Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476672
• Subject: NM_153406.3
• Aligned Length: 3355
• Identities: 2965
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGAAGAAAGCAAGCAGGAGTGTTGGCTCAGTGCCTAAAGTGTCTGCAATAAGTAAAACGCAAACAGCAGAAAA  74
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||.|||.|||||||||.|||.||
Sbjct    1  ATGAAGAAAGCAAACAGGAGTGCTGGCTCAGTGCCTAAGGTGTCTGGGATAAGCAAACCGCAAACAGTAGAGAA  74

Query   75  AATTAAACCTGAAAACAGCTCTTCAGCATCTACGGGAGGCAAACTTGTAAAACCTGGAACAGCAGCATCATTGT  148
            ||..||.|||||.|||||||||||||||.|.||.||||.|||.|.|||.|..|||||..||||||||.|.||||
Sbjct   75  AAGCAAGCCTGAGAACAGCTCTTCAGCACCCACAGGAGTCAAGCCTGTGAGGCCTGGGGCAGCAGCAGCCTTGT  148

Query  149  CAAAGACCAAGAGCAGTGATGACCTTTTAGCTGGAATGGCCGGAGGGGTAACGGTGACTAATGGTGTTAAAGGA  222
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||..||||||||||||.||||||.|
Sbjct  149  CAAAGACCAAGAGCAATGATGACCTTTTAGCTGGAATGGCTGGAGGAGTAAACGTGACTAATGGTATTAAAGCA  222

Query  223  AAGAAAAGCACCTGCCCATCTGCAGCACCTTCAGCATCTGCCCCTGCCATGACCACCGTGGAGAACAAATCCAA  296
            ||||||||||||||..||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||||.|..|||||||||.|||||
Sbjct  223  AAGAAAAGCACCTGTTCATCTGCAGCGCCTTCAGCCCCCGCCCCTGCCATGACCATCTCGGAGAACAAGTCCAA  296

Query  297  GATTAGCACAGGCAC-AGCTTCTTCAACCAAGCGGAGCACTTCTACAGGTAATAAAGAATCCAGTTCTACTAGA  369
            |||.||||||||||| || |||.|||.||||.|||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  GATCAGCACAGGCACTAG-TTCCTCAGCCAAACGGAGTACTTCGGCTGGTAATAAAGAGTCCAGTTCTACTAGA  369

Query  370  GAAAGATTACGTGAACGTACCCGATTAAACCAGAGCAAAAAACTACCTTCTGCAGGTCAGGGAGCTAATGACAT  443
            |||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||||.|.||||||||||||||||..|
Sbjct  370  GAAAGATTACGTGAACGCACCCGGCTAAACCAGAGCAAAAAACTGCCCTCTGTAAGTCAGGGAGCTAATGATGT  443

Query  444  GGCATTGGCCAAACGTTCCCGCAGTCGAACTGCTACAGAATGTGACGTTCGTATGAGCAAGTCTAAGTCAGACA  517
            ||||.||||.||||||||.|||||.||.||||||.||||..||||..||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  444  GGCACTGGCTAAACGTTCACGCAGCCGCACTGCTGCAGAGGGTGATATTCGTATGAGCAAGTCTAAGTCGGACA  517

Query  518  ATCAGATCAGTGACAGAGCTGCTTTGGAGGCCAAAGTGAAGGATCTTCTCACGCTGGCAAAAACCAAAGACGTA  591
            |||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.
Sbjct  518  ATCAGATCAGTGACAAAGCTGCTTTGGAAGCCAAGGTGAAAGATCTCCTCACACTGGCGAAAACCAAGGATGTG  591

Query  592  GAAATTTTACATTTGAGAAATGAACTGCGAGACATGCGTGCCCAGCTGGGCATTAATGAGGATCATTCTGAGGG  665
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||.|||.||
Sbjct  592  GAAATTTTACATTTGAGAAATGAACTCCGAGACATGCGTGCTCAGCTGGGCATTAGTGAGGACCATTGTGAAGG  665

Query  666  TGATGAAAAATCTGA---GAAGGAAACTATTATGGCTCACCAGCCGACTGATGTGGAGTCCACTTTATTGCAGT  736
            |||.||.|..|||||   |||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||.|..|||||.
Sbjct  666  TGAGGACAGGTCTGAGGTGAAGGAAACTATTATTGCTCACCAGCCTACTGACGTGGAGTCTACTCTCCTGCAGC  739

Query  737  TGCAGGAACAGAATACTGCCATCCGTGAAGAACTCAACCAGCTGAAAAATGAAAACAGAATGTTAAAGGACAGG  810
            |||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  740  TGCAGGAGCAGAATACAGCCATCCGCGAGGAGCTCAACCAGCTGAAGAATGAAAACAGAATGCTAAAGGACAGG  813

Query  811  TTGAATGCATTGGGCTTTTCCCTAGAGCAGAGGTTAGACAATTCTGAAAAACTGTTTGGCTATCAGTCCCTGAG  884
            .|.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CTCAATGCTTTGGGCTTTTCCCTAGAGCAAAGGCTGGACAATTCTGAAAAACTATTTGGCTATCAGTCCCTGAG  887

Query  885  CCCAGAAATCACCCCTGGTAACCAGAGCGATGGAGGAGGAACTCTGACTTCTTCAGTGGAAGGCTCTGCCCCTG  958
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct  888  CCCAGAAATCACCCCTGGTAACCAGAGTGACGGAGGAGGAACTCTGACATCTTCGGTAGAAGGTTCTGCTCCTG  961

Query  959  GCTCAGTGGAGGATCTCTTGAGTCAGGATGAAAATACACTAATGGACCATCAGCACAGTAACTCCATGGACAAT  1032
            |.||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  962  GGTCGGTGGAAGATCTCCTGAGTCAGGATGAAAATACACTCATGGACCATCAGCACAGTAACTCCATGGACAAC  1035

Query 1033  TTAGACAGTGAGTGCAGTGAGGTCTACCAGCCCCTCACATCGAGCGATGATGCGCTGGATGCACCATCCTCCTC  1106
            .|.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1036  CTGGACAGTGAGTGCAGCGAGGTGTACCAGCCCCTCACTTCCAGCGATGATGCTCTGGACGCCCCCTCCTCTTC  1109

Query 1107  AGAGTCGGAAGGCATCCCCAGCATAGAGCGCTCCCGGAAGGGGAGCAGCGGGAATGCCAGTGAAGTGTCCGTGG  1180
            ||||||.||.|||.|.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1110  AGAGTCAGAGGGCGTGCCAAGCATTGAGCGCTCTCGGAAGGGGAGCAGTGGGAATGCCAGTGAGGTGTCCGTCG  1183

Query 1181  CTTGCCTGACTGAACGGATACACCAGATGGAAGAGAACCAACACAGTACAAGTGAGGAACTCCAGGCAACCCTG  1254
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1184  CTTGCCTGACAGAACGGATTCACCAGATGGAAGAGAACCAGCACAGCACCAGTGAGGAGCTTCAGGCCACTCTA  1257

Query 1255  CAAGAGCTAGCTGATTTACAGCAGATTACCCAGGAACTGAATAGTGAAAACGAAAGGCTTGGAGAAGAGAAGGT  1328
            ||.|||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1258  CAGGAGCTGGCTGATCTCCAGCAGATTACCCAGGAGCTCAACAGTGAGAACGAAAGGCTGGGAGAGGAGAAGGT  1331

Query 1329  TATTCTGATGGAGTCTTTATGTCAGCAGAGCGATAAGTTGGAACACTTTAGTCGACAGATTGAATACTTCCGCT  1402
            .||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1332  CATTCTGATGGAGTCGCTGTGTCAGCAGAGTGATAAGTTGGAACACTTTGGCCGGCAGATTGAGTATTTCCGTT  1405

Query 1403  CTCTTCTAGATGAGCATCACATTTCTTATGTCATAGATGAAGATGTAAAAAGTGGGCGCTATATGGAATTAGAG  1476
            |.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 1406  CCCTTCTTGATGAGCATCACATTTCCTATGTCATAGATGAAGACGTAAAGAGCGGGCGCTATATGGAACTAGAG  1479

Query 1477  CAACGTTACATGGACCTCGCTGAGAATGCCCGTTTTGAACGGGAGCAGCTTCTTGGTGTCCAGCAGCATTTAAG  1550
            ||.||.||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1480  CAGCGCTACATGGATTTGGCTGAGAATGCCCGTTTTGAGCGAGAGCAGCTTCTAGGTGTGCAGCAGCATTTAAG  1553

Query 1551  CAATACTTTGAAAATGGCAGAACAAGACAATAAGGAAGCTCAAGAAATGATAGGGGCACTCAAAGAACGCAGTC  1624
            |||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1554  CAACACTTTGAAGATGGCAGAACAAGATAACAAAGAAGCTCAAGAAATGATAGGTGCCCTCAAAGAGCGCAGCC  1627

Query 1625  ACCATATGGAGCGAATTATTGAGTCTGAGCAGAAAGGAAAAGCAGCCTTGGCAGCCACGTTAGAGGAATACAAA  1698
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1628  ACCACATGGAGCGGATTATTGAGTCTGAGCAGAAGGGCAAAGCGGCCCTGGCAGCCACATTGGAGGAGTACAAA  1701

Query 1699  GCCACAGTGGCCAGTGACCAGATAGAGATGAATCGCCTGAAGGCTCAGCTGGAGAATGAAAAGCAGAAAGTGGC  1772
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1702  GCTACTGTGGCCAGTGACCAGATAGAGATGAATCGCTTGAAGGCCCAGCTGGAGAACGAAAAGCAGAAGGTGGC  1775

Query 1773  AGAGCTGTATTCTATCCATAACTCTGGAGACAAATCTGATATTCAGGACCTCCTGGAGAGTGTCAGGCTGGACA  1846
            .|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  TGAGTTGTATTCTATCCATAACTCTGGAGACAAGTCCGATATCCAGGATCTCCTGGAGAGTGTCAGGCTGGACA  1849

Query 1847  AAGAAAAAGCAGAGACTTTGGCTAGTAGCTTGCAGGAAGATCTGGCTCATACCCGAAATGATGCCAATCGATTA  1920
            |.|||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1850  AGGAAAAGGCGGAGACTTTGGCCAGTAGCCTGCAGGAAGATCTGGCTCATACCCGAAATGATGCCAATCGGTTA  1923

Query 1921  CAGGATGCCATTGCTAAGGTAGAGGATGAATACCGAGCCTTCCAAGAAGAAGCTAAGAAACAAATTGAAGATTT  1994
            |||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1924  CAGGACACCATTGCTAAGGTAGAAGATGAATACCGAGCTTTCCAGGAAGAGGCCAAGAAGCAGATTGAAGATTT  1997

Query 1995  GAATATGACGTTAGAAAAATTAAGATCAGACCTGGATGAAAAAGAAACAGAAAGGAGTGACATGAAAGAAACCA  2068
            |||||||||.|||||||||.||||||||||..||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1998  GAATATGACATTAGAAAAACTAAGATCAGAGTTGGAGGAAAAGGACACGGAGAGGAGTGACATGAAGGAAACCA  2071

Query 2069  TCTTTGAACTTGAAGATGAAGTAGAACAACATCGTGCTGTGAAACTTCATGACAACCTCATTATTTCTGATCTA  2142
            |||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2072  TCTTTGAACTTGAAGATGAGGTGGAGCAGCACCGCGCCGTGAAGCTGCATGACAACCTCATTATCTCTGATCTA  2145

Query 2143  GAGAATACAGTTAAAAAACTCCAGGACCAAAAGCACGACATGGAAAGAGAAATAAAGACACTCCACAGAAGACT  2216
            ||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2146  GAGAATACAGTTAAGAAACTCCAAGACCAAAAGCATGACATGGAAAGAGAAATCAAGACACTTCACAGGAGACT  2219

Query 2217  TCGGGAAGAATCTGCGGAATGGCGGCAGTTTCAGGCTGATCTCCAGACTGCAGTAGTCATTGCAAATGACATTA  2290
            |||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 2220  TCGGGAAGAGTCTGCAGAATGGCGGCAATTTCAGGCTGATCTCCAGACTGCAGTGGTCATTGCCAATGATATCA  2293

Query 2291  AATCTGAAGCCCAAGAGGAGATTGGTGATCTAAAGCGCCGGTTACATGAGGCTCAAGAAAAAAATGAGAAACTC  2364
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 2294  AGTCTGAAGCCCAAGAAGAGATCGGTGATCTAAAGCGACGGCTACATGAGGCCCAAGAGAAAAATGAGAAACTC  2367

Query 2365  ACAAAAGAATTGGAGGAAATAAAGTCACGCAAGCAAGAGGAGGAGCGAGGCCGGGTATACAATTACATGAATGC  2438
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2368  ACAAAAGAATTGGAGGAAATAAAGTCACGCAAGCAAGAGGAAGAGCGTGGCCGGGTGTATAACTACATGAATGC  2441

Query 2439  CGTTGAGAGAGATTTGGCAGCCTTAAGGCAGGGAATGGGACTGAGTAGAAGGTCCTCGACTTCCTCAGAGCCAA  2512
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2442  TGTTGAAAGAGATTTGGCAGCCTTGAGGCAAGGGATGGGACTGAGTAGAAGGTCCTCCACTTCCTCAGAACCAA  2515

Query 2513  CTCCTACAGTAAAAACCCTCATCAAGTCCTTTGACAGTGCATCTCAAGTACCAAACCCTGCTGCAGCTGCAATT  2586
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct 2516  CTCCCACAGTAAAAACCCTCATCAAGTCTTTCGACAGTGCATCTCAAGTACCAAACGCTGCTGCAGCTGCGATC  2589

Query 2587  CCTCGAACGCCCCTGAGCCCAAGTCCTATGAAAACCCCTCCTGCAGCAGCTGTGTCCCCTATGCAGAGACATTC  2660
            ||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2590  CCTCGAACACCTCTGAGTCCAAGTCCCATGAAAACCCCTCCTGCAGCTGCCGTTTCTCCCATGCAGAGACATTC  2663

Query 2661  CATAAGTGGACCAATCTCAACATCCAAACCCCTGACAGCCCTGTCAGATAAGAGACCAAACTATGGGGAAATCC  2734
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||.||..|.|
Sbjct 2664  CATAAGTGGTCCAATCTCAACCTCCAAGCCTCTGACAGCCTTGTCAGATAAGAGATCAAACTATGGAGAGCTTC  2737

Query 2735  CTGTTCAAGAGCATCTGTTAAGAACATCTTCAGCCAGCCGGCCTGCTTCCCTGCCAAGAGTGCCTGCGATGGAA  2808
            ||||.|||||||||||..||||||||||||||.||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2738  CTGTACAAGAGCATCTACTAAGAACATCTTCAACCAGCCGGCCCGCCTCTCTCCCAAGAGTCCCTGCTATGGAA  2811

Query 2809  AGTGCCAAGACCCTCTCAGTGTCTCGACGAAGTAGTGAAGAAATGAAACGGGACATTTCTGCACAGGAGGGAGC  2882
            ||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||...|||||.||
Sbjct 2812  AGTGCCAAGACCATCTCAGTGTCTCGACGGAGTAGTGAAGAAATGAAACGGGACATCTCTGCATCTGAGGGCGC  2885

Query 2883  GTCGCCAGCCTCTCTGATGGCTATGGGAACCACGTCTCCACAGCTTTCCCTGTCCTCTTCTCCAACGGCATCTG  2956
            |||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2886  GTCACCAGCCTCTCTCATGGCTATGGGCACCACGTCACCACAGCTCTCCCTCTCTTCCTCTCCCACTGCATCTG  2959

Query 2957  TGACTCCCACCACCCGAAGCCGAATAAGAGAAGAAAGGAAAGACCCTCTCTCAGCATTGGCCAGAGAATATGGA  3030
            |.|||||.|.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2960  TCACTCCAAGCACCCGGAGCCGAATAAGGGAAGAAAGGAAAGACCCCCTCTCAGCATTGGCAAGAGAATATGGA  3033

Query 3031  GGATCAAAGAGGAACGCCTTGCTGAAGTGGTGTCAGAAGAAAACAGAAGGCTATCAGAATATTGACATTACAAA  3104
            ||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3034  GGCTCCAAGAGGAACGCCTTGTTGAAGTGGTGTCAGAAGAAAACAGAAGGCTATCAGAATATTGACATCACAAA  3107

Query 3105  CTTCAGCAGCAGCTGGAATGATGGGCTGGCCTTCTGTGCCCTCCTGCATACATATCTCCCTGCCCACATTCCAT  3178
            ||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||..|.||.|||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 3108  CTTCAGCAGCAGCTGGAACGACGGGCTGGCTTTCTGCGCATTGCTTCATACCTATCTCCCAGCCCACATACCAT  3181

Query 3179  ATCAAGAACTGAACAGCCAGGATAAGAGAAGGAACTTCATGCTGGCTTTCCAGGCAGCTGAAAGTGTCGGCATC  3252
            ||||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 3182  ATCAAGAACTGAACAGTCAAGATAAGAAAAGGAACTTCACCCTGGCTTTCCAGGCAGCTGAAAGTGTTGGAATC  3255

Query 3253  AAATCCACACTGGACATTAATGAAATGGTACGGACTGAACGACCCGACTGGCAGAACGTGATGCTGTATGTGAC  3326
            |||||.||.||||||||.||||||||||..||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 3256  AAATCGACGCTGGACATCAATGAAATGGCGCGTACTGAACGGCCCGACTGGCAGAACGTCATGCTGTATGTTAC  3329

Query 3327  GGCGATCTACAAGTACTTTGAGACC  3351
            .||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 3330  AGCCATCTACAAGTACTTTGAAACC  3354