Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476974
• Subject: NM_175007.2
• Aligned Length: 2127
• Identities: 1761
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAAAACGTGCAAAAGCGCCTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74

Query   75  CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG  148
            |||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CCAGAAGCTGGGGAAGGCTGACGAGACAAAAGATGAACAGTTTGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAGG  148

Query  149  AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  149  AGGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGGGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGTATGCAGGAGGCCTCA  222

Query  223  ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG  296
            |||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  223  ATGAAGCTCACTGAATCTCTACATGAAGTCTACGAGCCAGACTGGTATGGACGGGAAGATGTAAAGATGGTTGG  296

Query  297  TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT  370
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  TGAGAAGTGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAGCTAGTGGATGGCTCCTTGCTGACACTGGACACCT  370

Query  371  ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC  444
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  371  ACCTGGGCCAGTTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCTAAGCGCAGCAGGAAGCTTGTGGATTATGATAGTGCT  444

Query  445  CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT  518
            |||||.||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  445  CGCCATCACCTGGAGGCTCTGCAGAGTTCCAAACGGAAAGATGAGAGTCGGATCTCTAAGGCAGAAGAGGAGTT  518

Query  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTCAATGTTGACTTACAAGAAGAGTTGCCGTCATTGTGGTCAAGTC  592

Query  593  GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG  666
            |||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  593  GAGTTGGCTTTTACGTCAATACTTTCAAAAATGTCTCCAGCCTTGAGGCCAAGTTTCATAAGGAAATCGCAGTG  666

Query  667  CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG  740
            |||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  667  CTTTGCCACAAGCTCTATGAAGTGATGACGAAACTCGGTGATCAGCATGCTGACAAGGCCTTCAGCATTCAAGG  740

Query  741  AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA  814
            |||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  741  AGCTCCCAGTGACTCGGGTCCTCTTCGCATTGCAAAGACACCATCACCTCCAGAGGAGCCTTCTCCCCTGCCCA  814

Query  815  GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG  888
            ||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||..||.||..|.||||||||||||
Sbjct  815  GCCCCACGGCTAGTCCCAACCACACATTAGCACCTGCATCTCCTGCCCCAGTGCGACCCAGATCACCTTCACAG  888

Query  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTGCCTAAAGTCACCCCAACAAAGGAACTGAAACAGGAGAACATCAT  962

Query  963  CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA  1036
            ||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||...|||||||
Sbjct  963  CAATTTCTTTGAGGACAACTTTGTACCAGAAATCAATGTGACAACACCTTCCCAGAACGAAGTCTTGGAGGTGA  1036

Query 1037  AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA  1110
            ||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||||.|
Sbjct 1037  AGAAGGAAGAGACTTTGCTGGATTTGGACTTTGACCCTTTCAAGCCCGATGTGGCTCCGGCAGGTTCTGCTGCA  1110

Query 1111  GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAGCCGGC  1184
            |.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111  GCGACCCACTCTCCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACTTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAACCAGC  1184

Query 1185  TTCTGGTGGTTCATTTAATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTA  1258
            ||||||.|||||||||||||..|||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||.||
Sbjct 1185  TTCTGGGGGTTCATTTAATGATTTCACCCAGGCCCAGGACACTTCATTATTCACCATGCAGACAGATCAGAATA  1258

Query 1259  TGATCTGCAACTTGGCTGAATCTGAACAGGCTCCACCCACAGAGCCAAAAGCAGAGGAGCCT-CTG-----GCT  1326
                        ||||||||.||||.|||||||.|||.||||||||..||||.||.|||||| |||     |||
Sbjct 1259  ------------TGGCTGAAACTGAGCAGGCTCTACCTACAGAGCCCCAAGCCGAAGAGCCTCCTGCCACTGCT  1320

Query 1327  GCTGTCACACCTGCCGTTGGTCTGGACCTTGGAATGGACACTCGGGCT-------GAGGAGCCAGTGGAGGAGG  1393
            ||||   |||||.|.|.|||.|||||||||             |||||       |||||||||..||||||||
Sbjct 1321  GCTG---CACCTACTGCTGGGCTGGACCTT-------------GGGCTAGAGATGGAGGAGCCAAAGGAGGAGG  1378

Query 1394  CAGTGATCATACCTGGAGCTGATGCTGATGC-AG-CTGTTGGAACCTTGGTGTCAG---CAGCTGAGGGGGCCC  1462
            |.||||||...||.|.|.|||||.|||  || || ||| |||||.||     .|||   ||.|||||||.||||
Sbjct 1379  CTGTGATCCCTCCCGCAACTGATACTG--GCGAGACTG-TGGAAACT-----GCAGTGCCAACTGAGGGTGCCC  1444

Query 1463  CAGGAGAGGAAGCAGAGGCGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATT  1536
            |.|..||||||||||||||.||||.|||..|..|||||||.||.|||||||.||||..|||||..|||||||||
Sbjct 1445  CGGTGGAGGAAGCAGAGGCAGAGAAGGCAGCCCTCCCTGCTGGAGAAGGAGGAAGTCCAGAGGGAGCCAAAATT  1518

Query 1537  GGAAC--TGAAACCACTGAGGGTG----CAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTG--  1602
            |  ||  .||||.|||.|||..||    |||.|||.||    |||.||.|||.|||||.||||||  ..|||  
Sbjct 1519  G--ACGGGGAAAGCACGGAGCTTGCAATCAGTGAGAGC----CCTCAACCAGTGGAGCCCGAAGC--GGGTGCT  1584

Query 1603  CCTCAGGAGAAGGTCATTCCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAAC---GA  1673
            ||||      |||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||..|||||||||.||   ||
Sbjct 1585  CCTC------AGGTCATCCCTTCTGTTGTCATTGAGCCAGCCTCCAACCATGAAGGAGAAGGAGAACACCAAGA  1652

Query 1674  AATAACTATAGGTGCAGAGCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGC----GAGACA  1743
            ||...|||..|||.|.||.||.|.||||.||.|.|||||.|.||||.|.|.||||    .||||    ||||..
Sbjct 1653  AACTGCTACGGGTACTGAACCGAGGGAGGCCGCTGAGGATGTGGCTGCCCAGGGC----TCAGCGGGTGAGAAG  1722

Query 1744  CCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCAC---GCCT---TCTGCACCAGCCATGGG  1811
            |.|||..|||||||.||||..|.||||   |.|||..|||||.|.||   ||||   ||||||         ||
Sbjct 1723  CAGGAAGTGGCTACAGAGCCCACGCCT---CTGGATTCTCAGGCAACTCTGCCTGCATCTGCA---------GG  1784

Query 1812  GGCT---GCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGG  1882
            .|||   |.||.|..|||   .||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785  TGCTGTGGATGCCTCGCT---GTCTGCAGGGGATGCCACTCAGGAACTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGG  1855

Query 1883  AAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTC  1956
            ||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1856  AAACCCTGCATGATTTCGAGGCAGCGAACTCTGATGAACTTAACCTACAAAGGGGTGACGTGGTACTCGTGGTG  1929

Query 1957  CCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAG  2030
            ||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1930  CCTTCAGACTCAGAAGCCGACCAGGATGCAGGCTGGTTGGTGGGGGTGAAGGAGTCAGACTGGCTTCAGTACAG  2003

Query 2031  AGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT  2085
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|.||.
Sbjct 2004  AGACCTGGCCACGTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACGCGGCGCCTGGAG  2058