCTGCCTTGGAGC  1184

Query 1185  CAAGCAAGGATTTAAAGGATTCCAAGTTGCTCCTGAACATCATAATGACCATAAGACCTTTATCTATGATAACA  1258
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|.|||.|||||||..|||||.||..|||||..|||||
Sbjct 1185  CAAGCAAGGATTTAAAGGTTTCCAAGTTGCTCCAGACCGTCACAATGACCGCAAGACGTTCCTCTATAGTAACA  1258

Query 1259  CTGAATTCACCCTTGCTCATGGTTCTGTGGTCATTGCTGCCATTACTAGCTGCACAAACACCAGTAATCCGTCT  1332
            .|||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1259  GTGAATTCACTCTCGCTCATGGCTCTGTGGTAATCGCTGCCATCACTAGCTGCACAAACACCAGCAATCCATCC  1332

Query 1333  GTGATGTTAGGGGCAGGATTGTTAGCAAAGAAAGCTGTGGATGCTGGCCTGAACGTGATGCCTTACATCAAAAC  1406
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||..||||.|||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGATGTTAGGAGCAGGATTGTTAGCAAAGAAAGCTGTGGAGGCGGGGCTGAGTGTGAAGCCTTACATCAAAAC  1406

Query 1407  TAGCCTGTCTCCTGGGAGTGGCGTGGTCACCTACTACCTACAAGAAAGCGGAGTCATGCCTTATCTGTCTCAGC  1480
            .||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|.|||.||.||||||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1407  CAGCCTGTCTCCTGGAAGTGGAGTGGTCACCTACTACCTTCGAGAGAGTGGAGTCATGCCTTACCTGTCCCAGT  1480

Query 1481  TTGGGTTTGACGTGGTGGGCTATGGCTGCATGACCTGCATTGGCAACAGTGGGCCTTTACCTGAACCTGTGGTA  1554
            |.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||..|.||||||||||||||.
Sbjct 1481  TAGGGTTTGATGTGGTGGGCTACGGCTGCATGACCTGCATCGGCAACAGTGGACCCCTTCCTGAACCTGTGGTC  1554

Query 1555  GAAGCCATCACACAGGGAGACCTTGTAGCTGTTGGAGTACTATCTGGAAACAGGAATTTTGAAGGTCGAGTTCA  1628
            ||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1555  GAGGCAATCACCCAGGGAGACCTCGTAGCTGTTGGCGTTCTGTCTGGGAATAGGAATTTTGAAGGCCGAGTCCA  1628

Query 1629  CCCCAACACCCGGGCCAACTATTTAGCCTCTCCCCCCT-TAGTAATAGCATATGCAATTGCTGGAACCATCAGA  1701
            .||.|||||.||.||||||||.|||||.|| ||||||| |.||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.
Sbjct 1629  TCCTAACACACGAGCCAACTACTTAGCATC-CCCCCCTCTGGTAATAGCATATGCGATTGCAGGCACCGTCAGG  1701

Query 1702  ATCGACTTTGAGAAAGAGCCATTGGGAGTAAATGCAAAGGGACAGCAGGTATTTCTGAAAGATATCTGGCCGAC  1775
            ||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||.||||.|.|||.||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1702  ATTGACTTCGAGAAAGAGCCTTTGGGAGTGAACGCACAGGGCCGGCAAGTGTTTCTGAAGGACATCTGGCCCAC  1775

Query 1776  TAGAGACGAGATCCAGGCAGTGGAGCGTCAGTATGTCATCCCGGGGATGTTTAAGGAAGTCTATCAGAAAATAG  1849
            ..||||.|||||||||||.|||||..|.|||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1776  GCGAGATGAGATCCAGGCGGTGGAAAGGCAGCATGTCATCCCCGGGATGTTTAAGGAGGTCTATCAGAAAATAG  1849

Query 1850  AGACTGTGAATGAAAGCTGGAATGCCTTAGCAACCCCATCAGATAAGCTGTTTTTCTGGAATTCCAAATCTACG  1923
            |||||||.||..||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||.|...||||||.||||||||||.
Sbjct 1850  AGACTGTAAACAAAAGCTGGAATGCCTTAGCAGCCCCGTCAGAGAAGCTGTATGCGTGGAATCCCAAATCTACT  1923

Query 1924  TATATCAAATCACCACCATTCTTTGAAAACCTGACTTTGGATCTTCAGCCCCCTAAATCTATAGTGGATGCCTA  1997
            ||.||.||.||.||||||||||||||||.|.|||||||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1924  TACATTAAGTCGCCACCATTCTTTGAAAGCTTGACTTTAGATCTCCAGCCACCCAAGTCCATAGTGGATGCCTA  1997

Query 1998  TGTGCTGCTAAATTTGGGAGATTCGGTAACAACTGACCACATCTCCCCAGCTGGAAATATTGCAAGAAACAGTC  2071
            ||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1998  TGTGCTACTGAATTTAGGAGATTCAGTAACAACGGACCATATCTCTCCCGCCGGCAATATTGCAAGAAACAGCC  2071

Query 2072  CTGCTGCTCGCTACTTAACTAACAGAGGCCTAACTCCACGAGAATTCAACTCCTATGGCTCCCGCCGAGGTAAT  2145
            ||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2072  CTGCGGCTCGCTACTTGACGAACAGAGGCCTAACACCACGAGAGTTCAACTCCTATGGCTCCCGCCGGGGTAAC  2145

Query 2146  GACGCCGTCATGGCACGGGGAACATTTGCCAACATTCGCTTGTTAAACAGATTTTTGAACAAGCAGGCACCACA  2219
            ||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||||..|||.||||||||||||||||.||
Sbjct 2146  GACGCCATCATGGCCCGGGGGACATTTGCCAACATTCGCTTGCTGAACAAGTTTCTGAACAAGCAGGCACCTCA  2219

Query 2220  GACTATCCATCTGCCTTCTGGGGAAATCCTTGATGTGTTTGATGCTGCTGAGCGGTACCAGCAGGCAGGCCTTC  2293
            ||||.|||||||.||.||.||.||||.|||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 2220  GACTGTCCATCTCCCCTCAGGAGAAACCCTTGATGTATTCGACGCTGCTGAGCGGTACCAGCAGGCTGGACTTC  2293

Query 2294  CCCTGATCGTTCTGGCTGGCAAAGAGTACGGTGCAGGCAGCTCCCGAGACTGGGCAGCTAAGGGCCCTTTCCTG  2367
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2294  CCCTGATTGTTCTGGCTGGGAAAGAATACGGTTCAGGCAGCTCCCGAGACTGGGCAGCCAAAGGCCCTTTCCTG  2367

Query 2368  CTGGGAATCAAAGCCGTCCTGGCCGAGAGCTACGAGCGCATTCACCGCAGTAACCTGGTTGGGATGGGTGTGAT  2441
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||
Sbjct 2368  CTGGGAATCAAAGCTGTCCTGGCAGAGAGCTATGAGCGCATTCACCGCAGCAACTTGGTTGGCATGGGGGTGAT  2441

Query 2442  CCCACTTGAATATCTCCCTGGTGAGAATGCAGATGCCCTGGGGCTCACAGGGCAAGAACGATACACTATCATTA  2515
            |||.|||||.||||||||||||||.|.||||||..|.|||||.||||||||.|..|||.||||||||||||..|
Sbjct 2442  CCCCCTTGAGTATCTCCCTGGTGAAACTGCAGACTCTCTGGGACTCACAGGTCGGGAAAGATACACTATCAACA  2515

Query 2516  TTCCAGAAAACCTCAAACCACAAATGAAAGTCCAGGTCAAGCTGGATACTGGCAAGACCTTCCAGGCTGTCATG  2589
            |.||.|||.|||||||.||.|..||||..||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2516  TCCCTGAAGACCTCAAGCCTCGCATGACGGTGCAGATCAAGCTGGACACTGGGAAGACCTTCCAGGCCGTGATG  2589

Query 2590  AGGTTTGACACTGATGTGGAGCTCACTTATTTCCTCAACGGGGGCATCCTCAACTACATGATCCGCAAGATGGC  2663
            |||||.||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2590  AGGTTCGACACTGATGTGGAGCTCACGTACTTCCACAATGGAGGCATCCTGAACTACATGATCCGAAAGATGGC  2663

Query 2664  CAAG  2667
            |.||
Sbjct 2664  CCAG  2667