Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476850
• Subject: NM_001348800.2
• Aligned Length: 2223
• Identities: 2003
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTAGAACGGAAGAAACCCAAGACAGCTGAAAACCAGAAGGCATCTGAGGAGAATGAGATTACTCAGCCGGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGGATCCAGCGCCAAGCCGGGCCTTCCCTGCCTGAACTTTGAAGCTGTTTTGTCTCCAGACCCAGCCCTCATCC  148

Query    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3
                                                                                   |||
Sbjct  149  ACTCAACACATTCACTGACAAACTCTCACGCTCACACCGGGTCATCTGATTGTGACATCAGTTGCAAGGGGATG  222

Query    4  ACCGAGCGCATTCACAGCATCAACCTTCACAACTTCAGCAATTCCGTGCTCGAGACCCTCAACGAGCAGCGCAA  77
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCGAGCGCATTCACAGCATCAACCTTCACAACTTCAGCAATTCCGTGCTCGAGACCCTCAACGAGCAGCGCAA  296

Query   78  CCGTGGCCACTTCTGTGACGTAACGGTGCGCATCCACGGGAGCATGCTGCGCGCACACCGCTGCGTGCTGGCAG  151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGTGGCCACTTCTGTGACGTAACGGTGCGCATCCACGGGAGCATGCTGCGCGCACACCGCTGCGTGCTGGCAG  370

Query  152  CCGGCAGCCCCTTCTTCCAGGACAAACTGCTGCTTGGCTACAGCGACATCGAGATCCCGTCGGTGGTGTCAGTG  225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGGCAGCCCCTTCTTCCAGGACAAACTGCTGCTTGGCTACAGCGACATCGAGATCCCGTCGGTGGTGTCAGTG  444

Query  226  CAGTCAGTGCAAAAGCTCATTGACTTCATGTACAGCGGCGTGCTACGGGTCTCGCAGTCGGAAGCTCTGCAGAT  299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTCAGTGCAAAAGCTCATTGACTTCATGTACAGCGGCGTGCTACGGGTCTCGCAGTCGGAAGCTCTGCAGAT  518

Query  300  CCTCACGGCCGCCAGCATCCTGCAGATCAAAACAGTCATCGACGAGTGCACGCGCATCGTGTCACAGAACGTGG  373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTCACGGCCGCCAGCATCCTGCAGATCAAAACAGTCATCGACGAGTGCACGCGCATCGTGTCACAGAACGTGG  592

Query  374  GCGATGTGTTCCCGGGGATCCAGGACTCGGGCCAGGACACGCCGCGGGGCACTCCCGAGTCAGGCACGTCAGGC  447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGATGTGTTCCCGGGGATCCAGGACTCGGGCCAGGACACGCCGCGGGGCACTCCCGAGTCAGGCACGTCAGGC  666

Query  448  CAGAGCAGCGACACGGAGTCGGGCTACCTGCAGAGCCACCCACAGCACAGCGTGGACAGGATCTACTCGGCACT  521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAGCAGCGACACGGAGTCGGGCTACCTGCAGAGCCACCCACAGCACAGCGTGGACAGGATCTACTCGGCACT  740

Query  522  CTACGCGTGCTCCATGCAGAATGGCAGCGGCGAGCGCTCTTTTTACAGCGGCGCAGTGGTCAGCCACCACGAGA  595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTACGCGTGCTCCATGCAGAATGGCAGCGGCGAGCGCTCTTTTTACAGCGGCGCAGTGGTCAGCCACCACGAGA  814

Query  596  CTGCGCTCGGCCTGCCCCGCGACCACCACATGGAAGACCCCAGCTGGATCACACGCATCCATGAGCGCTCGCAG  669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCGCTCGGCCTGCCCCGCGACCACCACATGGAAGACCCCAGCTGGATCACACGCATCCATGAGCGCTCGCAG  888

Query  670  CAGATGGAGCGCTACCTGTCCACCACCCCCGAGACCACGCACTGCCGCAAGCAGCCCCGGCCTGTGCGCATCCA  743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGATGGAGCGCTACCTGTCCACCACCCCCGAGACCACGCACTGCCGCAAGCAGCCCCGGCCTGTGCGCATCCA  962

Query  744  GACCCTAGTGGGCAACATCCACATCAAGCAGGAGATGGAGGACGATTACGACTACTACGGGCAGCAAAGGGTGC  817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACCCTAGTGGGCAACATCCACATCAAGCAGGAGATGGAGGACGATTACGACTACTACGGGCAGCAAAGGGTGC  1036

Query  818  AGATCCTGGAACGCAACGAATCCGAGGAGTGCACGGAAGACACAGACCAGGCCGAGGGCACCGAGAGTGAGCCC  891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATCCTGGAACGCAACGAATCCGAGGAGTGCACGGAAGACACAGACCAGGCCGAGGGCACCGAGAGTGAGCCC  1110

Query  892  AAAGGTGAAAGCTTCGACTCGGGCGTCAGCTCCTCCATAGGCACCGAGCCTGACTCGGTGGAGCAGCAGTTTGG  965
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGGTGAAAGCTTCGACTCGGGCGTCAGCTCCTCCATAGGCACCGAGCCTGACTCGGTGGAGCAGCAGTTTGG  1184

Query  966  GCCTGGGGCGGCGCGGGACAGCCAGGCTGAACCCACCCAACCCGAGCAGGCTGCAGAAGCCCCCGCTGAGGGTG  1039
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCTGGGGCGGCGCGGGACAGCCAGGCTGAACCCACCCAACCCGAGCAGGCTGCAGAAGCCCCCGCTGAGGGTG  1258

Query 1040  GTCCGCAGACAAACCAGCTAGAAACAGGTGCTTCCTCTCCGGAGAGAAGCAATGAAGTGGAGATGGACAGCACT  1113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTCCGCAGACAAACCAGCTAGAAACAGGTGCTTCCTCTCCGGAGAGAAGCAATGAAGTGGAGATGGACAGCACT  1332

Query 1114  GTTATCACTGTCAGCAACAGCTCCGACAAGAGCGTCCTACAACAGCCTTCGGTCAACACGTCCATCGGGCAGCC  1187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTATCACTGTCAGCAACAGCTCCGACAAGAGCGTCCTACAACAGCCTTCGGTCAACACGTCCATCGGGCAGCC  1406

Query 1188  ATTGCCAAGTACCCAGCTCTACTTACGCCAGACAGAAACCCTCACCAGCAACCTGAGGATGCCTCTGACCTTGA  1261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATTGCCAAGTACCCAGCTCTACTTACGCCAGACAGAAACCCTCACCAGCAACCTGAGGATGCCTCTGACCTTGA  1480

Query 1262  CCAGCAACACGCAGGTCATTGGCACAGCTGGCAACACCTACCTGCCAGCCCTCTTCACTACCCAGCCCGCGGGC  1335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAGCAACACGCAGGTCATTGGCACAGCTGGCAACACCTACCTGCCAGCCCTCTTCACTACCCAGCCCGCGGGC  1554

Query 1336  AGTGGCCCCAAGCCTTTCCTCTTCAGCCTGCCACAGCCCCTGGCAGGCCAGCAGACCCAGTTTGTGACAGTGTT  1409
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1555  AGTGGCCCCAAGCCTTTCCTCTTCAGCCTGCCACAGCCCCTGGCAGGCCAGCAGACCCAGTTTGTGACAGTGTC  1628

Query 1410  CCAGCCCGGTCTGTCGACCTTTACTGCACAGCTGCCAGCGCCACAGCCCCTGGCCTCATCCGCAGGCCACAGCA  1483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAGCCCGGTCTGTCGACCTTTACTGCACAGCTGCCAGCGCCACAGCCCCTGGCCTCATCCGCAGGCCACAGCA  1702

Query 1484  CAGCCAGTGGGCAAGGCGAAAAAAAGCCTTATGAGTGCACTCTCTGCAACAAGACTTTCACCGCCAAACAGAAC  1557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGCCAGTGGGCAAGGCGAAAAAAAGCCTTATGAGTGCACTCTCTGCAACAAGACTTTCACCGCCAAACAGAAC  1776

Query 1558  TACGTCAAGCACATGTTCGTACACACAGGTGAGAAGCCCCACCAATGCAGCATCTGTTGGCGCTCCTTCTCCTT  1631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TACGTCAAGCACATGTTCGTACACACAGGTGAGAAGCCCCACCAATGCAGCATCTGTTGGCGCTCCTTCTCCTT  1850

Query 1632  AAAGGATTACCTTATCAAGCACATGGTGACACACACAGGAGTGAGGGCATACCAGTGTAGTATCTGCAACAAGC  1705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAAGGATTACCTTATCAAGCACATGGTGACACACACAGGAGTGAGGGCATACCAGTGTAGTATCTGCAACAAGC  1924

Query 1706  GCTTCACCCAGAAGAGCTCCCTCAACGTGCACATGCGCCTCCACCGGGGAGAGAAGTCCTACGAGTGCTACATC  1779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCTTCACCCAGAAGAGCTCCCTCAACGTGCACATGCGCCTCCACCGGGGAGAGAAGTCCTACGAGTGCTACATC  1998

Query 1780  TGCAAAAAGAAGTTCTCTCACAAGACCCTCCTGGAGCGACACGTGGCCCTGCACAGTGCCAGCAATGGGACCCC  1853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGCAAAAAGAAGTTCTCTCACAAGACCCTCCTGGAGCGACACGTGGCCCTGCACAGTGCCAGCAATGGGACCCC  2072

Query 1854  CCCTGCAGGCACACCCCCAGGTGCCCGCGCTGGCCCCCCAGGCGTGGTGGCCTGCACGGAGGGGACCACTTACG  1927
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCCTGCAGGCACACCCCCAGGTGCCCGCGCTGGCCCCCCAGGCGTGGTGGCCTGCACGGAGGGGACCACTTACG  2146

Query 1928  TCTGCTCCGTCTGCCCAGCAAAGTTTGACCAAATCGAGCAGTTCAACGACCACATGAGGATGCATGTGTCTGAC  2001
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCTGCTCCGTCTGCCCAGCAAAGTTTGACCAAATCGAGCAGTTCAACGACCACATGAGGATGCATGTGTCTGAC  2220

Query 2002  GGA  2004
            |||
Sbjct 2221  GGA  2223