Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476672
- Subject:
- XM_006514252.3
- Aligned Length:
- 3355
- Identities:
- 2965
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGAAGAAAGCAAGCAGGAGTGTTGGCTCAGTGCCTAAAGTGTCTGCAATAAGTAAAACGCAAACAGCAGAAAA 74
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||.|||.|||||||||.|||.||
Sbjct 1 ATGAAGAAAGCAAACAGGAGTGCTGGCTCAGTGCCTAAGGTGTCTGGGATAAGCAAACCGCAAACAGTAGAGAA 74
Query 75 AATTAAACCTGAAAACAGCTCTTCAGCATCTACGGGAGGCAAACTTGTAAAACCTGGAACAGCAGCATCATTGT 148
||..||.|||||.|||||||||||||||.|.||.||||.|||.|.|||.|..|||||..||||||||.|.||||
Sbjct 75 AAGCAAGCCTGAGAACAGCTCTTCAGCACCCACAGGAGTCAAGCCTGTGAGGCCTGGGGCAGCAGCAGCCTTGT 148
Query 149 CAAAGACCAAGAGCAGTGATGACCTTTTAGCTGGAATGGCCGGAGGGGTAACGGTGACTAATGGTGTTAAAGGA 222
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||..||||||||||||.||||||.|
Sbjct 149 CAAAGACCAAGAGCAATGATGACCTTTTAGCTGGAATGGCTGGAGGAGTAAACGTGACTAATGGTATTAAAGCA 222
Query 223 AAGAAAAGCACCTGCCCATCTGCAGCACCTTCAGCATCTGCCCCTGCCATGACCACCGTGGAGAACAAATCCAA 296
||||||||||||||..||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||||.|..|||||||||.|||||
Sbjct 223 AAGAAAAGCACCTGTTCATCTGCAGCGCCTTCAGCCCCCGCCCCTGCCATGACCATCTCGGAGAACAAGTCCAA 296
Query 297 GATTAGCACAGGCAC-AGCTTCTTCAACCAAGCGGAGCACTTCTACAGGTAATAAAGAATCCAGTTCTACTAGA 369
|||.||||||||||| || |||.|||.||||.|||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 297 GATCAGCACAGGCACTAG-TTCCTCAGCCAAACGGAGTACTTCGGCTGGTAATAAAGAGTCCAGTTCTACTAGA 369
Query 370 GAAAGATTACGTGAACGTACCCGATTAAACCAGAGCAAAAAACTACCTTCTGCAGGTCAGGGAGCTAATGACAT 443
|||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||||.|.||||||||||||||||..|
Sbjct 370 GAAAGATTACGTGAACGCACCCGGCTAAACCAGAGCAAAAAACTGCCCTCTGTAAGTCAGGGAGCTAATGATGT 443
Query 444 GGCATTGGCCAAACGTTCCCGCAGTCGAACTGCTACAGAATGTGACGTTCGTATGAGCAAGTCTAAGTCAGACA 517
||||.||||.||||||||.|||||.||.||||||.||||..||||..||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 444 GGCACTGGCTAAACGTTCACGCAGCCGCACTGCTGCAGAGGGTGATATTCGTATGAGCAAGTCTAAGTCGGACA 517
Query 518 ATCAGATCAGTGACAGAGCTGCTTTGGAGGCCAAAGTGAAGGATCTTCTCACGCTGGCAAAAACCAAAGACGTA 591
|||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.
Sbjct 518 ATCAGATCAGTGACAAAGCTGCTTTGGAAGCCAAGGTGAAAGATCTCCTCACACTGGCGAAAACCAAGGATGTG 591
Query 592 GAAATTTTACATTTGAGAAATGAACTGCGAGACATGCGTGCCCAGCTGGGCATTAATGAGGATCATTCTGAGGG 665
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||.|||.||
Sbjct 592 GAAATTTTACATTTGAGAAATGAACTCCGAGACATGCGTGCTCAGCTGGGCATTAGTGAGGACCATTGTGAAGG 665
Query 666 TGATGAAAAATCTGA---GAAGGAAACTATTATGGCTCACCAGCCGACTGATGTGGAGTCCACTTTATTGCAGT 736
|||.||.|..||||| |||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||.|..|||||.
Sbjct 666 TGAGGACAGGTCTGAGGTGAAGGAAACTATTATTGCTCACCAGCCTACTGACGTGGAGTCTACTCTCCTGCAGC 739
Query 737 TGCAGGAACAGAATACTGCCATCCGTGAAGAACTCAACCAGCTGAAAAATGAAAACAGAATGTTAAAGGACAGG 810
|||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 740 TGCAGGAGCAGAATACAGCCATCCGCGAGGAGCTCAACCAGCTGAAGAATGAAAACAGAATGCTAAAGGACAGG 813
Query 811 TTGAATGCATTGGGCTTTTCCCTAGAGCAGAGGTTAGACAATTCTGAAAAACTGTTTGGCTATCAGTCCCTGAG 884
.|.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CTCAATGCTTTGGGCTTTTCCCTAGAGCAAAGGCTGGACAATTCTGAAAAACTATTTGGCTATCAGTCCCTGAG 887
Query 885 CCCAGAAATCACCCCTGGTAACCAGAGCGATGGAGGAGGAACTCTGACTTCTTCAGTGGAAGGCTCTGCCCCTG 958
|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 888 CCCAGAAATCACCCCTGGTAACCAGAGTGACGGAGGAGGAACTCTGACATCTTCGGTAGAAGGTTCTGCTCCTG 961
Query 959 GCTCAGTGGAGGATCTCTTGAGTCAGGATGAAAATACACTAATGGACCATCAGCACAGTAACTCCATGGACAAT 1032
|.||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 962 GGTCGGTGGAAGATCTCCTGAGTCAGGATGAAAATACACTCATGGACCATCAGCACAGTAACTCCATGGACAAC 1035
Query 1033 TTAGACAGTGAGTGCAGTGAGGTCTACCAGCCCCTCACATCGAGCGATGATGCGCTGGATGCACCATCCTCCTC 1106
.|.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1036 CTGGACAGTGAGTGCAGCGAGGTGTACCAGCCCCTCACTTCCAGCGATGATGCTCTGGACGCCCCCTCCTCTTC 1109
Query 1107 AGAGTCGGAAGGCATCCCCAGCATAGAGCGCTCCCGGAAGGGGAGCAGCGGGAATGCCAGTGAAGTGTCCGTGG 1180
||||||.||.|||.|.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1110 AGAGTCAGAGGGCGTGCCAAGCATTGAGCGCTCTCGGAAGGGGAGCAGTGGGAATGCCAGTGAGGTGTCCGTCG 1183
Query 1181 CTTGCCTGACTGAACGGATACACCAGATGGAAGAGAACCAACACAGTACAAGTGAGGAACTCCAGGCAACCCTG 1254
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1184 CTTGCCTGACAGAACGGATTCACCAGATGGAAGAGAACCAGCACAGCACCAGTGAGGAGCTTCAGGCCACTCTA 1257
Query 1255 CAAGAGCTAGCTGATTTACAGCAGATTACCCAGGAACTGAATAGTGAAAACGAAAGGCTTGGAGAAGAGAAGGT 1328
||.|||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1258 CAGGAGCTGGCTGATCTCCAGCAGATTACCCAGGAGCTCAACAGTGAGAACGAAAGGCTGGGAGAGGAGAAGGT 1331
Query 1329 TATTCTGATGGAGTCTTTATGTCAGCAGAGCGATAAGTTGGAACACTTTAGTCGACAGATTGAATACTTCCGCT 1402
.||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1332 CATTCTGATGGAGTCGCTGTGTCAGCAGAGTGATAAGTTGGAACACTTTGGCCGGCAGATTGAGTATTTCCGTT 1405
Query 1403 CTCTTCTAGATGAGCATCACATTTCTTATGTCATAGATGAAGATGTAAAAAGTGGGCGCTATATGGAATTAGAG 1476
|.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 1406 CCCTTCTTGATGAGCATCACATTTCCTATGTCATAGATGAAGACGTAAAGAGCGGGCGCTATATGGAACTAGAG 1479
Query 1477 CAACGTTACATGGACCTCGCTGAGAATGCCCGTTTTGAACGGGAGCAGCTTCTTGGTGTCCAGCAGCATTTAAG 1550
||.||.||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1480 CAGCGCTACATGGATTTGGCTGAGAATGCCCGTTTTGAGCGAGAGCAGCTTCTAGGTGTGCAGCAGCATTTAAG 1553
Query 1551 CAATACTTTGAAAATGGCAGAACAAGACAATAAGGAAGCTCAAGAAATGATAGGGGCACTCAAAGAACGCAGTC 1624
|||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1554 CAACACTTTGAAGATGGCAGAACAAGATAACAAAGAAGCTCAAGAAATGATAGGTGCCCTCAAAGAGCGCAGCC 1627
Query 1625 ACCATATGGAGCGAATTATTGAGTCTGAGCAGAAAGGAAAAGCAGCCTTGGCAGCCACGTTAGAGGAATACAAA 1698
||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1628 ACCACATGGAGCGGATTATTGAGTCTGAGCAGAAGGGCAAAGCGGCCCTGGCAGCCACATTGGAGGAGTACAAA 1701
Query 1699 GCCACAGTGGCCAGTGACCAGATAGAGATGAATCGCCTGAAGGCTCAGCTGGAGAATGAAAAGCAGAAAGTGGC 1772
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1702 GCTACTGTGGCCAGTGACCAGATAGAGATGAATCGCTTGAAGGCCCAGCTGGAGAACGAAAAGCAGAAGGTGGC 1775
Query 1773 AGAGCTGTATTCTATCCATAACTCTGGAGACAAATCTGATATTCAGGACCTCCTGGAGAGTGTCAGGCTGGACA 1846
.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 TGAGTTGTATTCTATCCATAACTCTGGAGACAAGTCCGATATCCAGGATCTCCTGGAGAGTGTCAGGCTGGACA 1849
Query 1847 AAGAAAAAGCAGAGACTTTGGCTAGTAGCTTGCAGGAAGATCTGGCTCATACCCGAAATGATGCCAATCGATTA 1920
|.|||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1850 AGGAAAAGGCGGAGACTTTGGCCAGTAGCCTGCAGGAAGATCTGGCTCATACCCGAAATGATGCCAATCGGTTA 1923
Query 1921 CAGGATGCCATTGCTAAGGTAGAGGATGAATACCGAGCCTTCCAAGAAGAAGCTAAGAAACAAATTGAAGATTT 1994
|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1924 CAGGACACCATTGCTAAGGTAGAAGATGAATACCGAGCTTTCCAGGAAGAGGCCAAGAAGCAGATTGAAGATTT 1997
Query 1995 GAATATGACGTTAGAAAAATTAAGATCAGACCTGGATGAAAAAGAAACAGAAAGGAGTGACATGAAAGAAACCA 2068
|||||||||.|||||||||.||||||||||..||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1998 GAATATGACATTAGAAAAACTAAGATCAGAGTTGGAGGAAAAGGACACGGAGAGGAGTGACATGAAGGAAACCA 2071
Query 2069 TCTTTGAACTTGAAGATGAAGTAGAACAACATCGTGCTGTGAAACTTCATGACAACCTCATTATTTCTGATCTA 2142
|||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2072 TCTTTGAACTTGAAGATGAGGTGGAGCAGCACCGCGCCGTGAAGCTGCATGACAACCTCATTATCTCTGATCTA 2145
Query 2143 GAGAATACAGTTAAAAAACTCCAGGACCAAAAGCACGACATGGAAAGAGAAATAAAGACACTCCACAGAAGACT 2216
||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2146 GAGAATACAGTTAAGAAACTCCAAGACCAAAAGCATGACATGGAAAGAGAAATCAAGACACTTCACAGGAGACT 2219
Query 2217 TCGGGAAGAATCTGCGGAATGGCGGCAGTTTCAGGCTGATCTCCAGACTGCAGTAGTCATTGCAAATGACATTA 2290
|||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 2220 TCGGGAAGAGTCTGCAGAATGGCGGCAATTTCAGGCTGATCTCCAGACTGCAGTGGTCATTGCCAATGATATCA 2293
Query 2291 AATCTGAAGCCCAAGAGGAGATTGGTGATCTAAAGCGCCGGTTACATGAGGCTCAAGAAAAAAATGAGAAACTC 2364
|.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 2294 AGTCTGAAGCCCAAGAAGAGATCGGTGATCTAAAGCGACGGCTACATGAGGCCCAAGAGAAAAATGAGAAACTC 2367
Query 2365 ACAAAAGAATTGGAGGAAATAAAGTCACGCAAGCAAGAGGAGGAGCGAGGCCGGGTATACAATTACATGAATGC 2438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2368 ACAAAAGAATTGGAGGAAATAAAGTCACGCAAGCAAGAGGAAGAGCGTGGCCGGGTGTATAACTACATGAATGC 2441
Query 2439 CGTTGAGAGAGATTTGGCAGCCTTAAGGCAGGGAATGGGACTGAGTAGAAGGTCCTCGACTTCCTCAGAGCCAA 2512
.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2442 TGTTGAAAGAGATTTGGCAGCCTTGAGGCAAGGGATGGGACTGAGTAGAAGGTCCTCCACTTCCTCAGAACCAA 2515
Query 2513 CTCCTACAGTAAAAACCCTCATCAAGTCCTTTGACAGTGCATCTCAAGTACCAAACCCTGCTGCAGCTGCAATT 2586
||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct 2516 CTCCCACAGTAAAAACCCTCATCAAGTCTTTCGACAGTGCATCTCAAGTACCAAACGCTGCTGCAGCTGCGATC 2589
Query 2587 CCTCGAACGCCCCTGAGCCCAAGTCCTATGAAAACCCCTCCTGCAGCAGCTGTGTCCCCTATGCAGAGACATTC 2660
||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2590 CCTCGAACACCTCTGAGTCCAAGTCCCATGAAAACCCCTCCTGCAGCTGCCGTTTCTCCCATGCAGAGACATTC 2663
Query 2661 CATAAGTGGACCAATCTCAACATCCAAACCCCTGACAGCCCTGTCAGATAAGAGACCAAACTATGGGGAAATCC 2734
|||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||.||..|.|
Sbjct 2664 CATAAGTGGTCCAATCTCAACCTCCAAGCCTCTGACAGCCTTGTCAGATAAGAGATCAAACTATGGAGAGCTTC 2737
Query 2735 CTGTTCAAGAGCATCTGTTAAGAACATCTTCAGCCAGCCGGCCTGCTTCCCTGCCAAGAGTGCCTGCGATGGAA 2808
||||.|||||||||||..||||||||||||||.||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2738 CTGTACAAGAGCATCTACTAAGAACATCTTCAACCAGCCGGCCCGCCTCTCTCCCAAGAGTCCCTGCTATGGAA 2811
Query 2809 AGTGCCAAGACCCTCTCAGTGTCTCGACGAAGTAGTGAAGAAATGAAACGGGACATTTCTGCACAGGAGGGAGC 2882
||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||...|||||.||
Sbjct 2812 AGTGCCAAGACCATCTCAGTGTCTCGACGGAGTAGTGAAGAAATGAAACGGGACATCTCTGCATCTGAGGGCGC 2885
Query 2883 GTCGCCAGCCTCTCTGATGGCTATGGGAACCACGTCTCCACAGCTTTCCCTGTCCTCTTCTCCAACGGCATCTG 2956
|||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2886 GTCACCAGCCTCTCTCATGGCTATGGGCACCACGTCACCACAGCTCTCCCTCTCTTCCTCTCCCACTGCATCTG 2959
Query 2957 TGACTCCCACCACCCGAAGCCGAATAAGAGAAGAAAGGAAAGACCCTCTCTCAGCATTGGCCAGAGAATATGGA 3030
|.|||||.|.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2960 TCACTCCAAGCACCCGGAGCCGAATAAGGGAAGAAAGGAAAGACCCCCTCTCAGCATTGGCAAGAGAATATGGA 3033
Query 3031 GGATCAAAGAGGAACGCCTTGCTGAAGTGGTGTCAGAAGAAAACAGAAGGCTATCAGAATATTGACATTACAAA 3104
||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3034 GGCTCCAAGAGGAACGCCTTGTTGAAGTGGTGTCAGAAGAAAACAGAAGGCTATCAGAATATTGACATCACAAA 3107
Query 3105 CTTCAGCAGCAGCTGGAATGATGGGCTGGCCTTCTGTGCCCTCCTGCATACATATCTCCCTGCCCACATTCCAT 3178
||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||..|.||.|||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 3108 CTTCAGCAGCAGCTGGAACGACGGGCTGGCTTTCTGCGCATTGCTTCATACCTATCTCCCAGCCCACATACCAT 3181
Query 3179 ATCAAGAACTGAACAGCCAGGATAAGAGAAGGAACTTCATGCTGGCTTTCCAGGCAGCTGAAAGTGTCGGCATC 3252
||||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 3182 ATCAAGAACTGAACAGTCAAGATAAGAAAAGGAACTTCACCCTGGCTTTCCAGGCAGCTGAAAGTGTTGGAATC 3255
Query 3253 AAATCCACACTGGACATTAATGAAATGGTACGGACTGAACGACCCGACTGGCAGAACGTGATGCTGTATGTGAC 3326
|||||.||.||||||||.||||||||||..||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 3256 AAATCGACGCTGGACATCAATGAAATGGCGCGTACTGAACGGCCCGACTGGCAGAACGTCATGCTGTATGTTAC 3329
Query 3327 GGCGATCTACAAGTACTTTGAGACC 3351
.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 3330 AGCCATCTACAAGTACTTTGAAACC 3354