Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476797
• Subject: NR_135496.2
• Aligned Length: 2831
• Identities: 1844
• Gaps: 944

Alignment

Query    1  -------------------------------ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GCAGAGCGCGGGGTCACCGGGAGGAGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC  74

Query   44  TGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC  117
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGCCCCAGGACCCGCATGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC  148

Query  118  AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGG  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGG  222

Query  192  AAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA  265
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA  296

Query  266  CAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG  339
            ||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG  370

Query  340  GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG  444

Query  414  GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC  518

Query  488  TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAAC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACC  592

Query  562  CCCAGCCACAG------------GTGGAGGTTCACATGCT-ATTACT-ATTATATGAACACCCCCCAG------  615
            |||||||||||            |.||||.||    .||| .|.||| |  ||.||.|.|...|||||      
Sbjct  593  CCCAGCCACAGCTGACAGGTTGTGGGGAGTTT----GGCTGGTGACTGA--ATCTGGAAAGGACCCAGAGTGAT  660

Query  616  GTGT--------GGTCCCACCCCA-----GTGACCCCCTGGAGATTCT-----------------GCCCT----  655
            ||||        ||.|..|...||     |.||||||.|||.||..||                 |||||    
Sbjct  661  GTGTTGAAGGACGGGCTGAAGGCATGAGGGAGACCCCATGGGGAGGCTCTGACATGGGAGGAGGAGCCCTTGAC  734

Query  656  CA-----------------------------------GGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGG  694
            ||                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  CACGTTCACCTGGAAGGGGAGGACTCAGGAAGGCATCGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGG  808

Query  695  GCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTG  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  GCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTG  882

Query  769  TATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTT  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTT  956

Query  843  CACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGT  916
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGT  1030

Query  917  GGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAG  990
            |||||||||||||.|||||||||.||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAG  1104

Query  991  CCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCT  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|.||||||||||||||
Sbjct 1105  CCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCT  1178

Query 1065  TCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTG  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  TCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTG  1252

Query 1139  AATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCC  1212
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1253  AATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCC  1326

Query 1213  CACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACC  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  CACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACC  1400

Query 1287  CACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCC  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  CACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCC  1474

Query 1361  TGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGA  1434
            |||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  TGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGA  1548

Query 1435  AAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAG  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549  AAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAG  1622

Query 1509  CCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGC  1582
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623  CCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCTGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGC  1696

Query 1583  TGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGG  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697  TGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGG  1770

Query 1657  AGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGA  1730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771  AGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGA  1844

Query 1731  CAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGA  1804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845  CAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGA  1918

Query 1805  CCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCC  1878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919  CCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCC  1992

Query 1879  ACTCTGGCCATCCAC-----------------------------------------------------------  1893
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct 1993  ACTCTGGCCATCCACTAGCCCGGGGGGTACGCAGACCCCACACTCAGCAGAAGGAGACTCAGGACTGCTGAAGG  2066

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2067  CACGGGAGCTGCCCCCAGTGGACACCAGTGAACCCCAGTCAGCCTGGACCCCTAACACAGACCATGAGGAGACG  2140

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2141  CTGGGAACTTGTGGGACTCACCTGACTCAAAGATGACTAATATCGTCCCATTTTGGAAATAAAGCAACAGACTT  2214

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2215  CTCAACAATCAATGAGTTAATAACAAAAAAACAAAAAACAAAAACAGACGTAAAGGCCGGGTGTGGTACTCAGG  2288

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2289  AGGCTGAGTGGGGAGGATTCCTTGAACACAAGAAGTTAAGGCTGCTGAGGCTGCAGTGAGCTATGACTGTGCCA  2362

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2363  CTGCACTCCAGCCTGTGTGACAGAGCGAGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAACAGTGAATGTTTTAAACTGAATG  2436

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2437  ATAATGTAAATATTATACATCGAACTTATGACATGGGAAAATTAAGAAGCATAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCT  2510

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2511  CACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGATGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGG  2584

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2585  CTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGAGTGCCTATAGTC  2658

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2659  CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAGCCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGC  2732

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2733  ACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTCCGTCTCGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAATA  2806

Query 1894  -------------------  1893
                               
Sbjct 2807  AAAAAGAAGCATAACCAGG  2825