Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476597
• Subject: NM_146123.3
• Aligned Length: 1569
• Identities: 1297
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGTCCTCCTCCTCCTACGCCAAGAACGGGACCGCGGACGGGCCGCACTCCCCCACCTCGCAGGTGGCCCGAGG  74
                                                                                   |.|
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query   75  CACCACA------ACCCGGA-GGAGCAGGTTGAAAAGATCCGATGGCAGCACCACTTCGACCAGCTTCATCCTC  141
            .|..|||      |||.|.| |||    ||||||.|                                   |||
Sbjct    4  TATGACAATTTGTACCTGCATGGA----GTTGAAGA-----------------------------------CTC  38

Query  142  --AGACAGGGTTCAGCGGATTCCTACACAAGCAGGCCGTCTGACTCCGATGTCTCTTTGGAAGAGGACCGGGAA  213
              ||.|.||| |||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   39  GGAGGCTGGG-TCAGCAGATTCCTATACAAGCAGGCCATCGGACTCCGATGTCTCCTTGGAAGAGGACCGGGAA  111

Query  214  GCAATTCGACAGGAGAGAGAACAGCAAGCAGCTATCCAGCTTGAGAGAGCAAAGTCCAAACCTGTAGCATTTGC  287
            ||.||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  112  GCGATCCGGCAAGAGCGAGAACAGCAAGCAGCTATCCAGCTTGAGAGAGCGAAGTCCAAACCTGTAGCTTTTGC  185

Query  288  CGTGAAGACAAATGTGAGCTACTGCGGCGCCCTGGACGAGGATGTGCCTGTTCCAAGCACAGCTATCTCCTTTG  361
            .|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  186  GGTGAAAACGAACGTGAGCTACTGTGGTGCCCTGGACGAAGATGTGCCCGTTCCCAGCACAGCCATCTCCTTTG  259

Query  362  ATGCTAAAGACTTTCTACATATTAAAGAGAAATATAACAATGATTGGTGGATAGGAAGGCTGGTGAAAGAGGGC  435
            |.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  260  ACGCCAAGGACTTTCTTCACATTAAAGAGAAATATAACAATGATTGGTGGATAGGAAGACTGGTAAAAGAGGGC  333

Query  436  TGTGAAATTGGCTTCATTCCAAGTCCACTCAGATTGGAGAACATACGGATCCAGCAAGAACAAAAAAGAGGACG  509
            |||||.|||||||||||.|||||||||||..|.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  334  TGTGAGATTGGCTTCATCCCAAGTCCACTGCGCTTGGAGAATATTCGGATTCAACAGGAACAGAAAAGAGGCCG  407

Query  510  TTTTCACGGAGGGAAATCAAGTGGAAATTCTTCTTCAAGTCTTGGAGAAATGGTATCTGGGACATTCCGAGCAA  583
            ||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  408  TTTTCATGGCGGGAAATCGAGTGGAAACTCTTCCTCCAGTCTGGGAGAAATGGTATCAGGAACATTCCGAGCAA  481

Query  584  CTCCCACATCAACAGCAAAACAGAAGCAAAAAGTGACGGAGCACATTCCTCCTTACGATGTTGTACCGTCAATG  657
            ||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct  482  CTCCCACAACAACAGCAAAACAGAAGCAGAAAGTGACGGAGCACATTCCTCCGTATGACGTCGTGCCGTCAATG  555

Query  658  CGTCCGGTGGTGTTAGTGGGGCCGTCACTGAAAGGTTACGAGGTAACAGACATGATGCAGAAAGCCCTCTTTGA  731
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  CGTCCTGTGGTGTTAGTGGGGCCATCACTGAAAGGTTATGAGGTAACAGACATGATGCAGAAAGCCCTCTTTGA  629

Query  732  TTTCCTGAAGCACAGGTTTGATGGGAGGATTTCAATAACGAGAGTGACAGCTGACATTTCTCTTGCTAAGAGGT  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  630  TTTCCTGAAGCACAGGTTTGATGGGAGGATATCAATAACAAGAGTGACAGCTGACATTTCTCTTGCTAAGAGAT  703

Query  806  CTGTCCTAAATAATCCCAGCAAGAGAGCAATAATTGAACGTTCGAACACCCGGTCCAGCTTAGCGGAAGTACAA  879
            |||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct  704  CTGTCCTCAACAATCCTAGCAAGAGAGCAATAATTGAACGTTCCAACACCAGATCCAGCTTAGCGGAAGTACAA  777

Query  880  AGTGAAATTGAAAGAATCTTTGAGTTGGCAAGATCTTTGCAACTGGTTGTTCTTGATGCAGACACCATCAATCA  953
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  778  AGTGAAATTGAAAGAATTTTTGAGTTGGCAAGATCTTTGCAATTGGTTGTTCTTGATGCAGACACCATCAACCA  851

Query  954  CCCAGCACAACTTATAAAGACTTCCTTAGCACCAATTATTGTTCATGTAAAAGTCTCATCTCCAAAGGTTTTAC  1027
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  852  CCCAGCACAGCTGATAAAGACATCCTTAGCACCCATCATCGTCCACGTGAAGGTCTCGTCCCCAAAGGTTTTAC  925

Query 1028  AGCGGTTGATTAAATCTAGAGGAAAGTCACAAAGTAAACACTTGAATGTTCAACTGGTGGCAGCTGATAAACTT  1101
            |||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  926  AGCGGCTGATTAAGTCCAGAGGAAAGTCCCAAAGCAAACACTTGAATGTTCAACTGGTGGCGGCCGATAAACTG  999

Query 1102  GCACAATGCCCCCCAGAAATGTTTGATGTTATATTGGATGAAAATCAGCTTGAGGATGCATGTGAACATCTAGG  1175
            ||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1000  GCCCAGTGCCCGCCTGAAATGTTTGATGTTATATTAGATGAGAATCAACTTGAGGATGCCTGTGAACATCTGGG  1073

Query 1176  GGAGTACCTGGAGGCGTACTGGCGTGCCACCCACACAACCAGTAGCACACCCATGACCCCGCTGCTGGGAAGGA  1249
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||.||||||||..|.|||||..|||
Sbjct 1074  AGAGTACCTGGAGGCATACTGGCGTGCCACCCACACGAGCAGTAGCACCCCTATGACCCCATTACTGGGGCGGA  1147

Query 1250  ATTTGGGCTCCACGGCACTCTCACCATATCCCACAGCAATTTCTGGGTTACAGAGTCAGCGAATGAGGCACAGC  1323
            |..||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1148  ACGTGGGCTCCACAGCCCTCTCACCATATCCCACAGCAATCTCTGGATTACAGAGTCAGCGAATGAGACACAGC  1221

Query 1324  AACCACTCCACAGAGAACTCTCCAATTGAAAGACGAAGTCTAATGACCTCTGATGAAAATTATCACAATGAAAG  1397
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1222  AACCATTCTACAGAGAATTCTCCAATTGAAAGACGAAGCCTAATGACCTCGGATGAAAATTACCACAATGAGAG  1295

Query 1398  GGCTCGGAAGAGTAGGAACCGCTTGTCTTCCAGTTCTCAGCATAGCCGAGATCATTACCCTCTTGTGGAAGAAG  1471
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1296  GGCCCGCAAGAGTAGGAACCGCTTGTCTTCCAGCTCCCAGCACAGCCGAGACCACTACCCTCTGGTGGAAGAAG  1369

Query 1472  ATTACCCTGACTCATACCAGGACACTTACAAACCCCATAGGAACCGAGGATCACCTGGGGGATATAGCCATGAC  1545
            |||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||||||
Sbjct 1370  ATTACCCGGACTCGTACCAGGACACTTATAAGCCCCATAGGAACCGAGGATCGCCCGGGGGGTGCAGCCATGAC  1443

Query 1546  TCCCGACATAGGCTT  1560
            |||||||||||||||
Sbjct 1444  TCCCGACATAGGCTT  1458