Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476850
- Subject:
- XM_017317096.1
- Aligned Length:
- 2224
- Identities:
- 1850
- Gaps:
- 221
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTAGAACGGAAGAAACCCAAGACAGCTGAAAACCAGAAGGCATCTGAGGAGAATGAGATTACTCAGCCGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGGATCCAGCGCCAAGCCGGCCCTTCCCTGCCTGAACTTTGAAGCTGTTTTGTCTCCAGCCCCAGCCCTCATCC 148
Query 1 -----------------------------------------------------------------------ATG 3
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Sbjct 149 ACTCGACACATTCACTGACAAACTCTCACGCTCACACCGGGTCATCTGATTGTGACATCAGTTGCAAGGGGATG 222
Query 4 ACCGAGCGCATTCACAGCATCAACCTTCACAACTTCAGCAATTCCGTGCTCGAGACCCTCAACGAGCAGCGCAA 77
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Sbjct 223 ACCGAGCGCATTCACAGCATCAACCTTCACAACTTCAGCAATTCCGTGCTCGAGACCCTCAACGAGCAGCGCAA 296
Query 78 CCGTGGCCACTTCTGTGACGTAACGGTGCGCATCCACGGGAGCATGCTGCGCGCACACCGCTGCGTGCTGGCAG 151
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Sbjct 297 CCGTGGCCACTTCTGTGACGTGACGGTTCGCATCCACGGGAGCATGCTGCGCGCACATCGCTGCGTGCTGGCAG 370
Query 152 CCGGCAGCCCCTTCTTCCAGGACAAACTGCTGCTTGGCTACAGCGACATCGAGATCCCGTCGGTGGTGTCAGTG 225
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Sbjct 371 CCGGCAGCCCCTTCTTCCAAGACAAGCTGCTGCTGGGCTACAGCGACATCGAAATCCCGTCGGTGGTGTCCGTA 444
Query 226 CAGTCAGTGCAAAAGCTCATTGACTTCATGTACAGCGGCGTGCTACGGGTCTCGCAGTCGGAAGCTCTGCAGAT 299
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Sbjct 445 CAATCGGTGCAAAAGCTCATTGACTTCATGTACAGCGGTGTGCTGAGAGTCTCACAGTCGGAAGCTCTGCAGAT 518
Query 300 CCTCACGGCCGCCAGCATCCTGCAGATCAAAACAGTCATCGACGAGTGCACGCGCATCGTGTCACAGAACGTGG 373
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Sbjct 519 CCTCACAGCCGCCAGCATCCTGCAGATCAAAACAGTCATAGATGAGTGCACTCGCATCGTGTCACAGAACGTGG 592
Query 374 GCGATGTGTTCCCGGGGATCCAGGACTCGGGCCAGGACACGCCGCGGGGCACTCCCGAGTCAGGCACGTCAGGC 447
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Sbjct 593 GCGATGTGTTCCCAGGCATCCAGGATTCTGGCCAGGACACACCAAGAGGCACACCAGAGTCAGGCACATCTGGC 666
Query 448 CAGAGCAGCGACACGGAGTCGGGCTACCTGCAGAGCCACCCACAGCACAGCGTGGACAGGATCTACTCGGCACT 521
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Sbjct 667 CAGAGCAGTGACACGGAATCAGGCTACCTGCAGAGCCACCCACAGCATAGTGTGGACCGAATCTACTCCGCACT 740
Query 522 CTACGCGTGCTCCATGCAGAATGGCAGCGGCGAGCGCTCTTTTTACAGCGGCGCAGTGGTCAGCCACCACGAGA 595
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Sbjct 741 CTACGCCTGCTCCATGCAGAATGGCAGCGGCGAGCGCTCCTTCTACAGTGGTGCAGTGGTCAGCCACCACGAAA 814
Query 596 CTGCGCTCGGCCTGCCCCGCGACCACCACATGGAAGACCCCAGCTGGATCACACGCATCCATGAGCGCTCGCAG 669
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Sbjct 815 CAGCTCTCGGCCTGCCCCGTGACCACCACATGGAAGACCCTAGCTGGATCACACGCATTCATGAGCGCTCCCAG 888
Query 670 CAGATGGAGCGCTACCTGTCCACCACCCCCGAGACCACGCACTGCCGCAAGCAGCCCCGGCCTGTGCGCATCCA 743
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Sbjct 889 CAAATGGAGCGCTACCTGTCCACCACCCCTGAGACCACGCACTGCCGGAAGCAGCCCCGGCCTGTGCGTATCCA 962
Query 744 GACCCTAGTGGGCAACATCCACATCAAGCAGGAGATGGAGGACGATTACGACTACTACGGGCAGCAAAGGGTGC 817
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Sbjct 963 GACCCTGGTGGGTAACATCCACATCAAGCAGGAAATGGAAGATGACTATGACTACTATGGGCAGCAAAGGGTGC 1036
Query 818 AGATCCTGGAACGCAACGAATCCGAGGAGTGCACGGAAGACACAGACCAGGCCGAGGGCACCGAGAGTGAGCCC 891
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Sbjct 1037 AGATCCTAGAACGCAATGAATCCGAGGAGTGCACAGAAGACACTGACCAAGCAGAGGGCACTGAGAGCGAGCCC 1110
Query 892 AAAGGTGAAAGCTTCGACTCGGGCGTCAGCTCCTCCATAGGCACCGAGCCTGACTCGGTGGAGCAGCAGTTTGG 965
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Sbjct 1111 AAAGGTGAAAGCTTTGATTCTGGGGTCAGCTCCTCCATCGGCACCGAACCTGACTCAGTGGAGCAACAGTTTGG 1184
Query 966 GCCTGGGGCGGCGCGGGACAGCCAGGCTGAACCCACCCAACCCGAGCAGGCTGCAGAAGCCCCCGCTGAGGGTG 1039
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Sbjct 1185 GGCAGCAGCCCCAAGGGACGGTCAGGCAGAACCCGCCCAACCTGAGCAGGCAGCAGAAGCCCCAGCTGAGAGCA 1258
Query 1040 GTCCGCAGACAAACCAGCTAGAAACAGGTGCTTCCTCTCCGGAGAGAAGCAATGAAGT-GGAGATGGACAGCAC 1112
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Sbjct 1259 GTGCCCAGCCAAACCAGCTAGAACCAGGTGCCTCCTCTCCTGAGAGAAGCAACG-AGTCAGAGATGGACAACAC 1331
Query 1113 TGTTATCACTGTCAGCAACAGCTCCGACAAGAGCGTCCTACAACAGCCTTCGGTCAACACGTCCATCGGGCAGC 1186
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Sbjct 1332 AGTCATCACTGTCAGTAACAGCTCCGATAAGGGCGTCCTACAGCAGCCTTCAGTCAACACATCCATCGGGCAGC 1405
Query 1187 CATTGCCAAGTACCCAGCTCTACTTACGCCAGACAGAAACCCTCACCAGCAACCTGAGGATGCCTCTGACCTTG 1260
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Sbjct 1406 CATTGCCAAGTACCCAGCTCTATTTACGCCAGACAGAAACCCTCACCAGCAACCTGAGGATGCCTCTGACCTTG 1479
Query 1261 ACCAGCAACACGCAGGTCATTGGCACAGCTGGCAACACCTACCTGCCAGCCCTCTTCACTACCCAGCCCGCGGG 1334
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Sbjct 1480 ACCAGCAACACACAGGTCATTGGCACCGCTGGCAACACCTATCTGCCAGCCCTCTTCACTACCCAACCCGCGGG 1553
Query 1335 CAGTGGCCCCAAGCCTTTCCTCTTCAGCCTGCCACAGCCCCTGGCAGGCCAGCAGACCCAGTTTGTGACAGTGT 1408
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Sbjct 1554 CAGTGGCCCCAAGCCTTTTCTCTTCAGCCTGCCGCAGCCCCTGACAGGCCAGCAGACCCAGTTTGTGACAGTGT 1627
Query 1409 TCCAGCCCGGTCTGTCGACCTTTACTGCACAGCTGCCAGCGCCACAGCCCCTGGCCTCATCCGCAGGCCACAGC 1482
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Sbjct 1628 CCCAGCCCGGTCTGTCCACCTTTACTGCACAGCTGCCAGCGCCACAGCCCCTGGCCTCATCTGCAGGCCACAGC 1701
Query 1483 ACAGCCAGTGGGCAAGGCGAAAAAAAGCCTTATGAGTGCACTCTCTGCAACAAGACTTTCACCGCCAAACAGAA 1556
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Sbjct 1702 ACAGCCAGTGGGCAAGGCGACAAAAAGCCTTATGAGTGCACTCTCTGCAACAAGACTTTCACAGCCAAACAGAA 1775
Query 1557 CTACGTCAAGCACATGTTCGTACACACAGGTGAGAAGCCCCACCAATGCAGCATCTGTTGGCGCTCCTTCTCCT 1630
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Sbjct 1776 CTACGTCAAGCACATGTTCGTACATACAGGTGAGAAGCCCCACCAGTGCAGCATCTGCTGGCGCTCCTTCTCCT 1849
Query 1631 TAAAGGATTACCTTATCAAGCACATGGTGACACACACAGGAGTGAGGGCATACCAGTGTAGTATCTGCAACAAG 1704
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Sbjct 1850 TGAAGGATTACCTTATCAAGCACATGGTGACGCACACCGGCGTGAGAGCGTACCAGTGTAGCATCTGCAACAAG 1923
Query 1705 CGCTTCACCCAGAAGAGCTCCCTCAACGTGCACATGCGCCTCCACCGGGGAGAGAAGTCCTACGAGTGCTACAT 1778
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Sbjct 1924 CGCTTCACCCAGAAGAGTTCCCTCAACGTGCACATGCGCCTGCACCGCGGGGAGAAGTCCTATGAGTGCTACAT 1997
Query 1779 CTGCAAAAAGAAGTTCTCTCACAAGACCCTCCTGGAGCGACACGTGGCCCTGCACAGTGCCAGCAATGGGACCC 1852
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Sbjct 1998 CTGCAAAAAGAAGTTCTCCCACAAGACCCTGCTGGAGCGACACGTGGCCCTGCACAGTGCCAGCAACGGGACCC 2071
Query 1853 CCCCTGCAGGCACACCCCCAGGTGCCCGCGCTGGCCCCCCAGGCGTGGTGGCCTGCACGGAGGGGACCACTTAC 1926
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Sbjct 2072 CTCCGGCAGGCACGCCCCCAGGTGCCCGCGCGGGTCCGCCAGGCGTGGTGGCCTGCACAGAGGGGACCACTTAC 2145
Query 1927 GTCTGCTCCGTCTGCCCAGCAAAGTTTGACCAAATCGAGCAGTTCAACGACCACATGAGGATGCATGTGTCTGA 2000
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Sbjct 2146 GTCTGCTCCGTCTGCCCAGCAAAGTTTGACCAAATCGAGCAGTTCAACGACCACATGAGGATGCATGTGTCTGA 2219
Query 2001 CGGA 2004
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Sbjct 2220 CGGA 2223