Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476937
• Subject: NM_001077701.3
• Aligned Length: 1538
• Identities: 1094
• Gaps: 430

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAGCCATCTGTTGAATCTTCAAGTCCAGGAGGTTCAGCAACATCAGATGACCATGAATTTGATCCATC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGCTGACATGCTGGTTCATGATTTTGATGATGAACGAACATTAGAAGAGGAAGAAATGATGGAAGGAGAAACAA  148

Query    1  -----------------------------------------ATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGT  33
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTTCAGCTCTGAAATAGAAGATCTTGCAAGGGAAGGCGACATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGT  222

Query   34  TATGGTAGTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGA  107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGGTAGTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGA  296

Query  108  AGATGCTGATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAAATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTC  181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATGCTGATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAAATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTC  370

Query  182  AGGAGGATGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAATCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATC  255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGGATGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAATCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATC  444

Query  256  CGCCCACGTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGTAGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATAT  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCCCACGTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGTAGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATAT  518

Query  330  TCCATCAGAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCATGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTA  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCATCAGAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCATGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTA  592

Query  404  GATACAAAGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAGCTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGAT  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GATACAAAGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAGCTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGAT  666

Query  478  AAAGTGATTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGGTGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGG  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTGATTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGGTGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGG  740

Query  552  ATCTCACATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGGTTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGA  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTCACATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGGTTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGA  814

Query  626  GAAGATTAAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTATCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTT  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGATTAAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTATCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTT  888

Query  700  GAACAAGGGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGATTCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGG  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAACAAGGGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGATTCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGG  962

Query  774  TGAATGTGTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAACGTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTG  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAATGTGTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAACGTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTG  1036

Query  848  GAAAGAAGAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTACATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCT  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAAAGAAGAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTACATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCT  1110

Query  922  GCATCTAGTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAACAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGG  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCATCTAGTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAACAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGG  1184

Query  996  CACTGTAAGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATGGACCAGG------------CA------------  1045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||            
Sbjct 1185  CACTGTAAGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATGGACCAGGTGAAATATTAAACAAAGAGGAAGTAA  1258

Query 1046  ------------TACTCCA--AATG--------------------------CTTCTTCCAGTTCAT--------  1071
                        ||| .||  ||||                          ||||.|.|||.| ||        
Sbjct 1259  AAGTTGAAGGGTTAC-ACATTAATGGACCAACAGGTGGAAATAAGAAACCACTTCATGCAGAT-ATGGATACTA  1330

Query 1072  ----TTTTCA-------------------------------GCC---ATCAGTTCAAGA---GCCAATGCCTTT  1104
                ||.|.|                               |||   ||.|.|.|||||   |..||||..|||
Sbjct 1331  ATGGTTATGAAACAGATAACCTTACCACTGACCCAAAACTTGCCCATATGACTGCAAGAAATGAAAATGATTTT  1404

Query 1105  --TTAAAA------------------------------------------------------------------  1110
              |.||||                                                                  
Sbjct 1405  GATGAAAAAAGTGAGAGACCTGCCAAAAGGCGAAGGGTAAACAGCAATGGAAAAGAAAGTCCAGGTTCTTCTGA  1478

Query 1111  ----------------------------------------------------------  1110
                                                                      
Sbjct 1479  ATTTTTCCAAGAAGCAGTCTCACATGGGAAATTTGAAGAACTTGAAAACACAGATGAC  1536