Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476621
• Subject: XM_011541057.1
• Aligned Length: 2031
• Identities: 2028
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCGAAAGTCAACATAACTAGAGACCTCATCCGTAGGCAGATCAAGGAGCGGGGTGCCCTGAGCTTTGAGCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAAAGTCAACATAACTAGAGACCTCATCCGTAGGCAGATCAAGGAGCGGGGTGCCCTGAGCTTTGAGCG  74

Query   75  GCGCTACCATGTCACTGACCCCTTTATCCGGCGGCTGGGCCTGGAAGCAGAGCTGCAGGGTCACTCAGGATGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCTACCATGTCACTGACCCCTTTATCCGGCGGCTGGGCCTGGAAGCAGAGCTGCAGGGTCACTCAGGATGTG  148

Query  149  TCAACTGTCTGGAGTGGAATGAGAAAGGAGACTTGCTGGCCTCTGGTTCCGATGACCAGCACACGATTGTGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAACTGTCTGGAGTGGAATGAGAAAGGAGACTTGCTGGCCTCTGGTTCCGATGACCAGCACACGATTGTGTGG  222

Query  223  GACCCGCTGCACCACAAGAAGCTGCTCTCCATGCACACGGGACACACCGCAAATATCTTCTCTGTCAAGTTCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCCGCTGCACCACAAGAAGCTGCTCTCCATGCACACGGGACACACCGCAAATATCTTCTCTGTCAAGTTCCT  296

Query  297  GCCTCACGCTGGGGACCGCATCTTGATCACGGGGGCAGCCGACTCTAAGGTGCATGTGCACGACCTGACAGTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTCACGCTGGGGACCGCATCTTGATCACGGGGGCAGCCGACTCTAAGGTGCATGTGCACGACCTGACAGTAA  370

Query  371  AGGAGACCATCCACATGTTTGGAGACCACACAAACCGGGTGAAGCGCATCGCCACAGCGCCCATGTGGCCCAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGACCATCCACATGTTTGGAGACCACACAAACCGGGTGAAGCGCATCGCCACAGCGCCCATGTGGCCCAAC  444

Query  445  ACATTCTGGAGTGCTGCTGAGGATGGGCTTATCCGCCAGTATGACCTTCGAGAGAACAGCAAACACTCGGAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACATTCTGGAGTGCTGCTGAGGATGGGCTTATCCGCCAGTATGACCTTCGAGAGAACAGCAAACACTCGGAGGT  518

Query  519  GCTGATTGACCTGACAGAGTACTGTGGCCAGCTGGTGGAGGCCAAGTGCCTCACTGTCAACCCCCAGGACAACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGATTGACCTGACAGAGTACTGTGGCCAGCTGGTGGAGGCCAAGTGCCTCACTGTCAACCCCCAGGACAACA  592

Query  593  ACTGCCTGGCAGTTGGGGCCAGCGGGCCCTTCGTGAGGCTCTATGACATCCGCATGATCCATAACCACAGAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTGCCTGGCAGTTGGGGCCAGCGGGCCCTTCGTGAGGCTCTATGACATCCGCATGATCCATAACCACAGAAAG  666

Query  667  AGCATGAAGCAGAGCCCTTCAGCGGGTGTGCACACCTTCTGTGACCGGCAGAAACCCCTTCCGGACGGTGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCATGAAGCAGAGCCCTTCAGCGGGTGTGCACACCTTCTGTGACCGGCAGAAACCCCTTCCGGACGGTGCAGC  740

Query  741  CCAGTATTACGTAGCAGGTCACCTGCCAGTGAAGCTTCCTGACTACAACAACCGTTTGAGAGTGCTGGTTGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGTATTACGTAGCAGGTCACCTGCCAGTGAAGCTTCCTGACTACAACAACCGTTTGAGAGTGCTGGTTGCCA  814

Query  815  CCTATGTGACCTTCAGCCCCAATGGCACAGAGCTACTAGTCAACATGGGGGGGGAACAGGTCTATTTGTTTGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTATGTGACCTTCAGCCCCAATGGCACAGAGCTACTAGTCAACATGGGGGGGGAACAGGTCTATTTGTTTGAC  888

Query  889  TTGACTTACAAGCAGCGGCCGTACACCTTCCTCTTGCCTAGAAAATGCCACTCCTCGGGG---GTCCAGAATGG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
Sbjct  889  TTGACTTACAAGCAGCGGCCGTACACCTTCCTCTTGCCTAGAAAATGCCACTCCTCGGGGGAAGTCCAGAATGG  962

Query  960  CAAGATGTCCACCAACGGTGTGTCCAACGGTGTGTCCAATGGCCTGCACCTTCATAGCAATGGCTTCCGGCTGC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGATGTCCACCAACGGTGTGTCCAACGGTGTGTCCAATGGCCTGCACCTTCATAGCAATGGCTTCCGGCTGC  1036

Query 1034  CGGAGAGTAGGGGACATGTCAGCCCCCAAGTAGAGCTACCACCATACCTGGAGCGTGTGAAACAGCAAGCCAAT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGGAGAGTAGGGGACATGTCAGCCCCCAAGTAGAGCTACCACCATACCTGGAGCGTGTGAAACAGCAAGCCAAT  1110

Query 1108  GAGGCTTTTGCCTGCCAGCAGTGGACCCAAGCCATTCAGCTTTACAGCAAGGCTGTGCAGAGGGCCCCTCACAA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGCTTTTGCCTGCCAGCAGTGGACCCAAGCCATTCAGCTTTACAGCAAGGCTGTGCAGAGGGCCCCTCACAA  1184

Query 1182  TGCCATGCTTTATGGAAACCGAGCAGCAGCCTACATGAAGCGCAAGTGGGATGGTGACCACTATGATGCCCTGA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCATGCTTTATGGAAACCGAGCAGCAGCCTACATGAAGCGCAAGTGGGATGGTGACCACTATGATGCCCTGA  1258

Query 1256  GGGACTGCCTCAAGGCCATCTCCCTAAACCCATGCCACCTGAAGGCACACTTTCGCCTGGCCCGCTGCCTCTTT  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGACTGCCTCAAGGCCATCTCCCTAAACCCATGCCACCTGAAGGCACACTTTCGCCTGGCCCGCTGCCTCTTT  1332

Query 1330  GAGCTCAAGTATGTGGCTGAAGCCCTGGAGTGCCTGGACGACTTCAAAGGGAAATTTCCGGAGCAGGCCCACAG  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGCTCAAGTATGTGGCTGAAGCCCTGGAGTGCCTGGACGACTTCAAAGGGAAATTTCCGGAGCAGGCCCACAG  1406

Query 1404  CAGCGCTTGTGATGCATTGGGCCGCGACATCACAGCTGCCCTCTTCTCTAAAAATGATGGTGAGGAGAAGAAGG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGCGCTTGTGATGCATTGGGCCGCGACATCACAGCTGCCCTCTTCTCTAAAAATGATGGTGAGGAGAAGAAGG  1480

Query 1478  GACCTGGTGGCGGCGCCCCAGTCCGCCTCCGCAGCACGAGCCGCAAGGACTCCATCTCAGAGGATGAAATGGTG  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GACCTGGTGGCGGCGCCCCAGTCCGCCTCCGCAGCACGAGCCGCAAGGACTCCATCTCAGAGGATGAAATGGTG  1554

Query 1552  CTGCGGGAGCGAAGCTACGACTATCAGTTCCGCTACTGCGGCCACTGCAACACCACCACGGATATCAAAGAGGC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCGGGAGCGAAGCTACGACTATCAGTTCCGCTACTGCGGCCACTGCAACACCACCACGGATATCAAAGAGGC  1628

Query 1626  CAATTTCTTTGGCAGCAACGCTCAGTATATCGTCAGTGGCTCTGACGATGGCTCCTTCTTCATCTGGGAAAAGG  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAATTTCTTTGGCAGCAACGCTCAGTATATCGTCAGTGGCTCTGACGATGGCTCCTTCTTCATCTGGGAAAAGG  1702

Query 1700  AGACCACCAACCTGGTCCGTGTGCTCCAAGGGGATGAGTCCATTGTCAACTGCCTGCAGCCACACCCCAGCTAC  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGACCACCAACCTGGTCCGTGTGCTCCAAGGGGATGAGTCCATTGTCAACTGCCTGCAGCCACACCCCAGCTAC  1776

Query 1774  TGCTTCCTGGCCACCAGTGGCATCGATCCTGTTGTGCGGCTCTGGAACCCCCGACCAGAGAGTGAAGACCTCAC  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGCTTCCTGGCCACCAGTGGCATCGATCCTGTTGTGCGGCTCTGGAACCCCCGACCAGAGAGTGAAGACCTCAC  1850

Query 1848  AGGCCGAGTCGTGGAAGATATGGAGGGTGCTTCACAGGCCAACCAGCGGCGCATGAATGCAGACCCGTTGGAGG  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGCCGAGTCGTGGAAGATATGGAGGGTGCTTCACAGGCCAACCAGCGGCGCATGAATGCAGACCCGTTGGAGG  1924

Query 1922  TGATGCTGCTCAACATGGGCTACCGGATCACGGGCCTGAGCAGTGGGGGTGCCGGGGCCTCTGATGATGAGGAC  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGATGCTGCTCAACATGGGCTACCGGATCACGGGCCTGAGCAGTGGGGGTGCCGGGGCCTCTGATGATGAGGAC  1998

Query 1996  AGCTCTGAGGGCCAGGTGCAGTGCCGGCCCAGC  2028
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCTCTGAGGGCCAGGTGCAGTGCCGGCCCAGC  2031