Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476912
• Subject: XM_017026182.2
• Aligned Length: 2022
• Identities: 1290
• Gaps: 594

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC  74
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222
            |||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  223  CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTT  296
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA  296

Query  297  CTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370
            |||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370

Query  371  AACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAG  444
            ||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct  371  AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG  444

Query  445  GTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCG  518
            ||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  445  GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA  518

Query  519  TACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT  592
            |.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  519  TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT  592

Query  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666

Query  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.
Sbjct  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG  740

Query  741  TTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCAC  814
            .|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct  741  CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC  814

Query  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888

Query  889  TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG-------  955
            ||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  889  TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGCCCC  962

Query  956  --------------------CAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGG  1009
                                |||||||||||..||.||||..||.|.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  TCGCCCATCCTTCTTCTCTCCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGG  1036

Query 1010  CCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGA  1083
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1037  CCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGG  1110

Query 1084  GCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCC  1157
            ||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1111  GCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCC  1184

Query 1158  TGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACC  1231
            |||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 1185  TGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACC  1258

Query 1232  CCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TT  1303
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.||  ||||.|.||.| .|
Sbjct 1259  CCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCT  1330

Query 1304  CCA-------AGGC----TGGAGCAGCTAACACCCTCAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCACACCCCCAGG  1366
            |||       ||||    .|||.||||     ||||||.|||            .||.|..||..|.|||||| 
Sbjct 1331  CCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGC-----CCCTCACCCC------------CACCGGGTCGGATCCCCAG-  1386

Query 1367  ATTACACAGTGGAGAATCT-------CATCCG--------CATGGGCATAGCTGGCTTGG---------TCCTG  1416
                   |||||    |||       ||.|.|        .||.|||||      |||||         ||||.
Sbjct 1387  -------AGTGG----TCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCAT------CTTGGTGGCCGTCATCCTA  1443

Query 1417  GTGGTCCTC-----------------------------------------GGG---ATTCT-------------  1433
            .||.|||||                                         |||   |..||             
Sbjct 1444  CTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCA  1517

Query 1434  -------GCT-ATTT-------------GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTC--------  1467
                   ||| ||||             |.||||       |||    |||||.|||||  ||||.        
Sbjct 1518  GAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAG  1589

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1590  GTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGG  1663

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1664  TGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCC  1737

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1738  AGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGC  1811

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1812  GGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGC  1885

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1886  ACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGC  1959

Query 1468  ------------------------  1467
                                    
Sbjct 1960  ATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1983