Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476788
• Subject: XM_005259208.3
• Aligned Length: 1446
• Identities: 1252
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT  74
            |||.|.|...||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCAAAGCTCTACGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGATCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCATTCC------ACCCTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA  216
            |||||||||      |..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||.|||||||
Sbjct  149  AACCATTCCATGGAGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGGTGATGGGGACAACAAGCCAAAGA  222

Query  217  GAAGGAAATTCAGGCGGCA------------------AGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC  272
            |||||.||||..||.||||                  |||||.||.|.|||||||||.||||||||||.|...|
Sbjct  223  GAAGGGAATTTGGGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTC  296

Query  273  TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT  346
            .|||.|||||||.||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||..|||.|||||.|||.|||||.|
Sbjct  297  CTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGT  370

Query  347  TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA  420
            |.||||||||||.|||...||||||||||.||.|.|||.|||||||||.|.||||.|||.||.|.|||||||..
Sbjct  371  TATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTC  444

Query  421  CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA  494
            |||..||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||..|.||||||||
Sbjct  445  CAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGA  518

Query  495  GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC  568
            ||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  GAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCC  592

Query  569  ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT  642
            ||.||.|||.||||..||.|||||||||..||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct  593  ACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCAT  666

Query  643  GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT  716
            .|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|...|||
Sbjct  667  CAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT  740

Query  717  TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG  790
            |.|||||||.|||||||||||||...|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||.|||.
Sbjct  741  TAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACA  814

Query  791  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC  864
            ||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC  888

Query  865  TTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAGGAGTG  938
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.
Sbjct  889  TTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAAAAGTA  962

Query  939  TGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTACAATT  1012
            |||||.|||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|..|||||||||||.||.||||
Sbjct  963  TGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAACCATATAATT  1036

Query 1013  GTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGAAAAA  1086
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||.|||||||||.
Sbjct 1037  GTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGAGAAAAG  1110

Query 1087  CCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCCATAC  1160
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||...|||.||
Sbjct 1111  CCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACAC  1184

Query 1161  TGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCATAAGA  1234
            .|||||||||.|||||||.|||.|..|.||.||||||||||||||.|..|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGA  1258

Query 1235  AACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTGTAAA  1308
            ||||||||||||..|.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||..||||||.|.|||||||
Sbjct 1259  AACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAA  1332

Query 1309  GACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTT  1382
            |||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTT  1406

Query 1383  GAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1407  GAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1446