Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476797
• Subject: XM_011526360.2
• Aligned Length: 2049
• Identities: 1628
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74
            |||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74

Query   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT  147
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT  147

Query  148  CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC  219
            ||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.||||  || |.|||.|.|||
Sbjct  148  CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC  219

Query  220  CCACTGGAACCCAAGAA--CAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCGGGGAG  284
            ||||||||.||  .|.|  ||||||||..|||..|||.||||||       |||||||       |||.|||.|
Sbjct  220  CCACTGGAGCC--TGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGGGCG  284

Query  285  ATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGAT  358
            ||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct  285  ATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGAT  358

Query  359  TCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGAT  430
            ||||  ||  .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||..|
Sbjct  359  TCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGT  430

Query  431  GTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTG  501
            |||...|||.|.|.|||  |.||||  .||||||| ||.|| ||||   ||||||..||||||||.||||||||
Sbjct  431  GTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTG  498

Query  502  GACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTG  575
            .||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||
Sbjct  499  TACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTG  572

Query  576  GAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTC  649
            ||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|||.|||||||||||..||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  573  GAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTC  646

Query  650  TGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAG--AGCC  721
            ||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||  |.|.||  ||||
Sbjct  647  TGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCC--GCGGAGGCAGCC  718

Query  722  TGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTC  795
            |||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||.||
Sbjct  719  TGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTC  792

Query  796  CAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA  869
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  CAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA  866

Query  870  CGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAAC  942
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  867  CGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGAC  939

Query  943  ATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGG  1013
            ||||||||.|||||||.||||..|||||   |||   ||||.||.|..|||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  940  ATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGG  1010

Query 1014  AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCC  1087
            |||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.||||||||||
Sbjct 1011  AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCC  1084

Query 1088  ATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGAC  1160
            |||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1085  ATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGAC  1157

Query 1161  CTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTG  1234
            |||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|||.|||.
Sbjct 1158  CTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTT  1231

Query 1235  AGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTCCACAC  1306
            |.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| ||||||
Sbjct 1232  ACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-CCACAC  1303

Query 1307  C------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTT  1332
            |                                                ||||||||||||..||||||.||||
Sbjct 1304  CTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTT  1377

Query 1333  TTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCA  1406
            .|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1378  GTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCA  1451

Query 1407  CAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCA  1480
            .|||||||||||||||||.|.||            |||||.|.|||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1452  GAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCA  1513

Query 1481  AGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAG  1554
            |||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.||||||||||||||
Sbjct 1514  AGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAG  1587

Query 1555  GACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGA----CAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGA  1624
            |||||||||.|..|||||.||||||||.||||    |.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588  GACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCCG-CAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGA  1660

Query 1625  CGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTC  1698
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1661  CGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTC  1734

Query 1699  CTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTG-------------------------  1747
            ||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||                         
Sbjct 1735  CTGGACACAAAGGACAGACAGGCAGAAGAGGACAGACAGATGGACACTGAGAGAGTCCTTTCCTCTCCAGGCCC  1808

Query 1748  -----------------------------------------------------AGGCTGCTGCATCTGAAGCCT  1768
                                                                 ||||||||||||||||||||.
Sbjct 1809  CCAGGCCTCCCCCACCCCCACCACGTTCCTTCCCTCTCACTCTCCCCCGCTGCAGGCTGCTGCATCTGAAGCCC  1882

Query 1769  CCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAG  1842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883  CCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAG  1956

Query 1843  GAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1893
            |||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1957  GAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC  2007