Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476797
• Subject: NR_135495.2
• Aligned Length: 2742
• Identities: 1792
• Gaps: 929

Alignment

Query    1  -------------------------------ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GCAGAGCGCGGGGTCACCGGGAGGAGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC  74

Query   44  TGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC  117
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGCCCCAGGACCCGCATGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC  148

Query  118  AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGG  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGG  222

Query  192  AAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA  265
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA  296

Query  266  CAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG  339
            ||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG  370

Query  340  GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG  444

Query  414  GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC  518

Query  488  TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAAC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACC  592

Query  562  CCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGA  635
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  593  CCCAGCCACAGGTGG-----------------------------------------------------------  607

Query  636  CCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC  709
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  ---------------------AGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC  660

Query  710  CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA  734

Query  784  CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT  808

Query  858  GAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCG  931
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  809  GAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTG  882

Query  932  ACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG  1005
            ||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  ACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG  956

Query 1006  GCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG  1079
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG  1030

Query 1080  GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC  1104

Query 1154  CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC  1178

Query 1228  CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC  1252

Query 1302  CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC  1326

Query 1376  TCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAG  1449
            ||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  TCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAG  1400

Query 1450  CGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGT  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  CGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGT  1474

Query 1524  CCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCC  1597
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  CCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCTGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCC  1548

Query 1598  CACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCT  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549  CACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCT  1622

Query 1672  CCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACAC  1745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623  CCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACAC  1696

Query 1746  TGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGG  1819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697  TGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGG  1770

Query 1820  CAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771  CAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1844

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 1845  TAGCCCGGGGGGTACGCAGACCCCACACTCAGCAGAAGGAGACTCAGGACTGCTGAAGGCACGGGAGCTGCCCC  1918

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 1919  CAGTGGACACCAGTGAACCCCAGTCAGCCTGGACCCCTAACACAGACCATGAGGAGACGCTGGGAACTTGTGGG  1992

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 1993  ACTCACCTGACTCAAAGATGACTAATATCGTCCCATTTTGGAAATAAAGCAACAGACTTCTCAACAATCAATGA  2066

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2067  GTTAATAACAAAAAAACAAAAAACAAAAACAGACGTAAAGGCCGGGTGTGGTACTCAGGAGGCTGAGTGGGGAG  2140

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2141  GATTCCTTGAACACAAGAAGTTAAGGCTGCTGAGGCTGCAGTGAGCTATGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTG  2214

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2215  TGTGACAGAGCGAGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAACAGTGAATGTTTTAAACTGAATGATAATGTAAATATTA  2288

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2289  TACATCGAACTTATGACATGGGAAAATTAAGAAGCATAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTATAATCTC  2362

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2363  AGCACTTTGGGAGGCTGATGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAAC  2436

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2437  CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGAGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAG  2510

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2511  GCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAGCCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAG  2584

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2585  CCTGGGCGACAGAGTGAGATTCCGTCTCGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAATAAAAAAGAAGCATAAC  2658

Query 1894  ----  1893
                
Sbjct 2659  CAGG  2662