Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000476797
Subject:
NR_135493.2
Aligned Length:
2770
Identities:
1868
Gaps:
877

Alignment

Query    1  -------------------------------ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GCAGAGCGCGGGGTCACCGGGAGGAGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC  74

Query   44  TGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC  117
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGCCCCAGGACCCGCATGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC  148

Query  118  AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGG  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGG  222

Query  192  AAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA  265
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA  296

Query  266  CAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG  339
            ||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG  370

Query  340  GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG  444

Query  414  GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC  518

Query  488  TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAAC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACC  592

Query  562  CCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGA  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGA  666

Query  636  CCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC  740

Query  710  CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA  814

Query  784  CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT  888

Query  858  GAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCG  931
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  889  GAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTG  962

Query  932  ACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG  1005
            ||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG  1036

Query 1006  GCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG  1079
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG  1110

Query 1080  GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC  1184

Query 1154  CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC  1258

Query 1228  CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC  1332

Query 1302  CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC  1406

Query 1376  TCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCT------------------------  1425
            ||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct 1407  TCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGGGCTGAGACTCTGTCCATCTTCA  1480

Query 1426  ----GACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGC  1495
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCAGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGC  1554

Query 1496  TGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAG  1569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCTGTGAAGGACACACAGTCTGAG  1628

Query 1570  GACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACA  1643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACA  1702

Query 1644  CTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGAC  1717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGAC  1776

Query 1718  AGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAG  1791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAG  1850

Query 1792  CTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCC  1865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCC  1924

Query 1866  CAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC----------------------------------------------  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 1925  CAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCACTAGCCCGGGGGGTACGCAGACCCCACACTCAGCAGAAGGAGACTCA  1998

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 1999  GGACTGCTGAAGGCACGGGAGCTGCCCCCAGTGGACACCAGTGAACCCCAGTCAGCCTGGACCCCTAACACAGA  2072

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2073  CCATGAGGAGACGCTGGGAACTTGTGGGACTCACCTGACTCAAAGATGACTAATATCGTCCCATTTTGGAAATA  2146

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2147  AAGCAACAGACTTCTCAACAATCAATGAGTTAATAACAAAAAAACAAAAAACAAAAACAGACGTAAAGGCCGGG  2220

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2221  TGTGGTACTCAGGAGGCTGAGTGGGGAGGATTCCTTGAACACAAGAAGTTAAGGCTGCTGAGGCTGCAGTGAGC  2294

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2295  TATGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGTGTGACAGAGCGAGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAACAGTGAATGT  2368

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2369  TTTAAACTGAATGATAATGTAAATATTATACATCGAACTTATGACATGGGAAAATTAAGAAGCATAAATAGGCC  2442

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2443  GGGCGCGGTGGCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGATGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATC  2516

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2517  GAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCG  2590

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2591  AGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAGCCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGT  2664

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2665  GAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTCCGTCTCGAAAAAAAAAAAAAAAGA  2738

Query 1894  --------------------------------  1893
                                            
Sbjct 2739  AAGAAAAAAAATAAAAAAGAAGCATAACCAGG  2770