Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476705
• Subject: NM_001134738.1
• Aligned Length: 2118
• Identities: 1948
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT  74

Query   75  CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC  148

Query  149  TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA  222

Query  223  GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA  296

Query  297  GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT  370

Query  371  TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG  444

Query  445  CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTTGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTCGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC  518

Query  519  TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCACACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCACACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT  592

Query  593  ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATGTCCGGATGCCTGTGGCCAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATGTCCGGATGCCTGTGGCCAAC  666

Query  667  CCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGACTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGACTTT  740

Query  741  GGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAAGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAAGTG  814

Query  815  ATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCTTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCTTGT  888

Query  889  GACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAATGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAATGC  962

Query  963  ACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCACAG  1036

Query 1037  AGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGACCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGACCCC  1110

Query 1111  AAAGCCTGCAACTGGAAGAAATACAAGTTCATCGTGCTCAACAGCCTCAATCAGAATGCCAAACCAGAGGGGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCCTGCAACTGGAAGAAATACAAGTTCATCGTGCTCAACAGCCTCAACCAGAATGCCAAACCAGAGGGGCC  1184

Query 1185  TGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACCCATGGAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACCCATGGAGC  1258

Query 1259  CTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCACAAGCCAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCACAAGCCAGC  1332

Query 1333  CGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCACCACTCTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCACCACTCTA  1406

Query 1407  CATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCACACCGCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCACACCGCTG  1480

Query 1481  GCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGTGAGAACGGGGCCTTC  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1481  GCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGT---------------  1539

Query 1555  TTCTGCAATGAGTGTGACTGCCGCTTCTCTGAGGAGGCCTCACTCAAGAGGCACACGCTGCAGACCCACAGTGA  1628
                                                                                      
Sbjct 1540  --------------------------------------------------------------------------  1539

Query 1629  CAAACCCTACAAGTGTGACCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGACCGTCC  1702
                                                                                      
Sbjct 1540  --------------------------------------------------------------------------  1539

Query 1703  ATACCGGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGAAAACCCAC  1776
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540  -----GGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGAAAACCCAC  1608

Query 1777  ACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTGGCCCACCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609  ACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTGGCCCACCT  1682

Query 1851  CCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTTCCGGCACC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683  CCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTTCCGGCACC  1756

Query 1925  TTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACCTGCAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757  TTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACCTGCAT  1830

Query 1999  TTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAGGTGCAATA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1831  TTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAGGTGCAATA  1904

Query 2073  CCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC  2118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905  CCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC  1950