Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476750
• Subject: XM_006502908.1
• Aligned Length: 1478
• Identities: 1312
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCAGCAGCAAGAAGCTGACGGGTCGCCTCATGCTGGCCGTGGGAGGAGCAGTGCTTGGCTCCCTGCA  74
            |||            ||||||.|||||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATG------------AAGAAGGTGACGGGCCGCCTCATGTTGGCTGTGGGAGGAGCAGTGCTCGGATCACTGCA  62

Query   75  GTTTGGCTACAACACTGGAGTCATCAATGCCCCCCAGAAGGTGATCGAGGAGTTCTACAACCAGACATGGGTCC  148
            |||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||..||
Sbjct   63  GTTCGGCTATAACACTGGTGTCATCAACGCCCCCCAGAAGGTTATTGAGGAGTTCTACAATCAAACATGGAACC  136

Query  149  ACCGCTATGGGGAGAGCATCCTGCCCACCACGCTCACCACGCTCTGGTCCCTCTCAGTGGCCATCTTTTCTGTT  222
            |||||||.||.|||..|||||...|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  137  ACCGCTACGGAGAGCCCATCCCATCCACCACACTCACCACGCTTTGGTCTCTCTCCGTGGCCATCTTCTCTGTC  210

Query  223  GGGGGCATGATTGGCTCCTTCTCTGTGGGCCTTTTCGTTAACCGCTTTGGCCGGCGGAATTCAATGCTGATGAT  296
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|||||||.||.|||||||||||
Sbjct  211  GGGGGCATGATTGGTTCCTTCTCTGTCGGCCTCTTTGTTAATCGCTTTGGCAGGCGGAACTCCATGCTGATGAT  284

Query  297  GAACCTGCTGGCCTTCGTGTCCGCCGTGCTCATGGGCTTCTCGAAACTGGGCAAGTCCTTTGAGATGCTGATCC  370
            |||||||.|||||||.|||.|.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  GAACCTGTTGGCCTTTGTGGCTGCTGTGCTTATGGGCTTCTCCAAACTGGGCAAGTCCTTTGAGATGCTGATCC  358

Query  371  TGGGCCGCTTCATCATCGGTGTGTACTGCGGCCTGACCACAGGCTTCGTGCCCATGTATGTGGGTGAAGTGTCA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  359  TGGGCCGCTTCATCATCGGTGTGTACTGCGGCCTGACTACTGGCTTTGTGCCCATGTATGTGGGAGAGGTGTCA  432

Query  445  CCCACAGCCCTTCGTGGGGCCCTGGGCACCCTGCACCAGCTGGGCATCGTCGTCGGCATCCTCATCGCCCAGGT  518
            ||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  433  CCTACAGCTCTACGTGGAGCCCTAGGCACACTGCACCAGCTGGGAATCGTCGTTGGCATCCTTATTGCCCAGGT  506

Query  519  GTTCGGCCTGGACTCCATCATGGGCAA--CAAGGACCTGTGGCCCCTGCTGCTGAGCATCATCTTCATCCCGGC  590
            |||.|||.|.|||||||||||||||||  ||  |||.|||||||.||||||||.||..|||||||||||||.||
Sbjct  507  GTTTGGCTTAGACTCCATCATGGGCAATGCA--GACTTGTGGCCTCTGCTGCTCAGTGTCATCTTCATCCCAGC  578

Query  591  CCTGCTGCAGTGCATCGTGCTGCCCTTCTGCCCCGAGAGTCCCCGCTTCCTGCTCATCAACCGCAACGAGGAGA  664
            ||||||.|||||.|||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  579  CCTGCTACAGTGTATCCTGTTGCCCTTCTGCCCCGAGAGCCCCCGCTTCCTGCTCATCAATCGTAACGAGGAGA  652

Query  665  ACCGGGCCAAGAGTGTGCTAAAGAAGCTGCGCGGGACAGCTGACGTGACCCATGACCTGCAGGAGATGAAGGAA  738
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||..|||||||||||||||||.|||
Sbjct  653  ACCGGGCCAAGAGTGTGCTGAAGAAGCTTCGAGGGACAGCCGATGTGACCCGAGACCTGCAGGAGATGAAAGAA  726

Query  739  GAGAGTCGGCAGATGATGCGGGAGAAGAAGGTCACCATCCTGGAGCTGTTCCGCTCCCCCGCCTACCGCCAGCC  812
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  727  GAGGGTCGGCAGATGATGCGGGAGAAGAAGGTCACCATCTTGGAGCTGTTCCGCTCACCCGCCTACCGCCAGCC  800

Query  813  CATCCTCATCGCTGTGGTGCTGCAGCTGTCCCAGCAGCTGTCTGGCATCAACGCTGTCTTCTATTACTCCACGA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  801  CATCCTCATCGCTGTGGTGCTGCAGCTGTCCCAGCAGCTGTCGGGTATCAATGCTGTGTTCTACTACTCAACGA  874

Query  887  GCATCTTCGAGAAGGCGGGGGTGCAGCAGCCTGTGTATGCCACCATTGGCTCCGGTATCGTCAACACGGCCTTC  960
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  GCATCTTCGAGAAGGCAGGTGTGCAGCAGCCTGTGTACGCCACCATCGGCTCCGGTATCGTCAACACGGCCTTC  948

Query  961  ACTGTCGTGTCGCTGTTTGTGGTGGAGCGAGCAGGCCGGCGGACCCTGCACCTCATAGGCCTCGCTGGCATGGC  1034
            |||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  949  ACTGTGGTGTCGCTGTTTGTTGTAGAGCGAGCTGGACGACGGACCCTGCACCTCATTGGCCTGGCTGGCATGGC  1022

Query 1035  GGGTTGTGCCATACTCATGACCATCGCGCTAGCACTGCTGGAGCAGCTACCCTGGATGTCCTATCTGAGCATCG  1108
            .||.|||||..|.||||||||||||||.||.||..|||||||.|.|||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  AGGCTGTGCTGTGCTCATGACCATCGCCCTGGCCTTGCTGGAACGGCTGCCTTGGATGTCCTATCTGAGCATCG  1096

Query 1109  TGGCCATCTTTGGCTTTGTGGCCTTCTTTGAAGTGGGTCCTGGCCCCATCCCATGGTTCATCGTGGCTGAACTC  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 1097  TGGCCATCTTTGGCTTTGTGGCCTTCTTTGAAGTAGGCCCTGGTCCTATTCCATGGTTCATTGTGGCCGAGCTG  1170

Query 1183  TTCAGCCAGGGTCCACGTCCAGCTGCCATTGCCGTTGCAGGCTTCTCCAACTGGACCTCAAATTTCATTGTGGG  1256
            |||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1171  TTCAGCCAGGGGCCCCGTCCTGCTGCTATTGCTGTGGCTGGCTTCTCCAACTGGACCTCAAACTTCATTGTGGG  1244

Query 1257  CATGTGCTTCCAGTATGTGGAGCAACTGTGTGGTCCCTACGTCTTCATCATCTTCACTGTGCTCCTGGTTCTGT  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 1245  CATGTGCTTCCAGTATGTGGAGCAACTGTGCGGCCCCTACGTCTTCATCATCTTCACGGTGCTCCTCGTGCTCT  1318

Query 1331  TCTTCATCTTCACCTACTTCAAAGTTCCTGAGACTAAAGGCCGGACCTTCGATGAGATCGCTTCCGGCTTCCGG  1404
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319  TCTTCATCTTCACCTACTTCAAAGTCCCTGAGACCAAAGGCCGAACCTTCGATGAGATCGCTTCCGGCTTCCGG  1392

Query 1405  CAGGGGGGAGCCAGCCAAAGTGACAAGACACCCGAGGAGCTGTTCCATCCCCTGGGGGCTGATTCCCAAGTG  1476
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1393  CAGGGGGGTGCCAGCCAAAGTGACAAGACACCCGAGGAGCTCTTCCACCCTCTGGGGGCGGACTCCCAAGTG  1464