Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476797
• Subject: XM_017026222.1
• Aligned Length: 1896
• Identities: 1833
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                    |||||
Sbjct    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTT------------------------------------GGGCC  38

Query   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC  112

Query  149  AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCA  222
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  113  AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCA  186

Query  223  CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  187  CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCA  260

Query  297  CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC  334

Query  371  CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG  408

Query  445  GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA  482

Query  519  CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT  556

Query  593  ACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT  666
            |||||||||..|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  ACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT  630

Query  667  AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC  704

Query  741  TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC  778

Query  815  CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  779  CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGC  852

Query  889  TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGAT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||..||||||||||
Sbjct  853  TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGAT  926

Query  963  CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  927  CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTC  1000

Query 1037  AGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA  1110
            |||||.||.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001  AGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA  1074

Query 1111  ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075  ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG  1148

Query 1185  GTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG  1258
            |||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149  GTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG  1222

Query 1259  GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223  GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTT  1296

Query 1333  TTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCA  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 1297  TTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCA  1370

Query 1407  CAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371  CAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCA  1444

Query 1481  AGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAG  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1445  AGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCTGTGAAG  1518

Query 1555  GACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGT---CAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGAC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519  GACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGAC  1592

Query 1626  GTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCC  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593  GTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCC  1666

Query 1700  TGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAG  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667  TGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAG  1740

Query 1774  GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGG  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741  GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGG  1814

Query 1848  GGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815  GGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1860