Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476643
- Subject:
- XM_006521251.3
- Aligned Length:
- 1114
- Identities:
- 937
- Gaps:
- 80
Alignment
Query 1 ATGTCCCATGAAAAGAGTTTTTTGGTGTCTGGGGACAACTATCCTCCCCCCAACCCTGGATATCCGGGGGGGCC 74
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||..||||||||||..|||..| |.||||||
Sbjct 1 ATGTCCCATGAAAAGAGTTTCTTGGTGTCTGGGGACAGTTATCCTCCCCAAAACATT---------GTGGGGCC 65
Query 75 CC-AGCCACCCATGCCCCCCTATGCTCAGCCTCCCTACCCTGGGGCCCCTTACCCACAGCCCCCTTTCCAGCCC 147
|| |||| ||.|||||.|||||||.||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct 66 CCAAGCC-CCTATGCCTCCCTATGTTCAGGCTCCCTACCCTGGGGCCCCATACCCACAGGCCCCTTTCCAGCCC 138
Query 148 TCCCCCTACGGTCAGCCAGGGTACCCCCATGGCCCCAGCCCCTACCCCCAAGGGGGCTACCCACAGGGTCCCTA 221
||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||| |||.|||||||||
Sbjct 139 TCTCCCTATGGTCAGCCAGGATATCCCCATGGTCCCAGCCC---------------CTATCCACAGGGT----- 192
Query 222 CCCCCAAGGGGGCTACCCACAGGGCCCCTACCCACAAGAGGGCTACCCACAGGGCCCCTACCCCCAAGGGGGCT 295
||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 193 ----------------------------------------GGTTACCCTCAAGGGCCCTACCCTCAAGGAGGCT 226
Query 296 ACCCCCAGGGGCCATATCCCCAGAGCCCCTTCCCCCCCAACCCCTATGGACAGCCACAGGTCTTCCCAGGACAA 369
||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||....|||| ||.
Sbjct 227 ACCCACAGGGGCCATACCCACAGAGCCCCTTCCCGCCCAACCCCTATGGACAGCCACCACCCTTC------CAG 294
Query 370 GACCCTGACTCACCCCAGCATGGAAACTACCAGGAGGAGGGTCCCCCATCCTACTATGACAACCAGGACTTCCC 443
|||||||.||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 GACCCTGGCTCACCTCAGCATGGGAACTACCAGGAGGAAGGGCCTCCATCCTACTATGACAACCAGGACTTCCC 368
Query 444 TGCCACCAACTGGGATGACAAGAGCATCCGACAGGCCTTCATCCGCAAGGTGTTCCTAGTGCTGACCTTGCAGC 517
|||...||||||| |||||||.|||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 369 TGCTGTCAACTGG---GACAAGAACATTCGCCAGGCCTTTATCAGAAAGGTGTTCCTGGTGCTGACCCTGCAGC 439
Query 518 TGTCGGTGACCCTGTCCACGGTGTCTGTGTTCACTTTTGTTGCGGAGGTGAAGGGCTTTGTCCGGGAGAATGTC 591
|||||||||||||||||||.|||.|..|.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 TGTCGGTGACCCTGTCCACTGTGGCCATTTTCACTTTTGTTGGGGAGGTGAAGGGCTTTGTCCGGGAGAATGTC 513
Query 592 TGGACCTACTATGTCTCCTATGCTGTCTTCTTCATCTCTCTCATCGTCCTCAGCTGTTGTGGGGACTTCCGGCG 665
||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 TGGACCTACTATGTCTCCTACGCCATCTTCTTCATCTCCCTCATTGTTCTCAGCTGTTGTGGGGACTTCCGGCG 587
Query 666 AAAGCACCCCTGGAACCTTGTTGCACTGTCGGTCCTGACCGCCAGCCTGTCGTACATGGTGGGGATGATCGCCA 739
||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||.||||.||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 588 AAAGCATCCCTGGAACCTTGTTGCTCTGTCGATCCTGACCGTCAGCTTGTCCTACATGGTGGGCATGATAGCCA 661
Query 740 GCTTCTACAACACCGAGGCAGTCATCATGGCCGTGGGCATCACCACAGCCGTCTGCTTCACCGTCGTCATCTTC 813
||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 662 GCTTTTACAACACGGAGGCAGTCATCATGGCCGTGGGCATCACCACAGCTGTCTGCTTCACGGTGGTCATCTTC 735
Query 814 TCCATGCAGACCCGCTACGACTTCACCTCATGCATGGGCGTGCTCCTGGTGAGCATGGTGGTGCTCTTCATCTT 887
|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 736 TCCATGCAGACCCGCTATGACTTCACCTCGTGCATGGGCGTGCTCCTGGTGAGTGTTGTGGTGCTCTTCATCTT 809
Query 888 CGCCATTCTCTGCATCTTCATCCGGAACCGCATCCTGGAGATCGTGTACGCCTCACTGGGCGCTCTGCTCTTCA 961
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 810 CGCCATCCTCTGCATCTTCATCCGGAACCGCATCCTGGAGATTGTATACGCCTCGCTGGGCGCTCTGCTCTTCA 883
Query 962 CCTGCTTCCTCGCAGTGGACACCCAGCTGCTGCTGGGGAACAAGCAGCTGTCCCTGAGCCCAGAAGAGTATGTG 1035
||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 884 CCTGCTTCCTGGCAGTGGACACCCAGCTACTCCTGGGGAACAAGCAGCTGTCCCTGAGCCCAGAAGAATATGTG 957
Query 1036 TTTGCTGCGCTGAACCTGTACACAGACATCATCAACATCTTCCTGTACATCCTCACCATCATTGGCCGCGCCAA 1109
|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 958 TTTGCGGCCCTGAACCTGTACACGGACATCATCAACATCTTCCTATATATTCTCACCATCATTGGCCGTGCCAA 1031
Query 1110 GGAG 1113
||||
Sbjct 1032 GGAG 1035