Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476788
• Subject: XM_005259209.3
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1192
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCA----------------------------AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGT  46
            ||||.| .|||||                            ||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGATC-GATTCAGGAGAAAAGAAGCCTGGGCGGAGAGCAGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGA  73

Query   47  TCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAAC  120
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct   74  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAAC  147

Query  121  TTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACCCTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGAT  194
            ||||.|||||||||.||||||||                               |||.|||             
Sbjct  148  TTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGG-------------------------------AGGCAAG-------------  177

Query  195  GATGGAGACAGCAACCCAAA--GAGAAGGAAATTCAGGCGGCAAGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGA  266
                         |.|||||  ||||.||              |||||.||.|.|||||||||.||||||||||
Sbjct  178  -------------ATCCAAACTGAGATGG--------------AGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGA  224

Query  267  CTGCCCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATT  340
            .|...|.|||.|||||||.||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||..|||.|||||.|||.|
Sbjct  225  ATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACT  298

Query  341  CTCACTTCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAA  414
            ||||.||.||||||||||.|||...||||||||||.||.|.|||.|||||||||.|.||||.|||.||.|.|||
Sbjct  299  CTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAA  372

Query  415  CCTTCACAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTC  488
            ||||..|||..||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||..|.||
Sbjct  373  CCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTC  446

Query  489  AGGAGAGAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGA  562
            ||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||
Sbjct  447  AGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGA  520

Query  563  GAGTTCACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAA  636
            |.||.|||.||.|||.||||..||.|||||||||..||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct  521  GGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAA  594

Query  637  ACTCGTGAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGC  710
            ||||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  595  ACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATC  668

Query  711  GATACTTCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCA  784
            ...||||.|||||||.|||||||||||||...|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  669  AGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCA  742

Query  785  TTCACGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGT  858
            |.|||.||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  743  TGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGT  816

Query  859  AAGAGCTTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGA  932
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  AAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGA  890

Query  933  GGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGT  1006
            ..|||.|||||.|||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|..|||||||||||.|
Sbjct  891  AAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAACCAT  964

Query 1007  ACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGA  1080
            |.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||.||||
Sbjct  965  ATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGA  1038

Query 1081  GAAAAACCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGT  1154
            |||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||...
Sbjct 1039  GAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAAC  1112

Query 1155  CCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATC  1228
            |||.||.|||||||||.|||||||.|||.|..|.||.||||||||||||||.|..|||||.|||||||||||||
Sbjct 1113  CCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATC  1186

Query 1229  ATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTC  1302
            ||||||||||||||||||..|.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||..||||||.|.|
Sbjct 1187  ATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATAC  1260

Query 1303  TGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAG  1376
            |||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261  TGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAG  1334

Query 1377  GCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1335  GCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1380