Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476974
• Subject: XM_006715690.4
• Aligned Length: 2461
• Identities: 2025
• Gaps: 380

Alignment

Query    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74

Query   75  CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG  148

Query  149  AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC  222

Query  223  ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG  296

Query  297  TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT  370

Query  371  ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC  444

Query  445  CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT  518

Query  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC  592

Query  593  GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG  666

Query  667  CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG  740

Query  741  AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA  814

Query  815  GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG  888

Query  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT  962

Query  963  CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA  1036

Query 1037  AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA  1110

Query 1111  GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGAC------------AAG---------  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||         
Sbjct 1111  GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACTGACTCTTCAGAAAGTCTTTCCTT  1184

Query 1164  ------CACTGAT-TTGG-------TACAGCC--------GGC--------TTC-------------TGGT---  1191
                  | ||||| .|||       |.|||.|        |||        |||             ||.|   
Sbjct 1185  GTGTAAC-CTGATCATGGAGGAAACTCCAGACAGTGGGTTGGCCGAAGAAATTCAAAGATCTCAAAATGATATA  1257

Query 1192  GGTTCATTTAATGG--------------ATTCACACAG-----------------CCCCAGG------------  1222
            |||.||||||.|.|              .|.||.||||                 ||.||||            
Sbjct 1258  GGTGCATTTACTTGGGGCCCTGACGCTAGTACAGACAGGGTCAGCCAAGAAGTTACCTCAGGTGGGTTTGGAGA  1331

Query 1223  ATACT-------TC-------------------------ATTATTCACAA-------------TGCAGACAGAC  1251
            |.|||       ||                         |||||.|||.|             |||.|||.|.|
Sbjct 1332  AGACTCTGCATGTCCCTCCGAAACAGAGCAAGACATAAGATTATCCACCAGCCTGCTTTCGTCTGCTGACTGGC  1405

Query 1252  C------------AGAGTATGATC-TGCAACTTGGC-------------TGAATCTGAACAGGCTCCACCCA--  1297
            |            ||||..|||.| |||..|..|||             ||.|..|||||| .||.|.||||  
Sbjct 1406  CCACTGTAGCTGAAGAGAGTGAGCATGCCCCGGGGCCAGCCTTTCCAGGTGGAAATGAACA-ACTGCCCCCAAA  1478

Query 1298  --CAGAGCCAAAAGC-AGAGGAGCCTCTG-------------------GCTGCTG---------------TCAC  1334
              |.|.|||..|.|| .|||..|||..||                   ||.||||               |||.
Sbjct 1479  GCCTGCGCCGGAGGCTGGAGTTGCCATTGCTGCTTGTGTGGAGATGGAGCAGCTGTATGACCCACTTGACTCAG  1552

Query 1335  ACCTGCC-------------GTTGGTCTG---------------------------------------------  1350
            ||.||||             |.|||.|||                                             
Sbjct 1553  ACATGCCAGCCATGGACACAGCTGGCCTGTTCAAAGAAAGTCATGAAGATATGAAGAAGTCAGATGAAGAGGAA  1626

Query 1351  --------GACCTTGGAATGGACACTC---GGGC---TGAGGAGCC----------------------------  1382
                    ||...|||||  ||..|||   ||||   ||.||||.|                            
Sbjct 1627  GAGAAACAGAAGATGGAA--GATTCTCTGTGGGCAGGTGTGGAGGCGTGTCAAAAGGCTTCTGGTGGTTCATTT  1698

Query 1383  AGTGGA-----------------------------------GGAGGCAG---------------------TGAT  1400
            |.||||                                   |.||.|||                     ||||
Sbjct 1699  AATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTATGATCTGCAACTTGAT  1772

Query 1401  CATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAG  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  CATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAG  1846

Query 1475  CAGAGGCGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAACTGAAACC  1548
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  CAGAGGCGGAGAAGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAACTGAAACC  1920

Query 1549  ACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAGGTCATTCC  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  ACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAGGTCATTCC  1994

Query 1623  TTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGCAGAGCCCA  1696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  TTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGCAGAGCCCA  2068

Query 1697  AGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCT  1770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  AGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCT  2142

Query 1771  ATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGC  1844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143  ATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGC  2216

Query 1845  CTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATG  1918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217  CTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATG  2290

Query 1919  AACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGG  1992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291  AACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGG  2364

Query 1993  CTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAA  2066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365  CTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAA  2438

Query 2067  CTTCACCCGACGCTTAGAT  2085
            |||||||||||||||||||
Sbjct 2439  CTTCACCCGACGCTTAGAT  2457