Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476912
• Subject: NM_001278398.2
• Aligned Length: 1918
• Identities: 1320
• Gaps: 467

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC  74
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222
            |||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  223  CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTT  296
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA  296

Query  297  CTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370
            |||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370

Query  371  AACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAG  444
            ||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct  371  AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG  444

Query  445  GTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCG  518
            ||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  445  GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA  518

Query  519  TACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT  592
            |.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  519  TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT  592

Query  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666

Query  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.
Sbjct  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG  740

Query  741  TTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCAC  814
            .|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct  741  CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC  814

Query  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888

Query  889  TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA  962
            ||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA  962

Query  963  GTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT  1036
            ||||..||.||||..||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT  1036

Query 1037  GTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGA  1110
            ||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||
Sbjct 1037  GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA  1110

Query 1111  TCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTA  1184
            ||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1111  TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA  1184

Query 1185  CAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCT  1258
            |||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1185  CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT  1258

Query 1259  CAGGAGCAGCTG------AGACCCTCA-GCCCACC---------------------------------------  1286
            |||.||...|||      ||.|||||| .||||||                                       
Sbjct 1259  CAGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGG  1332

Query 1287  -----------------------------------------------------------------------ACA  1289
                                                                                   |||
Sbjct 1333  GTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACA  1406

Query 1290  -------------AAAC--------------------AAGTCCGA-TTCCAA-----------GGC--TGGAGC  1316
                         ||||                    |||.|.|| ||||||           |||  |||.||
Sbjct 1407  TCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGC  1480

Query 1317  ---AGCTAACA-------CCCT------------CAGCCCATC---------------ACAAAAC---------  1344
               |||..|||       .|||            |||||||.|               |.|||||         
Sbjct 1481  CAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCT  1554

Query 1345  ------AAG-----ACTGCCT--------------------CAC--------------------ACCCCCAGGA  1367
                  |||     ||.||||                    |||                    ||||||||| 
Sbjct 1555  GCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGG-  1627

Query 1368  TTACACAGTG----------------------------------GAGAA------TCT----CATCCGCATGGG  1397
                 |||||                                  |||||      |||    |.|||.||    
Sbjct 1628  -----CAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCA----  1692

Query 1398  CATAGCTGGCTTGG----TCCTGG------------------------------------TGGTC-CTCGGGAT  1430
                 |||.||.||    ||||||                                    |||.| ||..||.|
Sbjct 1693  -----CTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCT  1761

Query 1431  TCTGCTATTTGAGGC------------------------TCAGCACAGC--------CAGA---GA--------  1461
            .|||| ||.|||.||                        .|.|||||||        ||||   ||        
Sbjct 1762  GCTGC-ATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTG  1834

Query 1462  AGCCTC--------------------------------------------------------------  1467
            ||||||                                                              
Sbjct 1835  AGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1902