Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476867
• Subject: XM_006532139.3
• Aligned Length: 1757
• Identities: 1353
• Gaps: 209

Alignment

Query    1  ATGCCAGTGCTATCGGAGGACTCTGGTTTGCATGAAACCCTGGCCCTGCTGACCTCCCAGCTCAGACCTGACTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAACCACAAGGAGGAGATGGGCTTCCTGAGGGATGTTTTCAGTGAAAAAAGCCTCAGTTACTTAATGAAGATTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAGAAGCTTCGCTATTATGAAAGGCAAAGTCCAACCCCAGTTCTGCACAGCGCTGTGGCCCTCGCTGAGGAC  222
                                                                    .|||||||.||||||||.
Sbjct    1  --------------------------------------------------------ATGGCCCTTGCTGAGGAT  18

Query  223  GTGATGGAGGAGTTGCAGGCCGCCTCCGTGCACAGTGATGAGAGGGAGCTGCTCCAGCTGCTGTCCACCCCGCA  296
            ||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct   19  GTGATGGAGGAGCTGCAGGCTGCCTCTGTGCACAGTGATGAGCGGGAGCTGCTGCAGCTGCTGTCCACCCCCCA  92

Query  297  CCTGAGGGCTGTGCTCATGGTACATGACACGGTTGCCCAGAAGAATTTTGACCCCGTTCTCCCGCCTCTGCCTG  370
            |||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct   93  CCTCAGGGCTGTGCTCATGGTCCACGACACGGTTGCCCAGAAGAACTTCGATCCTGTTCTGCCCCCTCTGCCCG  166

Query  371  ACAATATCGATGAGGATTTTGATGAGGAATCGGTGAAGATCGTCCGCTTGGTGAAGAACAAGGAACCCCTGGGT  444
            |.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  167  ATAACATCGATGAGGATTTTGAAGAGGAGTCGGTGAAGATTGTTCGCTTGGTGAAGAATAAGGAGCCCCTGGGT  240

Query  445  GCCACCATCCGGCGGGACGAGCACTCAGGGGCTGTTGTGGTGGCCAGGATCATGCGAGGAGGCGCAGCAGACAG  518
            |||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|
Sbjct  241  GCCACCATCCGACGGGATGAGCATTCGGGGGCTGTTGTGGTGGCCAGGATCATGCGAGGGGGTGCGGCAGACCG  314

Query  519  GAGCGGCCTGGTCCACGTTGGAGATGAGCTCCGAGAAGTGAACGGGATCGCAGTCCTGCACAAGCGGCCCGACG  592
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  315  GAGCGGTCTGGTCCACGTTGGCGATGAGCTCCGAGAGGTGAATGGGATCGCCGTCCTGCACAAGCGTCCAGACG  388

Query  593  AGATCAGCCAGATTCTGGCCCAGTCCCAGGGATCCATCACCCTAAAAATCATCCCAGCCACCCAGGAGGAAGAT  666
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  389  AGATCAGCCAAATTCTGGCCCAATCCCAGGGATCCATTACCCTGAAGATCATCCCTGCCACCCAGGAGGAAGAC  462

Query  667  CGCTTAAAGGAGAGCAAGGTGTTCATGCGCGCCCTCTTCCACTACAACCCTCGGGAGGACCGGGCCATCCCTTG  740
            |||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  463  CGCTTCAAAGACAGCAAGGTATTCATGCGTGCCCTCTTCCACTATGACCCTCGGGAGGACCGTGCCATCCCCTG  536

Query  741  CCAGGAGGCGGGCCTGCCCTTCCAGCGCAGGCAGGTCCTGGAGGTGGTGAGCCAGGACGACCCCACGTGGTGGC  814
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  537  CCAGGAGGCTGGCCTGCCCTTCCAGCGGAGGCAGGTCCTGGAGGTGGTGAGCCAAGATGACCCCACCTGGTGGC  610

Query  815  AGGCCAAGCGAGTCGGGGACACCAACCTTCGAGCCGGCCTCATCCCCTCCAAGGGGTTCCAGGAGAGACGACTA  888
            ||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||..||||||||||||.||.||.
Sbjct  611  AGGCCAAGAGAGTAGGCGACACCAACCTTCGAGCTGGCCTCATCCCATCTAAGCAGTTCCAGGAGAGGCGGCTG  684

Query  889  AGCTACCGGAGAGCCGCGGGCACCCTGCCGAGCCCCCAGAGCCTCAGGAAGCCCCCCTATGATCAGCCTTGTGA  962
            ||||||||||||.||.|.||||||.|.||.||||||||||.|.|||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  685  AGCTACCGGAGAACCACTGGCACCTTACCAAGCCCCCAGAACTTCAAAAAGCCCCCCTATGATCAGCCTTGTGA  758

Query  963  CAAAGAGACCTGTGACTGTGAGGGCTACCTCAAAGGGCACTATGTGGCTGGTCTTCGGAGGAGCTTCCGGCTGG  1036
            |||||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  759  CAAAGAGACCTGTGACTGTGATGGGTACTTTAAAGGACATTATGTGGCTGGTCTTCGGAGAAGCTTCCGGCTGG  832

Query 1037  GCTGTAGGGAGAGACTGGGTGGCTCGCAGGAAGGAAAGATGTCC--TCCGGAGCTGAGTCTCCGGAGCTGCTGA  1108
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||.||||  ||||  .|.|||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  833  GCTGCAGGGAGAGGCTGGGTGGCTCGCAGGAAGCAAAG--GTCCCTACAGGAGCTGAGTCTCAGGTGCTGCTGA  904

Query 1109  CTTACGAAGAGGTGGCCAGGTACCAACACCAGCCCGGAGAGCGGCCCCGCCTGGTGGTTCTGATCGGGTCTCTG  1182
            |.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  905  CGTACGAGGAAGTGGCCAGGTACCAACACCAGCCTGGGGAGCGGCCCCGCCTGGTGGTTCTCATTGGGTCCCTG  978

Query 1183  GGAGCCCGACTGCACGAGCTGAAGCAAAAGGTGGTGGCTGAGAACCCACAGCACTTTGGCGTCGCTGTTCCACA  1256
            |||||||..||.||.|||||||||||||.|||||||||||||.||||.|||||.||||.|||.||.||||||||
Sbjct  979  GGAGCCCACCTCCATGAGCTGAAGCAAAGGGTGGTGGCTGAGGACCCCCAGCAGTTTGCCGTTGCAGTTCCACA  1052

Query 1257  TACCACCAGGCCCCGAAAGAGCCATGAGAAGGAAGGAGTGGAATATCACTTTGTGTCTAAGCAAGCATTTGAGG  1330
            .||||||||||||||.||||||||.||||..||.||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1053  CACCACCAGGCCCCGGAAGAGCCACGAGAGAGACGGGGTGGAGTACCATTTTGTCTCCAAGCAAGCGTTTGAGG  1126

Query 1331  CCGACTTACATCACAACAAGTTCCTGGAACATGGTGAATATAAGGAAAATCTGTATGGAACCAGCCTGGAGGCC  1404
            |||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1127  CCGACGTACATCACAACAAGTTCCTGGAGCATGGAGAATATAAAGAGAATCTCTACGGCACCAGCCTAGAGGCC  1200

Query 1405  ATTCAGGCTGTTATGGCCAAAAACAAAGTTTGTTTGGTGGATGTGGAGCCAGAAGCACTGAAACAACTGAGGAC  1478
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|.|||.||||||||
Sbjct 1201  ATTCAGGCTGTTATGGCCAAAAACAAAGTGTGTTTGGTGGATGTAGAACCAGAAGCACTAAGACACCTGAGGAC  1274

Query 1479  CTCAGAATTTAAACCCTATATTATATTTGTAAAGCCTGCAATTCAGGAAAAAAGAAAAACGCCACCTATGTCCC  1552
            |.|.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||.||.|||||.||..||||||
Sbjct 1275  CCCTGAGTTTAAGCCCTATGTTATATTTGTGAAGCCTGCAATTCAGGAGAGAAGGAAGACGCCGCCGGTGTCCC  1348

Query 1553  CAGCTTGTGAGGACACAGCAGCCCCATTTGATGAGCAGCAGCAAGAGATGGCCGCTTCTGCCGCCTTCATAGAC  1626
            |||..|.||||||||.||||.|..||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1349  CAGACTCTGAGGACATAGCATCTTCACTTGATGAACAGCAGCAAGAGATGGCCGCCTCTGCTGCCTTCATAGAT  1422

Query 1627  CGGCATTACGGGCACCTGGTAGACGCCGTGCTGGTGAAGGAGGATCTCCAGGGTGCCTACAGCCAGCTCAAAGT  1700
            |.|||.||.|||||||||.|||||.|.|||||.||||.|.||||.||.||||..||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1423  CAGCACTATGGGCACCTGATAGACACTGTGCTCGTGAGGCAGGACCTGCAGGAGGCCTGCAGCCAGCTCAGAGC  1496

Query 1701  GGTCTTAGAGAAGCTGAGCAAGGACACTCACTGGGTACCTGTTAG-TGGGTCAGG  1754
            .|||.||||||.||||||||||||||||..|||||||||..|.|| |||||.|||
Sbjct 1497  TGTCATAGAGACGCTGAGCAAGGACACTTCCTGGGTACCCATCAGCTGGGTGAGG  1551