Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476755
• Subject: XM_005252086.1
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1449
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGATTTGGGAAAGGACCAATCTCATTTGAAGCACCATCAGACACCTGACCCTCATCAAGAAGAGAACCATTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATTTGGGAAAGGACCAATCTCATTTGAAGCACCATCAGACACCTGACCCTCATCAAGAAGAGAACCATTC  74

Query   75  TCCAGAAGTCATTGGAACCTGGAGTTTGAGAAACAGAGAACTACTTAGAAAAAGAAAAGCTGAAGTGCATGAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCAGAAGTCATTGGAACCTGGAGTTTGAGAAACAGAGAACTACTTAGAAAAAGAAAAGCTGAAGTGCATGAAA  148

Query  149  AGGAAACATCACAATGGCTATTTGGAGAACAGAAAAAACGCAAGCAGCAGAGAACAGGAAAAGGAAATCGAAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAAACATCACAATGGCTATTTGGAGAACAGAAAAAACGCAAGCAGCAGAGAACAGGAAAAGGAAATCGAAGA  222

Query  223  GGCAGAAAGAGACAACAAAACACAGAATTGAAGGTGGAGCCTCAGCCACAGATAGAAAAGGAAA---TGGAGAA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||
Sbjct  223  GGCAGAAAGAGACAACAAAACACAGAATTGAAGGTGGAGCCTCAGCCACAGATAGAAAAGGAAATAGTGGAGAA  296

Query  294  AGCACTGGCACCTATAGAGAAAAAAACTGAGCCACCTGGGAGCATAACCAAAGTATTTCCTTCAGTAGCCTCCC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCACTGGCACCTATAGAGAAAAAAACTGAGCCACCTGGGAGCATAACCAAAGTATTTCCTTCAGTAGCCTCCC  370

Query  368  CGCAAAAAGTTGTGCCTGAGGAACACTTTTCTGAAATATGTCAAGAAAGTAACATATATCAGGAGAATTTTTCT  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGCAAAAAGTTGTGCCTGAGGAACACTTTTCTGAAATATGTCAAGAAAGTAACATATATCAGGAGAATTTTTCT  444

Query  442  GAGTACCAAGAAATAGCAGTACAAAACCATTCTTCTGAAACATGCCAACATGTGTCTGAACCTGAAGACCTCTC  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGTACCAAGAAATAGCAGTACAAAACCATTCTTCTGAAACATGCCAACATGTGTCTGAACCTGAAGACCTCTC  518

Query  516  TCCTAAAATGTACCAAGAAATATCTGTACTTCAAGACAATTCTTCCAAAATATGCCAAGACATGAAGGAACCTG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTAAAATGTACCAAGAAATATCTGTACTTCAAGACAATTCTTCCAAAATATGCCAAGACATGAAGGAACCTG  592

Query  590  AAGACAACTCTCCTAACACATGCCAAGTAATATCTGTAATTCAAGACCATCCTTTCAAAATGTACCAAGATATG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGACAACTCTCCTAACACATGCCAAGTAATATCTGTAATTCAAGACCATCCTTTCAAAATGTACCAAGATATG  666

Query  664  GCTAAACGAGAAGATCTGGCTCCTAAAATGTGCCAAGAAGCTGCTGTACCCAAAATCCTTCCTTGTCCAACATC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTAAACGAGAAGATCTGGCTCCTAAAATGTGCCAAGAAGCTGCTGTACCCAAAATCCTTCCTTGTCCAACATC  740

Query  738  TGAAGACACAGCTGATCTGGCAGGATGCTCTCTTCAAGCATATCCAAAACCAGATGTGCCTAAAGGCTATATTC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAGACACAGCTGATCTGGCAGGATGCTCTCTTCAAGCATATCCAAAACCAGATGTGCCTAAAGGCTATATTC  814

Query  812  TTGACACAGACCAAAATCCAGCAGAACCAGAGGAATACAATGAAACAGATCAAGGAATAGCTGAGACAGAAGGC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGACACAGACCAAAATCCAGCAGAACCAGAGGAATACAATGAAACAGATCAAGGAATAGCTGAGACAGAAGGC  888

Query  886  CTTTTTCCTAAAATACAAGAAATAGCTGAGCCTAAAGACCTTTCTACAAAAACACACCAAGAATCAGCTGAACC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTTTTCCTAAAATACAAGAAATAGCTGAGCCTAAAGACCTTTCTACAAAAACACACCAAGAATCAGCTGAACC  962

Query  960  TAAATACCTTCCTCATAAAACATGTAACGAAATTATTGTGCCTAAAGCCCCCTCTCATAAAACAATCCAAGAAA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAATACCTTCCTCATAAAACATGTAACGAAATTATTGTGCCTAAAGCCCCCTCTCATAAAACAATCCAAGAAA  1036

Query 1034  CACCTCATTCTGAAGACTATTCAATTGAAATAAACCAAGAAACTCCTGGGTCTGAAAAATATTCACCTGAAACG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACCTCATTCTGAAGACTATTCAATTGAAATAAACCAAGAAACTCCTGGGTCTGAAAAATATTCACCTGAAACG  1110

Query 1108  TATCAAGAAATACCTGGGCTTGAAGAATATTCACCTGAAATATACCAAGAAACATCCCAGCTTGAAGAATATTC  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATCAAGAAATACCTGGGCTTGAAGAATATTCACCTGAAATATACCAAGAAACATCCCAGCTTGAAGAATATTC  1184

Query 1182  ACCTGAAATATACCAAGAAACACCGGGGCCTGAAGACCTCTCTACTGAGACATATAAAAATAAGGATGTGCCTA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCTGAAATATACCAAGAAACACCGGGGCCTGAAGACCTCTCTACTGAGACATATAAAAATAAGGATGTGCCTA  1258

Query 1256  AAGAATGCTTTCCAGAACCACACCAAGAAACAGGTGGGCCCCAAGGCCAGGATCCTAAAGCACACCAGGAAGAT  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGAATGCTTTCCAGAACCACACCAAGAAACAGGTGGGCCCCAAGGCCAGGATCCTAAAGCACACCAGGAAGAT  1332

Query 1330  GCTAAAGATGCTTATACTTTTCCTCAAGAAATGAAAGAAAAACCCAAAGAAGAGCCAGGAATACCAGCAATTCT  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTAAAGATGCTTATACTTTTCCTCAAGAAATGAAAGAAAAACCCAAAGAAGAGCCAGGAATACCAGCAATTCT  1406

Query 1404  GAATGAGAGTCATCCAGAAAATGATGTCTATAGTTATGTTTTGTTT  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAATGAGAGTCATCCAGAAAATGATGTCTATAGTTATGTTTTGTTT  1452