Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476912
• Subject: XR_935716.2
• Aligned Length: 1770
• Identities: 1195
• Gaps: 461

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TCTTCCCTATTTCCCTGCATTTCTCTTCTGTGCTCACTGCCACACGCAGCTCAGCCTGGGCGGCACAGCCAGAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCGAGATGCGTCTCTGCTGATCTGAGTCTGCCTGCAGCATGGACCTGGGTCTTCCCTGAAGCATCTCCAGGGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGAGGGACGACTGCCATGATGACAGCACCCCATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTG  222

Query    1  -----------------------------------------------------------------ATGACCCCC  9
                                                                             |||||||||
Sbjct  223  TCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCC  296

Query   10  ATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGACCCTCCCCAA  83
            |||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct  297  ATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAA  370

Query   84  GCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGATCC  157
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||..||
Sbjct  371  GCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCC  444

Query  158  TGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGATT  231
            .|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  AGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTT  518

Query  232  GTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTTCTACGGTAG  305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  519  GTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAG  592

Query  306  CCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCC  379
            |.|||||||||||.|.||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCC  666

Query  380  TCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAGGTGGCATTT  453
            |||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTT  740

Query  454  GGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCGTACCCATGG  527
            |...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||.|||
Sbjct  741  GATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGG  814

Query  528  GTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATG  601
            ||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATG  888

Query  602  ACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAG  675
            ||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAG  962

Query  676  CCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTTTCTGATGT  749
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||..|||||||.
Sbjct  963  CCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGC  1036

Query  750  CAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCACAGCCCCAGG  823
            ..|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGG  1110

Query  824  CTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTCCGGT  897
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1111  CTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGT  1184

Query  898  GCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCCGTGG  971
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1185  GCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAG-------------  1245

Query  972  CAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCAT  1045
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1246  ----------------------CCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCAC  1297

Query 1046  GGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACAC  1119
            .|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||||||...||
Sbjct 1298  AGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTAC  1371

Query 1120  GAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTA  1193
            .|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 1372  CAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTA  1445

Query 1194  CGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAG  1267
            ||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..
Sbjct 1446  CGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGT  1519

Query 1268  CTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCAAGGCTGGAGCAGCTAACACCCT------CAGCC  1333
            |||.|..||.|||| ||.|.||  ||||.|.||.| .||||...||||           ||||      |||||
Sbjct 1520  CTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGG-----------CCCTGAGGACCAGCC  1580

Query 1334  CATCACAAAACAAGACTGCCTCAC--------ACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGCA  1399
            |.||||            ||.|||        |.||||||        ||||                      
Sbjct 1581  CCTCAC------------CCCCACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTG----------------------  1612

Query 1400  TAGCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCTC  1467
                                                                                
Sbjct 1613  --------------------------------------------------------------------  1612