Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476668
• Subject: XM_017009492.2
• Aligned Length: 1625
• Identities: 1498
• Gaps: 125

Alignment

Query    1  ATGCCGTCTCTGCTGGTGGCGCACATTCTCCCCGTGCGTACTACTCGGCTGGGCGTTGCTGGCCGGCGGCACCG  74
            ||||||||||||||||| ||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGTCTCTGCTGGT-GCTCACTTTCTCCCCGTGCGTACTACTCGGCTGGGCGTTGCTGGCCGGCGGCACCG  73

Query   75  GTGGCGGTGGCGTTGGCGGCGGCGGCGGTGGCGCGGGCATAGGCGGCGGACGCCAGGAGAGAGAGGCGCTGCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  GTGGCGGTGGCGTTGGCGGCGGCGGCGGTGGCGCGGGCATAGGCGGCGGACGCCAGGAGAGAGAGGCGCTGCCG  147

Query  149  CCACAGAAGATCGAGGTGCTGGTGTTACTGCCCCAGGATGACTCGTACTTGTTTTCACTCACCCGGGTGCGGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  CCACAGAAGATCGAGGTGCTGGTGTTACTGCCCCAGGATGACTCGTACTTGTTTTCACTCACCCGGGTGCGGCC  221

Query  223  GGCCATCGAGTATGCTCTGCGCAGCGTGGAGGGCAACGGGACTGGGAGGCGGCTTCTGCCGCCGGGCACTCGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GGCCATCGAGTATGCTCTGCGCAGCGTGGAGGGCAACGGGACTGGGAGGCGGCTTCTGCCGCCGGGCACTCGCT  295

Query  297  TCCAGGTGGCTTACGAGGATTCAGACTGTGGGAACCGTGCGCTCTTCAGCTTGGTGGACCGCGTGGCGGCGGCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  TCCAGGTGGCTTACGAGGATTCAGACTGTGGGAACCGTGCGCTCTTCAGCTTGGTGGACCGCGTGGCGGCGGCG  369

Query  371  CGGGGCGCCAAGCCAGACCTTATCCTGGGGCCAGTGTGCGAGTATGCAGCAGCGCCAGTGGCCCGGCTTGCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CGGGGCGCCAAGCCAGACCTTATCCTGGGGCCAGTGTGCGAGTATGCAGCAGCGCCAGTGGCCCGGCTTGCATC  443

Query  445  GCACTGGGACCTGCCCATGCTGTCGGCTGGGGCGCTGGCCGCTGGCTTCCAGCACAAGGACTCTGAGTACTCGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GCACTGGGACCTGCCCATGCTGTCGGCTGGGGCGCTGGCCGCTGGCTTCCAGCACAAGGACTCTGAGTACTCGC  517

Query  519  ACCTCACGCGCGTGGCGCCCGCCTACGCCAAGATGGGCGAGATGATGCTCGCCCTGTTCCGCCACCACCACTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ACCTCACGCGCGTGGCGCCCGCCTACGCCAAGATGGGCGAGATGATGCTCGCCCTGTTCCGCCACCACCACTGG  591

Query  593  AGCCGCGCTGCACTGGTCTACAGCGACGACAAGCTGGAGCGGAACTGCTACTTCACCCTCGAGGGGGTCCACGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  AGCCGCGCTGCACTGGTCTACAGCGACGACAAGCTGGAGCGGAACTGCTACTTCACCCTCGAGGGGGTCCACGA  665

Query  667  GGTCTTCCAGGAGGAGGGTTTGCACACGTCCATCTACAGTTTCGACGAGACCAAAGACTTGGATCTGGAAGACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GGTCTTCCAGGAGGAGGGTTTGCACACGTCCATCTACAGTTTCGACGAGACCAAAGACTTGGATCTGGAAGACA  739

Query  741  TCGTGCGCAATATCCAGGCCAGTGAGAGAGTGGTGATCATGTGTGCGAGCAGTGACACCATCCGGAGCATCTCT  814
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  740  TCGTGCGCAATATCCAGGCCAGTGAGAGA---------------------------------------------  768

Query  815  GCTGGTGGCGCACAGGCATGGCATGACCAGTGGAGACTACGCCTTCTTCAACATTGAGCTCTTCAACAGCTCTT  888
                                                                                      
Sbjct  769  --------------------------------------------------------------------------  768

Query  889  CCTATGGAGATGGCTCATGGAAGAGAGGAGACAAACACGACTTTGAAGCTAAGCAAGCATACTCGTCCCTCCAG  962
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  -----GGAGATGGCTCATGGAAGAGAGGAGACAAACACGACTTTGAAGCTAAGCAAGCATACTCGTCCCTCCAG  837

Query  963  ACAGTCACTCTACTGAGGACAGTGAAACCTGAGTTTGAGAAGTTTTCCATGGAGGTGAAAAGTTCAGTTGAGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838  ACAGTCACTCTACTGAGGACAGTGAAACCTGAGTTTGAGAAGTTTTCCATGGAGGTGAAAAGTTCAGTTGAGAA  911

Query 1037  ACAAGGGCTCAATATGGAGGATTACGTTAACATGTTTGTTGAAGGATTCCACGATGCCATCCTCCTCTACGTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  912  ACAAGGGCTCAATATGGAGGATTACGTTAACATGTTTGTTGAAGGATTCCACGATGCCATCCTCCTCTACGTCT  985

Query 1111  TGGCTCTACATGAAGTACTCAGAGCTGGTTACAGCAAAAAGGATGGAGGGAAAATTATACAGCAGACTTGGAAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  986  TGGCTCTACATGAAGTACTCAGAGCTGGTTACAGCAAAAAGGATGGAGGGAAAATTATACAGCAGACTTGGAAC  1059

Query 1185  AGAACATTTGAAGGTATCGCCGGGCAGGTGTCCATAGATGCCAACGGAGACCGATATGGGGATTTCTCTGTGAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060  AGAACATTTGAAGGTATCGCCGGGCAGGTGTCCATAGATGCCAACGGAGACCGATATGGGGATTTCTCTGTGAT  1133

Query 1259  TGCCATGACTGATGTGGAGGCGGGCACCCAGGAGGTTATTGGTGATTATTTTGGAAAAGAAGGTCGTTTTGAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134  TGCCATGACTGATGTGGAGGCGGGCACCCAGGAGGTTATTGGTGATTATTTTGGAAAAGAAGGTCGTTTTGAAA  1207

Query 1333  TGCGGCCGAATGTCAAATATCCTTGGGGCCCTTTAAAACTGAGAATAGATGAAAACCGAATTGTAGAGCATACA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208  TGCGGCCGAATGTCAAATATCCTTGGGGCCCTTTAAAACTGAGAATAGATGAAAACCGAATTGTAGAGCATACA  1281

Query 1407  AACAGCTCTCCCTGCAAATCATCAGGTGGCCTAGAAGAATCGGCAGTGACAGGAATTGTCGTGGGGGCTTTACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1282  AACAGCTCTCCCTGCAAATCATCAGGTGGCCTAGAAGAATCGGCAGTGACAGGAATTGTCGTGGGGGCTTTACT  1355

Query 1481  AGGAGCTGGCTTGCTAATGGCCTTCTACTTTTTCAGGAAGAAATACAGAATAACCATTGAGAGGCGAACCCAGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1356  AGGAGCTGGCTTGCTAATGGCCTTCTACTTTTTCAGGAAGAAATACAGAATAACCATTGAGAGGCGAACCCAGC  1429

Query 1555  AAGAAGAAAGTAACCTTGGAAAACATCGGGAATTACGGGAAGATTCCATCAGATCCCATTTTTCAGTAGCT  1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1430  AAGAAGAAAGTAACCTTGGAAAACATCGGGAATTACGGGAAGATTCCATCAGATCCCATTTTTCAGTAGCT  1500