Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476753
• Subject: NM_007943.3
• Aligned Length: 2706
• Identities: 2058
• Gaps: 436

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGGCGGCCCAGCTCTCTCTGACACAGTTATCAAGTGGGAATCCTGTATATGAAAAATACTATAGACA  74
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGGCAGCCCAGCTCTCCCTGACACAGTTGTCAAGTGGGAATCCTGTATATGAAAAATACTACAGACA  74

Query   75  GGTTGATACAGGCAATACTGGAAGGGTGTTGGCTTCTGATGCTGCTGCTTTCCTGAAAAAATCAGGGCTTCCAG  148
            ||||||..|||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGTTGAGGCAGGCAATACTGGAAGGGTGTTGGCGTTAGATGCTGCTGCATTCCTGAAAAAGTCAGGGCTTCCAG  148

Query  149  ACTTGATACTTGGAAAGATTTGGGATTTAGCCGACACAGATGGCAAAGGTATCCTGAACAAACAAGAATTCTTT  222
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTTGATTCTTGGAAAGATTTGGGATTTAGCTGACACAGATGGCAAAGGTGTCCTGAGCAAACAAGAATTCTTT  222

Query  223  GTTGCTTTGCGTCTTGTGGCATGTGCCCAGAATGGATTGGAAGTTTCACTAAGTAGTTTGAACCTGGCTGTTCC  296
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||..|.|..|||||||||||
Sbjct  223  GTTGCTTTACGGCTTGTGGCATGTGCTCAGAATGGACTGGAAGTTTCACTGAGTAGCCTAAGTCTGGCTGTTCC  296

Query  297  TCCACCAAGATTTCATGATACCAGTAGTCCTTTGCTAATCAGTGGAACCTCTGCAGCTGAGCTCCCATGGGCTG  370
            ||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||.||||||..||||.|..|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  TCCACCAAGATTTCATGACTCCAGCAGTCCGTTGCTAACCAGTGGGCCCTCAGTTGCTGAGCTCCCGTGGGCTG  370

Query  371  TAAAACCTGAAGATAAGGCCAAATATGATGCAATATTTGATAGTTTAAGCCCAGTGAATGGATTTCTGTCTGGT  444
            ||||..||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  371  TAAAGTCTGAAGATAAAGCCAAATATGATGCAATTTTTGACAGTTTAAGCCCAGTGGATGGATTTTTGTCTGGT  444

Query  445  GATAAAGTGAAACCAGTGTTGCTCAACTCTAAGTTACCTGTGGATATCCTTGGAAGAGTTTGGGAGTTGAGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATAAAGTGAAACCAGTGTTGCTCAACTCTAAGTTACCTGTGGAAATCCTTGGAAGAGTTTGGGAGTTGAGTGA  518

Query  519  TATTGACCATGATGGAATGCTTGACAGAGATGAGTTTGCAGTTGCTATGTTTTTGGTATACTGTGCACTGGAGA  592
            |||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATTGACCACGATGGAAAGCTGGACAGAGATGAGTTTGCAGTTGCCATGTTTTTGGTATACTGTGCACTGGAGA  592

Query  593  AAGAACCTGTGCCAATGTCCTTGCCTCCAGCCTTGGTGCCACCATCTAAGAGAAAAACGTGGGTTGTATCCCCT  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAACCTGTGCCAATGTCCTTGCCTCCAGCCTTGGTGCCACCTTCTAAGAGAAAAACGTGGGTTGTATCCCCT  666

Query  667  GCAGAAAAAGCTAAATATGATGAAATCTTCCTGAAAACTGATAAAGATATGGACGGATTTGTGTCTGGATTGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||.||||||||||.||||
Sbjct  667  GCAGAAAAAGCTAAATATGATGAAATTTTTCTGAAAACTGATAAGGATATGGATGGATATGTGTCTGGACTGGA  740

Query  741  GGTCCGTGAAATATTCTTGAAAACAGGTTTACCTTCTACCTTACTAGCCCATATATGGTCATTATGCGACACAA  814
            |||||||||||..|||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||||||.||||.|||||||
Sbjct  741  GGTCCGTGAAACCTTCCTGAAAACAGGTTTACCTTCTGCCTTGCTAGCCCACATTTGGTCACTATGTGACACAA  814

Query  815  AGGACTGTGGGAAGCTTTCAAAGGATCAGTTTGCCTTGGCTTTTCACTTAATCAGTCAGAAGTTAATCAAGGGC  888
            |||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|||
Sbjct  815  AGGGCTGTGGGAAGCTTTCAAAAGACCAGTTTGCCTTGGCTTTTCACTTAATCAATCAGAAGTTAATAAAAGGC  888

Query  889  ATTGATCCTCCTCACGTTCTTACTCCTGAAATGATTCCACCATCAGACAGGGCCAGTTTACAAAAGAACATCAT  962
            |||||.||||||||...|||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.
Sbjct  889  ATTGACCCTCCTCATAGTCTCACTCCTGAGATGATTCCACCATCAGACAGATCCAGTTTACAAAAGAACATCAC  962

Query  963  AGGATCAAGTCCTGTTGCAGATTTCTCTGCTATTAAGGAACTAGATACTCTTAACAATGAAATAGTTGACCTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  963  AGGATCAAGTCCTGTTGCAGATTTTTCTGCTATTAAGGAACTAGATACCCTTAACAATGAAATAGTTGACCTGC  1036

Query 1037  AGAGGGAAAAGAATAATGTGGAACAGGACCTTAAGGAGAAGGAAGATACTATTAAACAGAGGACAAGTGAGGTT  1110
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||..||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  AGAGGGAAAAGAACAATGTGGAGCAGGACCTTAAAGAGAAGGAAGACACAGTTAAGCAGAGGACCAGTGAGGTT  1110

Query 1111  CAGGATCTTCAAGATGAAGTTCAAAGGGAGAATACTAATCTGCAAAAACTACAGGCCCAGAAACAGCAGGTACA  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1111  CAGGATCTTCAAGATGAAGTTCAAAGGGAGAGTATTAATCTACAAAAACTGCAGGCCCAGAAGCAGCAGGTGCA  1184

Query 1185  GGAACTCCTTGATGAACTGGATGAGCAGAAAGCCCAGCTGGAGGAGCAACTCAAGGAAGTCAGAAAGAAATGTG  1258
            |||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1185  GGAGCTCCTGGGTGAACTGGATGAGCAGAAAGCCCAGCTGGAGGAGCAGCTCCAGGAAGTCAGGAAAAAGTGTG  1258

Query 1259  CTGAGGAGGCCCAACTG---------------------------------------------------------  1275
            |||||||||||||.|||                                                         
Sbjct 1259  CTGAGGAGGCCCAGCTGATTTCTTCCCTGAAAGCAGAAATAACTAGTCAAGAATCTCAGATCTCCAGTTATGAG  1332

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct 1333  GAAGAACTGTTGAAAGCTAGAGAAGAACTAAGTCGCCTACAACAAGAAACAGCACAATTGGAAGAAAGTGTGGA  1406

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct 1407  GTCAGGGAAGGCTCAGCTGGAACCTCTTCAGCAGCACCTACAAGAGTCACAACAGGAAATCAGCTCAATGCAAA  1480

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct 1481  TGAGATTGGAAATGAAAGATCTGGAAACTGATAATAACCAATCAAATTGGAGCAGTAGCCCACAAAGCGTTCTT  1554

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct 1555  GTTAATGGTGCTACAGATTACTGTAGCCTCAGCACCAGCAGCAGTGAAACAGCCAACTTCAACGAACATGCTGA  1628

Query 1276  ----------------------------------------------GCAAGAAGTAGTCCTGAACTACTGCCTT  1303
                                                          |.||||||||||||||||.|....||||
Sbjct 1629  AGGCCAAAACAACCTAGAGTCTGAACCCACACACCAGGAGTCCTCAGTAAGAAGTAGTCCTGAAATCGCACCTT  1702

Query 1304  CTGGTGTGACTGATGAAAATGAG---GTGACTACAGCTGTTACTGAAAAAGTTTGTTCTGAACTC--------G  1366
            |||.||||||||||||||.||||   ||||||...||||.||.|||.||||||        ||||        |
Sbjct 1703  CTGATGTGACTGATGAAAGTGAGGCTGTGACTGTGGCTGGTAATGAGAAAGTT--------ACTCCGAGATTTG  1768

Query 1367  ACAATAATAGACATTCAAAAGAGGAAGATCCATTTAATGTAGACTCAAGTTCGCTGACAGGTCCAGTTGCAGAT  1440
            ||.||.|.|..||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1769  ACGATGACAAGCACTCAAAAGAGGAAGATCCATTTAATGTAGAATCAAGTTCACTGACAGATGCAGTTGCAGAT  1842

Query 1441  ACAAACTTGGATTTTTTCCAGTCTGATCCTTTTGTTGGCAGTGATCCTTTCAAGGATGATCCTTTTGGAAAAAT  1514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843  ACAAACTTGGATTTTTTCCAGTCTGATCCTTTTGTTGGCAGTGATCCTTTCAAGGATGATCCTTTTGGAAAAAT  1916

Query 1515  CGATCCATTTGGTGGTGATCCTTTCAAAGGTTCAGATCCATTTGCATCAGACTGTTTCTTCAGGCA---ATCTA  1585
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|.|||   .||||
Sbjct 1917  TGATCCATTTGGTGGTGACCCTTTCAAAGGCTCAGATCCTTTTGCGTCTGATTGCTTCTTTAAGCAGACTTCTA  1990

Query 1586  CTGATCCTTTTGCCACTTCAAGCACTGACCCTTTCAGTGCAGCCAACAATAGCAGTATTACATCGGTAGAAACG  1659
            |||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|||.|||.|||||||.|||||||||||||||.
Sbjct 1991  CTGATCCTTTTACCACTTCAAGTACGGACCCTTTCAGTGCATCCAGCAACAGCAGTAATACATCGGTAGAAACT  2064

Query 1660  TTGAAGCACAATGATCCTTTTGCTCCTGGTGGAACAGTTGT---TGCAGCAAGCGATTCAGCCACAGACCCCTT  1730
            |.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||   ||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2065  TGGAAGCACAATGACCCATTTGCTCCTGGTGGAACAGTTGTTGCTGCAGCGAGTGATTCAGCCACAGACCCTTT  2138

Query 1731  TGCTTCTGTTTTTGGGAATGAATCATTTGGAGGTGGATTTGCTGACTTCAGCACATTGTCAAAGGTCAACAATG  1804
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2139  TGCTTCTGTTTTCGGAAATGAATCATTTGGAGATGGATTTGCTGACTTCAGCACATTATCAAAGGTCAACAATG  2212

Query 1805  AAGATCCTTTTCGTTCAGCCACATCGAGCTCTGTCAGCAACGTAGTG---ATTACAAAAAATGTATTTGAGGAA  1875
            |||||.|||||..|.|..|||.|||.||.|||..|||||  || |||   |||.|||||..|.|.||.||||||
Sbjct 2213  AAGATGCTTTTAATCCTACCATATCAAGTTCTACCAGCA--GT-GTGACCATTGCAAAACCTATGTTAGAGGAA  2283

Query 1876  ACATCGGTCAAAAGTGAAGATGAACCCCCAGCACTGCC-ACCAAAGATCGGAACTCCAACAAGACCCTGCCCTC  1948
            |||.|...|||.||||||||||..||.||||||||||| .|||||| |.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2284  ACAGCCAGCAAGAGTGAAGATGTGCCTCCAGCACTGCCGCCCAAAG-TTGGCACTCCAACAAGACCTTGCCCGC  2356

Query 1949  TACCACCTGGGAAAAGATCCATCAACAAATTGGATTCTCCTGATCCCTTTAAACTGAATGATCCATTTCAGCCT  2022
            .|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357  CACCCCCTGGGAAAAGACCCATCAACAAATTGGATTCTTCTGATCCCCTTAAACTGAATGATCCATTTCAGCCT  2430

Query 2023  TTCCCAGGCAACGATAGCCCCAAAGAAAAAGATCCTGAAATGTTTTGTGATCCATTCACTTCTGCTACTACCAC  2096
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||   ||.|||||||
Sbjct 2431  TTCCCAGGCAATGATAGTCCCAAAGAAAAAGATCCTGATATGTTTTGTGATCCATTCACTT---CTTCTACCAC  2501

Query 2097  TACCAATAAAGAGGCTGATCCAAGCAATTTTGCCAACTTCAGTGCTTATCCCTCTGAAGAAGATATGATCGAAT  2170
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2502  TACCAATAAAGAGGCTGACCCAAGCAATTTTGCTAACTTCAGTGCTTATCCCTCTGAAGAAGATATGATTGAAT  2575

Query 2171  GGGCCAAGAGGGAAAGTGAGAGAGAGGAAGAGCAGAGGCTTGCCCGACTAAATCAGCAGGAACAAGAAGACTTA  2244
            ||||.||.||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2576  GGGCAAAAAGGGAAAGTGAGCGGGAAGAAGAACAGAGGCTTGCCAGACTAAATCAGCAGGAGCAAGAAGACTTG  2649

Query 2245  GAACTGGCTATTGCACTCAGCAAATCTGAGATAT-AGAAGCA  2285
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.| |||||||
Sbjct 2650  GAACTGGCCATTGCACTTAGCAAATCTGAGATCTCAGAAGCA  2691