Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476797
• Subject: NM_001360167.1
• Aligned Length: 1911
• Identities: 1384
• Gaps: 486

Alignment

Query    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74

Query   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC  148

Query  149  AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCA  222
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCA  222

Query  223  CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCA  296

Query  297  CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC  370

Query  371  CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG  444

Query  445  GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA  518

Query  519  CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT  592

Query  593  ACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT  666
            |||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTATTATACAAACACCCCCCGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT  666

Query  667  AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC  740

Query  741  TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC  814

Query  815  CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGC  888

Query  889  TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGAT  962

Query  963  CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTC  1036

Query 1037  AGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA  1110
            |||||.||.|..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTCACGGGGTTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA  1110

Query 1111  ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG  1184

Query 1185  GTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG  1258

Query 1259  GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTG--------GTCTGGGAAGATAC-  1323
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |.|..|||..|.|| 
Sbjct 1259  GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGCCTCACACGCCAAGGATTACACA  1332

Query 1324  CTGGAGGTTTTGAT-----TGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTC---CTCCTCTTCCTCCTC  1389
            .|||||..|.|.||     ||||  |..||..|.|||.||||||.||   ||||||   .|.||.||       
Sbjct 1333  GTGGAGAATCTCATCCGCATGGG--CATGGCAGGCTTGGTCCTGGTG---TTCCTCGGGATTCTGTT-------  1394

Query 1390  CTCCGACG-TCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGG  1462
            .|..||.| ||||   |||||                  |||||||||         ||               
Sbjct 1395  ATTTGAGGCTCAG---CACAG------------------CCAGAGAAA---------CC---------------  1423

Query 1463  CTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAAC  1536
                          ||||||   |.|   |.||.| |||||                                 
Sbjct 1424  --------------CCCAAG---ATG---CAGCCG-GGAGG---------------------------------  1443

Query 1537  CTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGA  1610
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1611  CCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCAC  1684
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1685  TGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCA  1758
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1759  TCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCC  1832
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1833  TCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1893
                                                                         
Sbjct 1444  -------------------------------------------------------------  1443