Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476912
- Subject:
- NM_001278399.2
- Aligned Length:
- 1480
- Identities:
- 1227
- Gaps:
- 125
Alignment
Query 1 ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC 74
||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC 148
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
|||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 223 CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTT 296
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA 296
Query 297 CTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
|||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
Query 371 AACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAG 444
||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct 371 AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG 444
Query 445 GTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCG 518
||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 445 GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA 518
Query 519 TACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT 592
|.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 519 TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT 592
Query 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
Query 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.
Sbjct 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG 740
Query 741 TTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCAC 814
.|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct 741 CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC 814
Query 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
Query 889 TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA 962
||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA 962
Query 963 GTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT 1036
||||..||.||||..||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT 1036
Query 1037 GTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGA 1110
||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||
Sbjct 1037 GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA 1110
Query 1111 TCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTA 1184
||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1111 TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA 1184
Query 1185 CAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCT 1258
|||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1185 CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT 1258
Query 1259 CAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCA-------AGGC----TGGAGCAGC 1319
|||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.|| ||||.|.||.| .|||| |||| .|||.||||
Sbjct 1259 CAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGC 1330
Query 1320 TAACACCCTCAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCACACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCA 1393
||||||.||| .||.|..||..|.|||||| |||||.||.
Sbjct 1331 -----CCCTCACCCC------------CACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTGGTGAG----------- 1368
Query 1394 TGGGCATAGCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCTC 1467
Sbjct 1369 -------------------------------------------------------------------------- 1368