Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476672
- Subject:
- NM_001254732.2
- Aligned Length:
- 3351
- Identities:
- 3234
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 ATGAAGAAAGCAAGCAGGAGTGTTGGCTCAGTGCCTAAAGTGTCTGCAATAAGTAAAACGCAAACAGCAGAAAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGAAAGCAAGCAGGAGTGTTGGCTCAGTGCCTAAAGTGTCTGCAATAAGTAAAACGCAAACAGCAGAAAA 74
Query 75 AATTAAACCTGAAAACAGCTCTTCAGCATCTACGGGAGGCAAACTTGTAAAACCTGGAACAGCAGCATCATTGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AATTAAACCTGAAAACAGCTCTTCAGCATCTACGGGAGGCAAACTTGTAAAACCTGGAACAGCAGCATCATTGT 148
Query 149 CAAAGACCAAGAGCAGTGATGACCTTTTAGCTGGAATGGCCGGAGGGGTAACGGTGACTAATGGTGTTAAAGGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAAAGACCAAGAGCAGTGATGACCTTTTAGCTGGAATGGCCGGAGGGGTAACGGTGACTAATGGTGTTAAAGGA 222
Query 223 AAGAAAAGCACCTGCCCATCTGCAGCACCTTCAGCATCTGCCCCTGCCATGACCACCGTGGAGAACAAATCCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGAAAAGCACCTGCCCATCTGCAGCACCTTCAGCATCTGCCCCTGCCATGACCACCGTGGAGAACAAATCCAA 296
Query 297 GATTAGCACAGGCACAGCTTCTTCAACCAAGCGGAGCACTTCTACAGGTAATAAAGAATCCAGTTCTACTAGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATTAGCACAGGCACAGCTTCTTCAACCAAGCGGAGCACTTCTACAGGTAATAAAGAATCCAGTTCTACTAGAG 370
Query 371 AAAGATTACGTGAACGTACCCGATTAAACCAGAGCAAAAAACTACCTTCTGCAGGTCAGGGAGCTAATGACATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAGATTACGTGAACGTACCCGATTAAACCAGAGCAAAAAACTACCTTCTGCAGGTCAGGGAGCTAATGACATG 444
Query 445 GCATTGGCCAAACGTTCCCGCAGTCGAACTGCTACAGAATGTGACGTTCGTATGAGCAAGTCTAAGTCAGACAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCATTGGCCAAACGTTCCCGCAGTCGAACTGCTACAGAATGTGACGTTCGTATGAGCAAGTCTAAGTCAGACAA 518
Query 519 TCAGATCAGTGACAGAGCTGCTTTGGAGGCCAAAGTGAAGGATCTTCTCACGCTGGCAAAAACCAAAGACGTAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAGATCAGTGACAGAGCTGCTTTGGAGGCCAAAGTGAAGGATCTTCTCACGCTGGCAAAAACCAAAGACGTAG 592
Query 593 AAATTTTACATTTGAGAAATGAACTGCGAGACATGCGTGCCCAGCTGGGCATTAATGAGGATCATTCTGAGGGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAATTTTACATTTGAGAAATGAACTGCGAGACATGCGTGCCCAGCTGGGCATTAATGAGGATCATTCTGAGGGT 666
Query 667 GATGAAAAATCTGAGAAGGAAACTATTATGGCTCACCAGCCGACTGATGTGGAGTCCACTTTATTGCAGTTGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATGAAAAATCTGAGAAGGAAACTATTATGGCTCACCAGCCGACTGATGTGGAGTCCACTTTATTGCAGTTGCA 740
Query 741 GGAACAGAATACTGCCATCCGTGAAGAACTCAACCAGCTGAAAAATGAAAACAGAATGTTAAAGGACAGGTTGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAACAGAATACTGCCATCCGTGAAGAACTCAACCAGCTGAAAAATGAAAACAGAATGTTAAAGGACAGGTTGA 814
Query 815 ATGCATTGGGCTTTTCCCTAGAGCAGAGGTTAGACAATTCTGAAAAACTGTTTGGCTATCAGTCCCTGAGCCCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGCATTGGGCTTTTCCCTAGAGCAGAGGTTAGACAATTCTGAAAAACTGTTTGGCTATCAGTCCCTGAGCCCA 888
Query 889 GAAATCACCCCTGGTAACCAGAGCGATGGAGGAGGAACTCTGACTTCTTCAGTGGAAGGCTCTGCCCCTGGCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAATCACCCCTGGTAACCAGAGCGATGGAGGAGGAACTCTGACTTCTTCAGTGGAAGGCTCTGCCCCTGGCTC 962
Query 963 AGTGGAGGATCTCTTGAGTCAGGATGAAAATACACTAATGGACCATCAGCACAGTAACTCCATGGACAATTTAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTGGAGGATCTCTTGAGTCAGGATGAAAATACACTAATGGACCATCAGCACAGTAACTCCATGGACAATTTAG 1036
Query 1037 ACAGTGAGTGCAGTGAGGTCTACCAGCCCCTCACATCGAGCGATGATGCGCTGGATGCACCATCCTCCTCAGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACAGTGAGTGCAGTGAGGTCTACCAGCCCCTCACATCGAGCGATGATGCGCTGGATGCACCATCCTCCTCAGAG 1110
Query 1111 TCGGAAGGCATCCCCAGCATAGAGCGCTCCCGGAAGGGGAGCAGCGGGAATGCCAGTGAAGTGTCCGTGGCTTG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCGGAAGGCATCCCCAGCATAGAGCGCTCCCGGAAGGGGAGCAGCGGGAATGCCAGTGAAGTGTCCGTGGCTTG 1184
Query 1185 CCTGACTGAACGGATACACCAGATGGAAGAGAACCAACACAGTACAAGTGAGGAACTCCAGGCAACCCTGCAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTGACTGAACGGATACACCAGATGGAAGAGAACCAACACAGTACAAGTGAGGAACTCCAGGCAACCCTGCAAG 1258
Query 1259 AGCTAGCTGATTTACAGCAGATTACCCAGGAACTGAATAGTGAAAACGAAAGGCTTGGAGAAGAGAAGGTTATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCTAGCTGATTTACAGCAGATTACCCAGGAACTGAATAGTGAAAACGAAAGGCTTGGAGAAGAGAAGGTTATT 1332
Query 1333 CTGATGGAGTCTTTATGTCAGCAGAGCGATAAGTTGGAACACTTTAGTCGACAGATTGAATACTTCCGCTCTCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGATGGAGTCTTTATGTCAGCAGAGCGATAAGTTGGAACACTTTAGTCGACAGATTGAATACTTCCGCTCTCT 1406
Query 1407 TCTAGATGAGCATCACATTTCTTATGTCATAGATGAAGATGTAAAAAGTGGGCGCTATATGGAATTAGAGCAAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCTAGATGAGCATCACATTTCTTATGTCATAGATGAAGATGTAAAAAGTGGGCGCTATATGGAATTAGAGCAAC 1480
Query 1481 GTTACATGGACCTCGCTGAGAATGCCCGTTTTGAACGGGAGCAGCTTCTTGGTGTCCAGCAGCATTTAAGCAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTTACATGGACCTCGCTGAGAATGCCCGTTTTGAACGGGAGCAGCTTCTTGGTGTCCAGCAGCATTTAAGCAAT 1554
Query 1555 ACTTTGAAAATGGCAGAACAAGACAATAAGGAAGCTCAAGAAATGATAGGGGCACTCAAAGAACGCAGTCACCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACTTTGAAAATGGCAGAACAAGACAATAAGGAAGCTCAAGAAATGATAGGGGCACTCAAAGAACGCAGTCACCA 1628
Query 1629 TATGGAGCGAATTATTGAGTCTGAGCAGAAAGGAAAAGCAGCCTTGGCAGCCACGTTAGAGGAATACAAAGCCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TATGGAGCGAATTATTGAGTCTGAGCAGAAAGGAAAAGCAGCCTTGGCAGCCACGTTAGAGGAATACAAAGCCA 1702
Query 1703 CAGTGGCCAGTGACCAGATAGAGATGAATCGCCTGAAGGCTCAGCTGGAGAATGAAAAGCAGAAAGTGGCAGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAGTGGCCAGTGACCAGATAGAGATGAATCGCCTGAAGGCTCAGCTGGAGAATGAAAAGCAGAAAGTGGCAGAG 1776
Query 1777 CTGTATTCTATCCATAACTCTGGAGACAAATCTGATATTCAGGACCTCCTGGAGAGTGTCAGGCTGGACAAAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTGTATTCTATCCATAACTCTGGAGACAAATCTGATATTCAGGACCTCCTGGAGAGTGTCAGGCTGGACAAAGA 1850
Query 1851 AAAAGCAGAGACTTTGGCTAGTAGCTTGCAGGAAGATCTGGCTCATACCCGAAATGATGCCAATCGATTACAGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AAAAGCAGAGACTTTGGCTAGTAGCTTGCAGGAAGATCTGGCTCATACCCGAAATGATGCCAATCGATTACAGG 1924
Query 1925 ATGCCATTGCTAAGGTAGAGGATGAATACCGAGCCTTCCAAGAAGAAGCTAAGAAACAAATTGAAGATTTGAAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGCCATTGCTAAGGTAGAGGATGAATACCGAGCCTTCCAAGAAGAAGCTAAGAAACAAATTGAAGATTTGAAT 1998
Query 1999 ATGACGTTAGAAAAATTAAGATCAGACCTGGATGAAAAAGAAACAGAAAGGAGTGACATGAAAGAAACCATCTT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATGACGTTAGAAAAATTAAGATCAGACCTGGATGAAAAAGAAACAGAAAGGAGTGACATGAAAGAAACCATCTT 2072
Query 2073 TGAACTTGAAGATGAAGTAGAACAACATCGTGCTGTGAAACTTCATGACAACCTCATTATTTCTGATCTAGAGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGAACTTGAAGATGAAGTAGAACAACATCGTGCTGTGAAACTTCATGACAACCTCATTATTTCTGATCTAGAGA 2146
Query 2147 ATACAGTTAAAAAACTCCAGGACCAAAAGCACGACATGGAAAGAGAAATAAAGACACTCCACAGAAGACTTCGG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATACAGTTAAAAAACTCCAGGACCAAAAGCACGACATGGAAAGAGAAATAAAGACACTCCACAGAAGACTTCGG 2220
Query 2221 GAAGAATCTGCGGAATGGCGGCAGTTTCAGGCTGATCTCCAGACTGCAGTAGTCATTGCAAATGACATTAAATC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAAGAATCTGCGGAATGGCGGCAGTTTCAGGCTGATCTCCAGACTGCAGTAGTCATTGCAAATGACATTAAATC 2294
Query 2295 TGAAGCCCAAGAGGAGATTGGTGATCTAAAGCGCCGGTTACATGAGGCTCAAGAAAAAAATGAGAAACTCACAA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGAAGCCCAAGAGGAGATTGGTGATCTAAAGCGCCGGTTACATGAGGCTCAAGAAAAAAATGAGAAACTCACAA 2368
Query 2369 AAGAATTGGAGGAAATAAAGTCACGCAAGCAAGAGGAGGAGCGAGGCCGGGTATACAATTACATGAATGCCGTT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAGAATTGGAGGAAATAAAGTCACGCAAGCAAGAGGAGGAGCGAGGCCGGGTATACAATTACATGAATGCCGTT 2442
Query 2443 GAGAGAGATTTGGCAGCCTTAAGGCAGGGAATGGGACTGAGTAGAAGGTCCTCGACTTCCTCAGAGCCAACTCC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GAGAGAGATTTGGCAGCCTTAAGGCAGGGAATGGGACTGAGTAGAAGGTCCTCGACTTCCTCAGAGCCAACTCC 2516
Query 2517 TACAGTAAAAACCCTCATCAAGTCCTTTGACAGTGCATCTCAAGTACCAAACCCTGCTGCAGCTGCAATTCCTC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TACAGTAAAAACCCTCATCAAGTCCTTTGACAGTGCATCTCAAGTACCAAACCCTGCTGCAGCTGCAATTCCTC 2590
Query 2591 GAACGCCCCTGAGCCCAAGTCCTATGAAAACCCCTCCTGCAGCAGCTGTGTCCCCTATGCAGAGACATTCCATA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GAACGCCCCTGAGCCCAAGTCCTATGAAAACCCCTCCTGCAGCAGCTGTGTCCCCTATGCAGAGACATTCCATA 2664
Query 2665 AGTGGACCAATCTCAACATCCAAACCCCTGACAGCCCTGTCAGATAAGAGACCAAACTATGGGGAAATCCCTGT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGTGGACCAATCTCAACATCCAAACCCCTGACAGCCCTGTCAGATAAGAGACCAAACTATGGGGAAATCCCTGT 2738
Query 2739 TCAAGAGCATCTGTTAAGAACATCTTCAGCCAGCCGGCCTGCTTCCCTGCCAAGAGTGCCTGCGATGGAAAGTG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TCAAGAGCATCTGTTAAGAACATCTTCAGCCAGCCGGCCTGCTTCCCTGCCAAGAGTGCCTGCGATGGAAAGTG 2812
Query 2813 CCAAGACCCTCTCAGTGTCTCGACGAAGTAGTGAAGAAATGAAACGGGACATTTCTGCACAGGAGGGAGCGTCG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCAAGACCCTCTCAGTGTCTCGACGAAGTAGTGAAGAAATGAAACGGGACATTTCTGCACAGGAGGGAGCGTCG 2886
Query 2887 CCAGCCTCTCTGATGGCTATGGGAACCACGTCTCCACAGCTTTCCCTGTCCTCTTCTCCAACGGCATCTGTGAC 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CCAGCCTCTCTGATGGCTATGGGAACCACGTCTCCACAGCTTTCCCTGTCCTCTTCTCCAACGGCATCTGTGAC 2960
Query 2961 TCCCACCACCCGAAGCCGAATAAGAGAAGAAAGGAAAGACCCTCTCTCAGCATTGGCCAGAGAATATGGAGGAT 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TCCCACCACCCGAAGCCGAATAAGAGAAGAAAGGAAAGACCCTCTCTCAGCATTGGCCAGAGAATATGGAGGAT 3034
Query 3035 CAAAGAGGAACGCCTTGCTGAAGTGGTGTCAGAAGAAAACAGAAGGCTATCAGAATATTGACATTACAAACTTC 3108
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CAAAGAGGAACGCCTTGCTGAAGTGGTGTCAGAAGAAAACAGAAGGCTATC----------------------- 3085
Query 3109 AGCAGCAGCTGGAATGATGGGCTGGCCTTCTGTGCCCTCCTGCATACATATCTCCCTGCCCACATTCCATATCA 3182
Sbjct 3086 -------------------------------------------------------------------------- 3085
Query 3183 AGAACTGAACAGCCAGGATAAGAGAAGGAACTTCATGCTGGCTTTCCAGGCAGCTGAAAGTGTCGGCATCAAAT 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3086 --------------------AGAGAAGGAACTTCATGCTGGCTTTCCAGGCAGCTGAAAGTGTCGGCATCAAAT 3139
Query 3257 CCACACTGGACATTAATGAAATGGTACGGACTGAACGACCCGACTGGCAGAACGTGATGCTGTATGTGACGGCG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3140 CCACACTGGACATTAATGAAATGGTACGGACTGAACGACCCGACTGGCAGAACGTGATGCTGTATGTGACGGCG 3213
Query 3331 ATCTACAAGTACTTTGAGACC 3351
|||||||||||||||||||||
Sbjct 3214 ATCTACAAGTACTTTGAGACC 3234