Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476912
• Subject: NM_001081639.3
• Aligned Length: 1998
• Identities: 1288
• Gaps: 576

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC  74
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222
            |||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  223  CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTT  296
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA  296

Query  297  CTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370
            |||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370

Query  371  AACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAG  444
            ||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct  371  AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG  444

Query  445  GTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCG  518
            ||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  445  GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA  518

Query  519  TACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT  592
            |.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  519  TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT  592

Query  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666

Query  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.
Sbjct  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG  740

Query  741  TTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCAC  814
            .|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct  741  CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC  814

Query  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888

Query  889  TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA  962
            ||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA  962

Query  963  GTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT  1036
            ||||..||.||||..||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT  1036

Query 1037  GTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGA  1110
            ||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||
Sbjct 1037  GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA  1110

Query 1111  TCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTA  1184
            ||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1111  TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA  1184

Query 1185  CAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCT  1258
            |||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1185  CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT  1258

Query 1259  CAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCAAGGCTGGAGCAGCTAACACCCT--  1328
            |||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.||  ||||.|.||.| .||||...||||           ||||  
Sbjct 1259  CAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGG-----------CCCTGA  1319

Query 1329  ----CAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCAC--------ACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCT-----  1385
                ||||||.||||            ||.|||        |.||||||        |||||    |||     
Sbjct 1320  GGACCAGCCCCTCAC------------CCCCACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTGG----TCTGGGAA  1369

Query 1386  --CATCCG--------CATGGGCATAGCTGGCTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC---------------  1425
              ||.|.|        .||.|||||      |||||         ||||..||.|||||               
Sbjct 1370  GGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCAT------CTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC  1437

Query 1426  --------------------------GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT---------  1440
                                      |||   |..||                    ||| ||||         
Sbjct 1438  TTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCC  1511

Query 1441  ----GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTC--------------------------------  1467
                |.||||       |||    |||||.|||||  ||||.                                
Sbjct 1512  TGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCA  1583

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1584  GGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCC  1657

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1658  CACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCT  1731

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1732  CCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACAC  1805

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1806  TGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGG  1879

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1880  CAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1953